Data Visualization with R - Syllabus
Instructor Dr. Andrew Heiss 55 Park Place SE, Room 464 aheiss@gsu.edu andrewheiss Schedule an appointment Course details Any day June 5–July 30, 2023 Asynchronous Anywhere Slack Course objectives Data rarely speaks for itself. On their own, the facts contained in raw data are difficult to understand, and in the absence of beauty and order, it is impossible to understand the truth that the data sho
Data Visualization
Published by Princeton University Press. Incomplete draft. This version: 2018-04-25. Buy from Amazon Buy from Powell's Buy from the Publisher “Finally! A data visualization guide that is simultaneously practical and elegant. Healy combines the beauty and insight of Tufte with the concrete helpfulness of Stack Exchange. Data Visualization is brimming with insights into how quantitative analysts can
フォレストプロットの書き方 R の方法 - 統計ER
メタアナリシスのフォレストプロットの書き方の解説 R の metafor パッケージを使う方法 ＞＞もう統計で悩むのを終わりにしませんか？ ↑1万人以上の医療従事者が購読中 フォレストプロットの書き方 統合値の計算 フォレストプロットの書き方 R の方法 フォレストプロットの書き方 真数の表示で対数目盛りにする方法 フォレストプロットの書き方 推定値の順番に並べ替える方法 フォレストプロットの書き方 分散が小さい順に並べる方法 まとめ フォレストプロットの書き方 統合値の計算 metaforパッケージを使う。 最初一回だけインストールする。 install.packages("metafor") 使用するデータは以下の通り。 a <- c(3,7,5,102,28,4,98,60,25,138,64,45,9,57,25,65,17) n1 <- c(38,114,69,1533,355,
おまえはもうRのグラフの日本語表示に悩まない (各OS対応) - ill-identified diary
2021/9/10 追記: 改めて更新された話を統合して整理して書き直しました. 以降はこちらを参考にしてください: ill-identified.hatenablog.com 2021/1/15 追記: RStudio 1.4 がリリースされたのでなるべくアップデートしましょう 2020/12/06 追記: Japan.R で今回の話の要約+新情報を『Mac でも Windows でも, PNG でも PDF でもRのグラフに好きなフォントで日本語を表示したい (2020年最終版)/Display-CJK-Font-in-Any-Gpraphic-Device-and-Platform-2020 - Speaker Deck』として発表した. ハイライトは「近々出るRStudio 1.4 があれば fontregisterer はほぼいらなくなる」 2020/10/31 追記: geom
Democracy Perception Index
Democracy Perception IndexThe world’s largest annual study on how people perceive democracy. Democracy Perception Index Report 2022The Democracy Perception Index (DPI) is the world’s largest annual study on democracy, conducted by Latana in collaboration with the Alliance of Democracies, to monitor attitudes towards democracy from around the world. Download Now
見たら「ん？」となるエラーバーのグラフ - Qiita
はじめに 実験でも数値計算でも、観測に誤差が伴うものをグラフにする時にはエラーバー(誤差棒)をつけると思います。エラーバーのつけ方には流儀がありますが、とりあえず1シグマ、つまり「誤差の乗り方がガウス分布だと仮定した時の標準偏差」をエラーバーとすることが多いです。 で、エラーバーは1シグマなので、「真の値をそのエラーバーの中に含む確率」が68%です。つまり観測点の3つに1つは「真の値」がエラーバーの範囲外にあることになります。なお、ここでは「真の値」を「観測を十分な回数繰り返した時に収束する値」のこととします。 さて、発表を見ていて、たまに「ん？」と思うようなグラフを見かけます。以下では、そんな「ん？」なグラフの実例と、その原因について見てみようと思います。 ケース1：正しい誤差棒 入力値$x$に対して、観測値$y$が$y=x$となる単純な系を考えましょう。ただし、観測するたびに誤差$\v
ファンネルプロットとは？ 出版バイアスのチェック フォレストプロットとの違い - 統計ER
ファンネルプロットとは何か？ 出版バイアスとは何か？ フォレストプロットとの違いは何か？ ＞＞もう統計で悩むのを終わりにしませんか？ ↑1万人以上の医療従事者が購読中 ファンネルプロットの前に出版バイアスとは？ ファンネルプロットとは？ 出版バイアスをチェックする Rでファンネルプロットを書いてみる ファンネルプロットとフォレストプロットの違い まとめ 参考書籍 ファンネルプロットの前に出版バイアスとは？ 出版バイアスとは、公表されている論文に偏りがあることだ。 統計学的有意になった結果が公表されやすい。 また、通説を覆すセンセーショナルな内容が公表されやすい。 統計学的有意でなかった結果は公表されにくい。 通説通りで話題性に乏しい結果は公表されにくい。 こういう偏りが論文公表の世界には存在する。 メタアナリシスには、特にサンプルサイズが小さかったために統計学的有意にならなかった試験結果が
Mistakes, we’ve drawn a few – The Economist
At The Economist, we take data visualisation seriously. Every week we publish around 40 charts across print, the website and our apps. With every single one, we try our best to visualise the numbers accurately and in a way that best supports the story. But sometimes we get it wrong. We can do better in future if we learn from our mistakes — and other people may be able to learn from them, too. Aft
5 reasons you should use a violin graph - BioTuring's Blog
1. Violin graph is like box plot, but better Box-and-whisker plots are great. They show medians, ranges and variabilities effectively. They allow comparing groups of different sizes. They are super simple to create and read, so naturally, they are all over the place. But box plots can be misleading. They are not affected by data’s distribution. When the data “morph” but manage to maintain their st
データ視覚化のデザイン #3｜Go Ando / PREDUCTS / THE GUILD
こんにちは、THE GUILDの @goando です。 前回に引き続き、Twitterでつぶやいている「データの視覚化のポイント」#11〜15をまとめます。 11. 縦軸は自然な数字を使う グラフの縦軸の目盛間隔はグラフを作成するツール(Excel、PowerPoint、Keynote...)が自動で設定しますが、気をつけないと読みにくい数列になる時があります。 不自然な目盛間隔 - 0, 3, 6, 9, 12, 15, ... - 0, 4, 8, 12, 16, 20, ... - 0, 0.4, 0.8, 1.2, 1.6, ... 自然な目盛間隔 - 0, 2, 6, 8, 10, 12, ... - 0, 5, 10, 15, 20, 25, ... - 0, 0.5, 1.0, 1.5, 2.0, ... 少しでも違和感になるような目盛は負担に繋がります。グラフの理解を妨げ
ggplot2 3.0.0を使ってみた - Technically, technophobic.
（この記事は「ggplot2 2.3.0（RC版）を使ってみた」として2018/05/27に公開していたものです。バージョン3.0.0としてリリースされたのでタイトルを変えました） ggplot2 3.0.0がリリースされました。例によってこのニュースを追ってみます： 公式のアナウンスはこちら： tidyeval tidyevalについての詳しい解説は省きますが、使えるようになりました。これによって、 plot_iris <- function(x, y, group) { x_var <- rlang::enquo(x) y_var <- rlang::enquo(y) group_var <- rlang::enquo(group) ggplot(iris, aes(x = !!x_var, y = !!y_var, colour = !!group_var)) + geom_poin
系統樹 ape ade4 | R を利用した系統樹の描き方
系統樹のデータは、newick フォーマットあるいは nexus フォーマットによって記載される。R では、ape や ade4 などのパッケージを利用することで、これらのフォーマットのファイルを扱うことができる。 ファイルフォーマット newick フォーマット newick フォーマットは、括弧を利用して、近い 2 つの要素を次々と囲んで行くフォーマットである。1 例を示すと以下のようになる。括弧の順序に着目すると、A と B はまず 1 つのグループに分けられ、その次に C と D が次々と加わって行く。また、系統樹に距離が定義されているとき、現在の要素とその上の要素の距離を、その要素の横に書く。 ((A:0.3,B:0.2):0.4,C:0.6,D:0.8); nexus フォーマット 上と同じデータを nexus フォーマットで示すと、次のようになる。 #NEXUS [R-pac
リリース、障害情報などのサービスのお知らせ
最新の人気エントリーの配信
j次のブックマーク
k前のブックマーク
lあとで読む
eコメント一覧を開く
oページを開く
How do I change the number of decimal places on axis labels in ggplot2?
Joining a dendrogram and a heatmap
Andrews plot - Wikipedia
Funnel Plot Variations [The metafor Package]
Introduction to forest plots
UpSet Charts Comparison | R-bloggers
ggplot2 Based Plots with Statistical Details
http://www.exegetic.biz/blog/2015/05/r-recipe-making-a-chord-diagram/