【質問】 私は会員ではありませんので, 質問可能かどうか分からないのですが, もしよろしければ教えてください。私は現在, 米国, イリノイ州のNorthWestern大学にて地下水の汚染に関する研究に携わっています。実は研究上, 地下水から分離された微生物の同定を行う必要が生じ, 16s rRNAの塩基配列を調べ, 汎用DNAデータベース (FASTA, BRAST) により, 相同性チェックを行いました。しかしながら得られた相同性のスコア (94%, 92%など) と同定精度との関係の判断基準が分からないのです。たとえば94%なら, 属レベルまで同じで, 98%なら種レベルまで同じである可能性が高い, というような目安はあるのでしょうか? また, そのような内容に関する適切な文献等ございましたら, ご紹介願えませんでしょうか。どうぞよろしくお願い申し上げます。 【回答】 このご質問への回
【質問】 初めてメールを致しました。私は臨床検査会社に勤めるものです。バクテリアの事を調べていて, ちょっと壁にぶつかりました。自力で調べてみたのですが, よく理解できないため質問させてください。 PCR法でバクテリアを検出する時に「16sリボゾームRNA」の領域を増幅していますが, この理由が良くわからないのです。それと, 人種差とかの影響はないのでしょうか?どうぞ宜しくお願いします。 【回答】 ご質問の意図するところに判然としない部分があるのですが (1) 16Sリボゾーム RNA領域の増幅がバクテリアの検出に用いられる理由, と (2) 16sリボゾームRNA領域は菌種 (人種というのは菌種の記載ミスと判断させていただきましたが宜しいでしょうか?) により異なるのでしょうか? というご質問であると捉えさせていただき, 以下に回答いたします。 まずは, 「なぜリボゾームRNAなのか?」
|TopPage| Last update 2014/7/31 MAIL 申し訳ございませんが、質問の新規受付は現在中止しております。 NEW 百日咳について Alicyclobacillus acidoterrestris の液体培養 黄色ブドウ球菌の定性判定のための第一選択培地 G群溶連菌による敗血症 グラム陽性菌のプロトプラスト SCD寒天培地に発育したカビ ブルーライト培地の着色 オートクレーブ前の乾熱滅菌 チオグリコレート (TGC) 培地の判定法 消毒剤の滅菌 調製した培地の有効期限 シャーレに培地を分注する際の器具 MIC50、MIC90、MIC80 リステリア菌での運動性試験の培養温度 サルモネラとTSI培地 小麦粉とデスオキシコレート培地 オートクレーブから蒸気が噴出 血液培養用採血シリンジでの空気抜き 低温細菌とデスオキシコレイト培地 血液培養から“Granulicat
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