wgetとemacsでftpつないでデータを取得 - kozo-niのはてなダイアリー
今日KEGGからデータを取得する際に emacsでftpつないで情報取得 pythonで処理してwgetのinput作成 wgetのiオプションでさっきのを食わせる ということをした。 まずemacs M-x ftp Ftp to Host: ftp://ftp.genome.jp/pub/kegg/genes/ こんな感じでftp探索できる。ここで得た３文字生物種名をpythonで処理して下記のようなwgetを作成した head wgetInputKeggEnzyme.dat ftp://ftp.genome.jp/pub/kegg/genes/organisms/aae/aae_enzyme.list ftp://ftp.genome.jp/pub/kegg/genes/organisms/aau/aau_enzyme.list ftp://ftp.genome.jp/pub/kegg
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