【GROMACS】Umbrella samplingによるMD simulation 【In silico創薬】【SMD】 - LabCode
Windows 11 Home, 13th Gen Intel(R) Core(TM) i7-13700, 64 ビット オペレーティング システム、x64 ベース プロセッサ, メモリ：32GB Umbrella Samplingの概要と目的Umbrella Samplingは、分子がめったに起こさないような状態変化（たとえば、タンパク質同士が離れるなど）を詳しく調べるための計算手法です。通常の分子動力学（MD）では、エネルギー的に安定な状態にとどまりやすく、重要な変化が起こる確率が低いため、十分な情報が得られません。 たとえば、タンパク質AとBがくっついている状態から、少しずつ離れていく様子を観察したいとき、まずAとBを少しずつ引き離すSteered Molecular Dynamics（SMD）などのシミュレーションで、さまざまな距離の構造を取得します。その中から、0.5nm、0.7
LLM推論を支える抽象化転送ライブラリ NVIDIA Inference Xfer Library (NIXL) について - NTT docomo Business Engineers' Blog
こんにちは、イノベーションセンターの鈴ヶ嶺です。 本記事では、NVIDIA Dynamo や vLLM などの LLM 推論フレームワーク向けに設計された高速・低遅延の抽象化転送ライブラリである NVIDIA Inference Xfer Library (NIXL) について解説します。 また、NVIDIA Dynamo に関してはこちらで解説していますので参考にしていただけると幸いです。 engineers.ntt.com まず、LLM 推論高速化(KV Cache)におけるメモリ転送の背景と課題をご紹介し、それを解決する NIXL の概要を説明します。 NIXL は Plugin により任意の転送方式を実装可能なアーキテクチャとなっています。実際に Custom Plugin を実装する方法についても紹介します。 背景と課題 NVIDIA Inference Xfer Library
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[アップデート]Amazon InspectorのLambdaコードスキャンが生成AIを活用して修復コードを提示してくれるようになりました #AWSreInvent | DevelopersIO
こんにちは、AWS事業本部@福岡オフィスのべこみん(@beco_minn)です。 遂にAWS re:Invent 2023が始まりましたね。それに合わせてたくさんのアップデートが出てきました。 本記事ではそのうちの一つ、「生成AIを利用した、Amazon InspectorによるAWS Lambdaコードスキャン結果への修正アドバイス」についてご紹介します。 最初にまとめ InspectorでLambdaコードスキャンをした結果の「推奨される修復」にコードの修正方針、もしくは修正方針を盛り込んだ新たなコードが表示されるようになりました。 すべてのコード修復に対応しているわけではなさそう。 修正後コードが表示される場合、「推奨される修復」の項目名が「Suggested remediation: Showing x/x fixes」のようになる。 何が嬉しいのか？ 皆さんはInspectorで
![[アップデート]Amazon InspectorのLambdaコードスキャンが生成AIを活用して修復コードを提示してくれるようになりました #AWSreInvent | DevelopersIO](https://cdn-ak-scissors.b.st-hatena.com/image/square/f099104aaa09df58f234f4f90b04b2f5cefbb675/height=288;version=1;width=512/https%3A%2F%2Fdevio2023-media.developers.io%2Fwp-content%2Fuploads%2F2023%2F11%2Feyecatch_reinvent-2023-newservice-update.png)
Node.js
Notable Changes Experimental command-line argument parser API Adds util.parseArgs helper for higher level command-line argument parsing. Contributed by Benjamin Coe, John Gee, Darcy Clarke, Joe Sepi, Kevin Gibbons, Aaron Casanova, Jessica Nahulan, and Jordan Harband - #42675 Experimental ESM Loader Hooks API Node.js ESM Loader hooks now support multiple custom loaders, and composition is achieved
背景 AVCHD 内の.MTS ファイルを mp4 に一括変換したかったのですが、フリーソフトにろくなもんがないため、chatGPT に教えてもらいながら python でそれを実行できるコードを書きました ffmpeg(v6)を使用しているので、ffmpeg が対応してるコーデックならなんでも変換できるはず(未検証) 簡単な機能説明 ・指定ディレクトリ内の.MTS ファイルを.mp4 に変換して別の指定ディレクトリに置く ・その際ファイル名は動画ファイルの撮影日時を使用(2023-07-25-14-32.mp4 みたいな) ・コマンドラインで簡単めに実行できるといい 前提 Mac で動くことを確認してます(一応 windows でも動くはず) python のバージョンは3.11.4です セットアップ 任意の場所にmp4-converter.pyを作成する 下記のコードを貼り付け後保存
MCPサーバとクライアントのstdio transportは何をしている？ MCPサーバのPythonスクリプトに一連のJSONを送ってツール一覧を得るまで - nikkie-ftnextの日記
はじめに 七尾百合子さん、お誕生日 17日目 おめでとうございます！ nikkieです。 久しぶりのMCPの話題です。 目次 はじめに 目次 MCPサーバは一体何をやっている？ 結論：stdio transportを覗き見 今の理解：MCPサーバにはクライアントからJSONが送られる 終わりに MCPサーバは一体何をやっている？ Quickstartに沿ってお天気のMCPサーバを作りました。 modelcontextprotocol.io 作る中で試しに、MCPサーバのスクリプトをPython処理系で実行してみたのですが、何も起こりません。 % uv run weather.py # Ctrl+C連打で抜けます しかしMCPクライアントにMCPサーバのスクリプトを渡すと動きます。 % uv run client.py ../weather/weather.py 一体何をやっているのでしょう
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複数の.MTSファイルを.MOVや.MP4に一括で変換する - Qiita