こんにちは、データ受託解析チームの tsuyuh です。 遺伝子の発現変動解析をしていると良く登場する Volcano Plot ですが、Excel や R で単に散布図を描くだけでは味気ないなと思ったことはありませんか? 今回は、簡単に格好いい Volcano Plot を描く方法をご紹介します。 以前の記事 (Seurat や Monocle のプロットの配色を調べる) に引き続き、"できるだけ作図にこだわりたい" シリーズです。 ↑ 最終的にこんな図を描きます。 作業環境 R v4.1.1 Rパッケージ EnhancedVolcano v1.12.0 Rパッケージ gridExtra v2.3 Rパッケージ grid v4.1.1 ↑ それぞれのドキュメントに従ってインストールしてください。 使用データ まず、遺伝子の二群間比較解析の結果を用意します。 今回は、ヒト肺線維芽細胞のRN
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