この記事が想定する読者層 もしあなたが「プログラマー」ならば、この記事はまるで不要かもしれません。 ここで言うプログラマーとは、たとえば以下のような習慣を持っている人です。 ほとんど同じ処理をソースコード中に2回以上書いていたら違和感を感じる 出力結果が変わらなくても、実行速度や理解しやすさのためにソースコードを書き直すことがある Gitなどのバージョン管理システムを使うことができ、過去のソースコードを「日付の含まれたファイル名でバージョンごとに別ファイルとして保存しておけばよい」とは考えない 動作テストを自動化し、ソースコードを書き換えてもそれぞれの関数の挙動が意図したものになっているかを確認できる この記事は、ひょんなことからRに出会い、コードをコピペで動かせるようになり、 「いつかコピペじゃないコードが書けるようになりたい」 「他のプログラミング言語もできるようになりたい」 とぼんや

この記事について この記事では、R言語で書かれたコードを、パッケージとして開発・管理するメリットとその方法について紹介しています。以下はあくまで概要であるため、詳細についてはぜひ今年2月にオライリージャパンから邦訳刊行された『Rパッケージ開発入門』 や、その原著のR packages（ウェブ版）、そして記事末尾のリファレンスをご参照下さい。 想定する読者層 業務・研究、あるいはプライベートでR言語を使いプログラムを書いている、またはこれから書く予定がある 他の人からもらったRのコード（または、他の人に渡したRのコード）がなぜかうまく動かなかった経験がある 以前書いたソースコードやファイルが散らばっており途方に暮れたことがある Rのパッケージ開発なにそれこわいと感じている 提案 次のような場合、分析タスクの運用や共有を楽にするため、Rのコードをパッケージ化しましょう。 その場限りの分析用では

今年の2月12日、とある書籍をご恵贈いただきました。原題 "Advanced R"の日本語版、『R言語徹底解説』。全20章、索引を含めると500ページを超える重厚な訳書です。 原著者のHadley Wickham氏は{ggplot2}や{dplyr}をはじめとするいくつもの強力な拡張ライブラリの作者であり、R言語に革命を起こしたと評されるなど、今やRユーザにとっては欠くことのできない存在となっています。 Advanced R (Chapman & Hall/CRC The R Series) 作者: Hadley Wickham 出版社/メーカー: Routledge メディア: ペーパーバック 参考価格: ￥6,774 この商品を含むブログを見る R言語徹底解説 作者: Hadley Wickham,石田基広,市川太祐,高柳慎一,福島真太朗 出版社/メーカー: 共立出版 発売日: 201

Happy Thanksgiving 2016 from is.R()! With so many versions of this lovely graphic floating around the interwebs, it’s time to bring back the original ggplot2() turkey. We hope everyone has a wonderful holiday! https://gist.github.com/cdesante/0ab7a6076c0cd0993cc0ae0eb3ecd2fc#file-turkey2016-r To plot them is my real test I almost couldn’t bring myself to post this, but it’s April Fools’ Day, so I’

Every once in while I have to write a function that contains a loop doing thousands or millions of calculations. To make sure that the function does not get stuck in an endless loop or just to fulfill the human need of control it is useful to monitor the progress. So  first I tried the following: ############################################################### total <- 10 for(i in 1:total){ print(i

Loading and Listing of Packagesから。 library(package) and require(package) both load the package with name package. require is designed for use inside other functions; it returns FALSE and gives a warning (rather than an error as library() does by default) if the package does not exist. 面白そうなので、試してみる。 まずはRでパッケージを作る準備。package.skeletonは便利 f <- function(x,y) x+y package.skeleton(list=c("f"), name="test

R Advent Calendar の参加記事です。 季節ものということで、そろそろ年賀状の作成というプレッシャーに圧されている方もいらっしゃるかと思います。 でも、年賀状作成ソフトの使い方を覚えるのって面倒ですよね！いつも使い慣れているRで年賀状が作れたらいいな、、、という方への記事です。 まずは、来年は辰年ですから、龍のイラストを用意しちゃいましょう。Rで龍のアウトラインをプロットすればよさそうですが、丁度良いものがありました。 The stanford 3D scanning library , 3Dスキャナーで実際のオブジェをスキャンした結果の座標データを集めて公開しているものです。データフォーマットはPLY というもので、何かパッケージもあるかもしれませんが、非常に単純なテキストファイルなので、細かいことを気にしなければ, scan()関数 で読み込めました。 上記サイトの龍の写

近似ベイズ計算 (ABC: Approximate Bayesian Computation) に基づいたパラメータ推定のできるパッケージabcを紹介します． ABCとはABCは，尤度関数の計算が不可能・困難なときに，尤度関数を求めることなく事後分布を推定できる手法です．比較的新しい手法で，集団遺伝学・生態学，疫学などさまざまな分野で応用と開発が進んでいます． ABCに関しては，kos59125 さんの以下のエントリなどがとても参考になります． 近似ベイズ計算によるベイズ推定 (slideshare) 近似ベイズ計算によるベイズ推定 (捨てられたブログ) パッケージabcパッケージabcは， 観察データから計算した要約統計量 (引数 target) 事前分布からサンプリングしたパラメータ (引数 param) それらをもとにシミュレートした要約統計量 (引数 sumstat) を与えると，