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  VS Code拡張機能を追加してCloudFormation開発環境をレベルアップする | DevelopersIO

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  • 2021/10/08

  データアナリティクス事業本部コンサルティンググループのnkhrです。 このブログでは、CloudFormation開発で利用できるVS Code拡張機能の設定について紹介します。今回実施した環境のバージョンは、下記の通りです。 Windows 10 VS CodeのVersion 1.60.2 PythonのVersion 3.9.7 ※バージョンが違うとGUIの設定画面や、設定パラメータ名など異なる場合があるため、設定時は注意してください。 このブログでは、下記の拡張機能の設定について説明しています。 vscode-cfn-lint：テンプレートを解析しバリデーションを実施 indent-rainbow：インデントをカラー表示（yaml形式で作成する場合は重宝しそう） CloudFormation support for Visual Studio Code：補完機能や公式ドキュメントの

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  【GROMACS】GROMACSを用いたタンパク質-低分子リガンドのMD simulation【in silico創薬】【前編】 - LabCode

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  • 2023/10/01

  MD シミュレーションとは？MDシミュレーションは、分子の動きや相互作用を計算機上で再現する手法です。分子の構造と相互作用を記述する力場（potential function）を使用し、時間の経過とともに分子の運動を予測します。これにより、物質の性質や相互作用の理解、材料設計、生体分子の研究などに応用されます。 GROMACSは、MDシミュレーションを実行するためのソフトウェアの一つです。GROMACSは高性能な計算を行うための最適化が施されており、広く使われている信頼性の高いツールです。GROMACSを使うことで、分子のダイナミクスや相互作用をシミュレーションすることができます。 この記事では実際にGROMACSを使って、自分のパソコンでタンパク質（T4リゾチームL99A/M102Q）とリガンド(2-プロピルフェノール)の複合体のMDシミュレーションをを行なっていきます。 GROMACS