ゲノム解析ツール リンク集 - Category
ゲノム解析ツール リンク集 - Category NBDC - アーカイブトップ - ヘルプ データベースの説明 | データ項目の説明 | ダウンロード | 利用許諾 | ヘルプ Category || Tool | How-to | Review || Keyword 分子生物学に関わるデータ解析ツールの提供サイトへのリンクと簡単な解説を提供します。 カテゴリ すべて展開する すべて閉じる Dataset File size CSV JSON RDF (Turtle) RDF (XML) FASTA default 196 Bytes 205 Bytes 338 Bytes 420 Bytes Please select records to copy to clipboard. Copy selected records to clipboard. Are you sure?
生物情報工学 講義
生物情報工学 講義資料 農学部 生命化学・生命工学専修 清水謙多郎 担当 実習資料１ データベースの検索からタンパク質のグラフィックス表示まで 実習資料２ ゲノムネット 実習資料３ GeneScan 実習資料４ モチーフ検索 実習資料５ 分子動力学法と構造ゲノム科学 本講義では、生命工学へのコンピュータの応用について、基礎となる概念、 手法を講義する。まず、計算化学（computational chemistry）の入門として、 分子モデリングと分子グラフィックス、エネルギー最小化計算、分子シミュレーション、 分子軌道法などを論じる。 次に、生命情報科学（バイオインフォマティクス, bioinformatics）の分野について、 データベースに蓄積された情報に基づくホモロジー解析の基礎的な手法から、 そうした情報をさらに広範に利用した生体分子の構造予測、 機能解析に関する研究まで、幅広く紹
DISOPRED - メモ
Disorder領域予測のためのツール。CASPで1番の成績。 インストール 1.NCBI toolkitをインストール ftp://ftp.ncbi.nih.gov/toolbox/ncbi_tools/ncbi.tar.gz をからファイルをダウンロード。 tar zxfv ncbi.tar.gz で解凍。 ./ncbi/make/makedis.csh 2>&1 | tee out.makedis.txt でインストール。 .bashrc に以下を書き込み BLASTDB=/usr/local/program/ncbi/data(インストールしたディレクトリに応じて変更） export BLASTDB HOMEに.ncbircを作成してdataフォルダの位置を指定する以下の内容を記入。 [ncbi] Data=/usr/local/program/NCBItoolkit
はてなグループの終了日を2020年1月31日(金)に決定しました - はてなの告知
はてなグループの終了日を2020年1月31日(金)に決定しました 以下のエントリの通り、今年末を目処にはてなグループを終了予定である旨をお知らせしておりました。 2019年末を目処に、はてなグループの提供を終了する予定です - はてなグループ日記 このたび、正式に終了日を決定いたしましたので、以下の通りご確認ください。 終了日: 2020年1月31日(金) エクスポート希望申請期限:2020年1月31日(金) 終了日以降は、はてなグループの閲覧および投稿は行えません。日記のエクスポートが必要な方は以下の記事にしたがって手続きをしてください。 はてなグループに投稿された日記データのエクスポートについて - はてなグループ日記 ご利用のみなさまにはご迷惑をおかけいたしますが、どうぞよろしくお願いいたします。 2020-06-25 追記 はてなグループ日記のエクスポートデータは2020年2月28
共立出版株式会社 新刊・近刊2007年2月『バイオインフォマティクスの数理とアルゴリズム（アルゴリズム・サイエンスシリーズ 12【適用事例編】）』
（アルゴリズム・サイエンスシリーズ 12） 【適用事例編】 バイオインフォマティクスの数理とアルゴリズム （ISBN978-4-320-12178-2） 阿久津達也 著 A5，238頁，3000円 ●内容 バイオインフォマティクス（bioinformatics）は生命情報学などと訳されるが，その名のとおり生物学と情報学の学際領域の学問分野であり，DNA配列をはじめとするさまざまな生物学データの情報解析技術の開発，および，それらの情報解析技術を利用して実際のデータを解析し新たな生物学的知識の発見を行なうことの２つが主目的となっている．名前の起源はよくわからないが，ヒトのDNA配列を決定しようというヒトゲノム計画が本格化した1990年代初めごろから目にするようになり，現在では学問分野のひとつとして，ある程度は認知されるに至っている．計算生物学（computational biol
文部科学省 ターゲットタンパク研究プログラム
アミノ酸配列のスタンダードなマルチプルアラインメントを作ってくれるサイト．入力データの（総残基数）が５万に制限されている．出力はシンプルなテキスト形式
BioPerlHowToUseTmp - BUGJA - Bioperl Users Group in Japan
めためたに書きかえ中。。。（'05-09-28-Wed.） 旧コンテンツから、こちらにうつしました。使いやすく、内容をばらけさせる予定です。（'06-3-9-Thu.） contents † 前提知識 † Perlが使えること 文字列・数値（$string）、配列*1*2（@array）、ハッシュ*3（%hash）がイメージできる Perl はご丁寧に記号[$,@,%]がついているので、この記号でどんなものかイメージできるのがよい 括弧を見て、各々、どの括弧が上記のどれに対応するかは知っておいた方がいい。 サブルーチンは一応、わかった方がいい気はするが、あまり気にしてはいけない。 サブルーチンは（普通は）自分でつくったものだが、普通の関数（printとか）と区別して使う必要性はさらさらない（いちいち関数に&をつけて呼ばなくてもいい） モジュールを扱っていることを理解すること モジュールは、
NGS Surfer's Wiki | HomePage
HomePage TikiWikiのバージョンアップ 【2012.2.29】 NGS Sufer's Wikiで使用しているTikiWikiのバージョンをv5.4からv8.3にアップしました。このバージョンアップにより、セキュリティがより強化されスパム等の不正書き込みをできる限り遮断する設定にしています。 サイト内検索 by googleカスタム検索 メインコンテンツ 初めての方へ シーケンサーの一般論 次世代シーケンサーの概要 DNAマイクロアレイと次世代シーケンサーの比較 シーケンサープラットフォーム(機種)の違い アプリケーションリスト アセンブル (de novoアセンブリ, トランスクリプトームアセンブリ, メタゲノム) トランスクリプトーム解析 (発現解析、スプライシングバリアント解析、ncRNA・smallRNA解析) リシーケンシング解析 (WGS, exome, CNV,
BioVenn - a web application for the comparison and visualization of biological lists using area-proportional Venn diagrams
Having difficulties viewing your BioVenn diagram in SVG? Download the free Ssrc SVG Plugin (Internet Explorer) or the free Adobe SVG Viewer (other browsers). Please note: 1) BioVenn is case-sensitive. 2) In SVG mode, text and numbers can be dragged and dropped. BioVenn is now available as an R package as well, see CRAN When publishing figures from BioVenn, please cite this publication: BioVenn - a
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Prediction and Functional Analysis of Native Disorder in Proteins from the Three Kingdoms of Life - ScienceDirect
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共立出版株式会社 新刊・近刊12月『分子生物学のためのバイオインフォマティクス入門』
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