世界で初めてのヘモグロビン・サーモダイナミックス の索引 - wishikawaのブログ
世界で初めてのヘモグロビン・サーモダイナミックス (1) 胎児のへモグロビン https://wishikawa.hatenablog.com/entry/2023/08/07/000000 世界で初めてのヘモグロビン・サーモダイナミックス (2) 負のヘテロピックエフェクター https://wishikawa.hatenablog.com/entry/2023/08/14/000000 世界で初めてのヘモグロビン・サーモダイナミックス (3) 大人のヘモグロビン デオキシヘモグロビンA https://wishikawa.hatenablog.com/entry/2023/08/21/000000 世界で初めてのヘモグロビン・サーモダイナミックス (4) 分配係数の対数 logP https://wishikawa.hatenablog.com/entry/2023/08/28/0
The first thermodynamics in the world with regard to hemoglobin (12) - wishikawaのブログ
conformation In contrast to the molecule's costitution and the configuration that forms molecule, conformation represents the three-dimensional position of atoms and groups of atoms in a molecule. Many molecules are uniquely identified by their constitution and configuration. Normally, an unambiguously identified molecule has a plurality of conformation. Even if the molecule is unambiguously ident
世界で初めてのヘモグロビン・サーモダイナミックス(11) - wishikawaのブログ
ヘモグロビンの協同性 ヘモグロビンの協同性とは、 4個のヘム機構を持つデオキシヘモグロビン1分子に、 1分子の酸素分子が配位すると次の酸素分子の配位する反応速度が加速され、 4分子の酸素分子が配位するまで反応速度の加速が連鎖すること、 及び、オキシヘモグロビン1分子から、 1分子の酸素分子が解離すると次の酸素分子の解離する反応速度が加速され、 4分子の酸素分子が解離するまで反応速度の加速が連鎖することです。 興味深いヘモグロビンの協同性については、 多大な経費と時間とをかけて様々な研究がなされた。 ポリフィリン環の平面性と非平面性との間で生ずるコンフォメーション変化が、 情報伝達機構になるとする説があります。 また、協奏的全て又は無の対称性保存モデル等が提唱されています。 ギブスエネルギー値は状態量であるから、 始めの状態と終わりの状態とを定めると経路によらず一定になります。 それでもヘモ
The first thermodynamics in the world with regard to hemoglobin (5). - wishikawaのブログ
A rewrite of "The first thermodynamics in the world with regard to hemoglobin (5)." The transfer of oxygen molecules from (2)oxyhemoglobinA to (3)deoxyhomoglobinF. A means Adult including mother and F means Fetus. I'll explain that the transfer of oxygen molecules from mother to fetus is a spontaneous process. The pH value of human blood is 6.8～7.8, the pKa value of (4)deoxyhomoglobinA is 8.2, th
世界で初めてのヘモグロビン・サーモダイナミックス (5) - wishikawaのブログ
(2)オキシヘモグロビンAから(3)デオキシヘモグロビンFへの酸素分子の移動 Aはお母さんを含む大人（Adult）を意味し、Fは胎児（Fetus）を意味します。 お母さんから胎児への酸素分子の移動が自発過程であることについて説明します。 人の血液のpHは6.8～7.8、 (4)デオキシヘモグロビンAのpKaは8.2、 (2)オキシヘモグロビンAのpKaは6.96、 (1)logP₀と(2)logP₀または(3)logP₀と(4)logP₀は近似するものと想定します。 お母さんから胎児に酸素分子が移動する際、 (2)オキシヘモグロビンAと(3)デオキシヘモグロビンFとから (4)デオキシヘモグロビンAと(1)オキシヘモグロビンFとを生じます。 そして、その酸素分子が移動する際に生ずるギブスエネルギー変化(⊿G)の総和(ΔrG₀total )が負の値になることを説明します。 ⊿G=ーRTlnP
The first thermodynamics in the world with regard to hemoglobin (6). - wishikawaのブログ
The pH of human blood is 6.8～7.8, the pKa of (4)deoxyhomoglobinA is 8.2, the pKa of (2)oxyhomoglobinA is 6.96, it assumed that(1)logP₀ and (2)logP₀ or (3)logP₀ and (4)logP₀ are approximately the same value. The yellow region in fig-5 The yellow region in fig-5 is the region of 6.8≦pH≦7.8. and the region of ΔrG₀total = ー2.3RT[｛(3) logPー(1)logP ｝＋｛(2) logPー(4)logP ｝] = 2.3RT［｛(1) logPー(3)logP ｝＋｛(4)
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