Bioinformatics/Genomics Pipeline Workflows: Step II Analysis: Data Quality Control and Cleaning using GATK and SAMtools Workflows Overview This page contains a description of the second stage of the genomics data analysis protocol designed and implemented by Federica Torri, Fabio Macciardi and IvoDinov to process large number of sequence data outputted by the Illumina sequencing pipeline. See th
Below is the current GoNL pipeline commands along with rough execution times when available on the cluster as of January 25th 2011: This analysis pipeline consists of two parts. The first one is based on lane analysis. Afterwards lanes are merged and analysis per lane is conducted. Lane analysis L1. Fastq to check read quality /tools/FastQC/fastqc /data/filename_1.fq.gz \ -Dfastqc.output_dir=/outp
美人すぎるアイドル矢島舞美さん画像スレ14 http://anago.2ch.net/test/read.cgi/morningcoffee/1324161230/ 346 :名無し募集中。。。:2011/12/27(火) 10:05:52.51 O 348 :名無し募集中。。。:2011/12/27(火) 12:06:35.16 0 363 :名無し募集中。。。:2011/12/27(火) 19:31:29.13 0 どう見ても美少女 351 :名無し募集中。。。:2011/12/27(火) 12:46:19.51 0 353 :名無し募集中。。。:2011/12/27(火) 12:57:33.54 0 355 :名無し募集中。。。:2011/12/27(火) 15:08:15.52 O 顔のアップが好き 356 :名無し募集中。。。:2011/12/27(火) 16:06:51.69
若槻先生から紹介を受けたAndrej SaliらのNature論文「Determining the architectures of macromolecular assemblies」(2007)に感銘を受けました。456個のタンパク質からなるNPC (Nulear Pore Complex:核孔複合体)をどう決めるかという大きな問題に挑戦しています。 NPCは、約125MDaもある巨大タンパク質複合体。核孔複合体を構成するタンパク質群をヌクレオポリン(nucleoporin) といいますが、その構造を決めるためににはどうしたらいいのか? 5〜10年前までは、ひとつのタンパク質の構造を決めるのさえ非常に難しかった時代を超え、現在では膜タンパク質や2分子の複合体でも比較的にそれらの構造が決められやすくなってきています。 それでも、A. Sali達の問題は、456個もあるタンパク質複合体の構
完全に時機を逸していますが,最近の若者がLaTeXで卒論または修論を書くべきたった1つの理由を示したいと思います.博論が対象になってないのは,LaTeXで書くことが当然に期待されるからです. 最近の卒論/修論生はメール世代である まず大前提の知識を合わせる必要があります.ご存じの方も多いと思いますが,最近の卒論/修論生はメール世代です.特に,携帯メール世代です.これをデジタルネイティブと呼ぶのかどうなのかはわかりませんが,少なくとも,我々の世代とはちょっと違います.これ自体が良いとか悪いとか,そういうことを論じたいわけではなく,そういう世代が卒論/修論を書くくらいまで成長してきましたという事実です.さて,そんな彼ら世代は携帯メールを主に書いて育ってきました.携帯メールに限りませんが,電子メールには以下の特徴があるのではないかと思います. 一切改行を行わない1つの文で構成される あるまとまり
サービス終了のお知らせ NAVERまとめは2020年9月30日をもちましてサービス終了いたしました。 約11年間、NAVERまとめをご利用・ご愛顧いただき誠にありがとうございました。
「傷つかない技術」を体験した授業 というブログ記事を読み、深く共感した。 詳しくはリンク先を読んで欲しいが、かいつまむと・・ アメリカの大学でアート&ビジネスというクラスを取っていた際、 「はい。みんな課題持って来ましたか?では、机の上に出して、紙の人はそのまま破り捨てなさい。立体物の人は壊してゴミ箱へ捨てなさい。」 と先生に言われた。 曰く、「プロのデザイナーを目指しているなら、一生懸命作ったアイデアや作品を見ることもなく破り捨てられる経験をこれからたくさんする。それに耐えられなければ、プロのデザイナーにはならない方が良い」 僕の職業はデザイナーではなく、コンサルタント(≒プロジェクトの成功請負人)なのだが、同じようなことは毎日のようにある。自分が深夜までかけて作った打ち合わせ資料が、翌日の打ち合わせ本番では全く別な資料に差し変わっていたとか、「天に唾はく様なプレゼンだ」と切り捨てられた
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