Data Visualization with R - Syllabus
Instructor Dr. Andrew Heiss 55 Park Place SE, Room 464 aheiss@gsu.edu andrewheiss Schedule an appointment Course details Any day June 5–July 30, 2023 Asynchronous Anywhere Slack Course objectives Data rarely speaks for itself. On their own, the facts contained in raw data are difficult to understand, and in the absence of beauty and order, it is impossible to understand the truth that the data sho
Data Visualization
Published by Princeton University Press. Incomplete draft. This version: 2018-04-25. Buy from Amazon Buy from Powell's Buy from the Publisher “Finally! A data visualization guide that is simultaneously practical and elegant. Healy combines the beauty and insight of Tufte with the concrete helpfulness of Stack Exchange. Data Visualization is brimming with insights into how quantitative analysts can
おまえはもうRのグラフの日本語表示に悩まない (各OS対応) - ill-identified diary
2021/9/10 追記: 改めて更新された話を統合して整理して書き直しました. 以降はこちらを参考にしてください: ill-identified.hatenablog.com 2021/1/15 追記: RStudio 1.4 がリリースされたのでなるべくアップデートしましょう 2020/12/06 追記: Japan.R で今回の話の要約+新情報を『Mac でも Windows でも, PNG でも PDF でもRのグラフに好きなフォントで日本語を表示したい (2020年最終版)/Display-CJK-Font-in-Any-Gpraphic-Device-and-Platform-2020 - Speaker Deck』として発表した. ハイライトは「近々出るRStudio 1.4 があれば fontregisterer はほぼいらなくなる」 2020/10/31 追記: geom
R でメタアナリシスのファンネルプロットを書く方法 出版バイアスのチェック フォレストプロットとの違い - 統計ER
ファンネルプロットとは何か？ 出版バイアスとは何か？ フォレストプロットとの違いは何か？ ＞＞もう統計で悩むのを終わりにしませんか？ ↑1万人以上の医療従事者が購読中 ファンネルプロットの前に出版バイアスとは？ ファンネルプロットとは？ 出版バイアスをチェックする Rでファンネルプロットを書いてみる ファンネルプロットとフォレストプロットの違い まとめ 参考書籍 ファンネルプロットの前に出版バイアスとは？ 出版バイアスとは、公表されている論文に偏りがあることだ。 統計学的有意になった結果が公表されやすい。 また、通説を覆すセンセーショナルな内容が公表されやすい。 統計学的有意でなかった結果は公表されにくい。 通説通りで話題性に乏しい結果は公表されにくい。 こういう偏りが論文公表の世界には存在する。 メタアナリシスには、特にサンプルサイズが小さかったために統計学的有意にならなかった試験結果が
ggplot2 3.0.0を使ってみた - Technically, technophobic.
（この記事は「ggplot2 2.3.0（RC版）を使ってみた」として2018/05/27に公開していたものです。バージョン3.0.0としてリリースされたのでタイトルを変えました） ggplot2 3.0.0がリリースされました。例によってこのニュースを追ってみます： 公式のアナウンスはこちら： tidyeval tidyevalについての詳しい解説は省きますが、使えるようになりました。これによって、 plot_iris <- function(x, y, group) { x_var <- rlang::enquo(x) y_var <- rlang::enquo(y) group_var <- rlang::enquo(group) ggplot(iris, aes(x = !!x_var, y = !!y_var, colour = !!group_var)) + geom_poin
系統樹 ape ade4 | R を利用した系統樹の描き方
系統樹のデータは、newick フォーマットあるいは nexus フォーマットによって記載される。R では、ape や ade4 などのパッケージを利用することで、これらのフォーマットのファイルを扱うことができる。 ファイルフォーマット newick フォーマット newick フォーマットは、括弧を利用して、近い 2 つの要素を次々と囲んで行くフォーマットである。1 例を示すと以下のようになる。括弧の順序に着目すると、A と B はまず 1 つのグループに分けられ、その次に C と D が次々と加わって行く。また、系統樹に距離が定義されているとき、現在の要素とその上の要素の距離を、その要素の横に書く。 ((A:0.3,B:0.2):0.4,C:0.6,D:0.8); nexus フォーマット 上と同じデータを nexus フォーマットで示すと、次のようになる。 #NEXUS [R-pac
%2F)
Colors (ggplot2)
Problem Solution Sample data Simple color assignment Mapping variable values to colors A colorblind-friendly palette Color selection Setting luminance and saturation (chromaticity) Palettes: Color Brewer Palettes: manually-defined Continuous colors Color charts Hexadecimal color code chart RColorBrewer palette chart Problem You want to use colors in a graph with ggplot2. Solution The default color
Rで解析：デンドログラムのラベルの色分けに役立ちます。「colorhcplot」パッケージ
デンドログラムのラベルをグループで色分けするのに便利なパッケージの紹介です。 パッケージバージョンは1.3.1。実行コマンドはwindows 11のR version 4.1.2で確認しています。 パッケージのインストール下記コマンドを実行してください。 #パッケージのインストール install.packages("colorhcplot")コマンドの紹介詳細はコマンド、パッケージのヘルプを確認してください。 #パッケージの読み込み library("colorhcplot") ###データ例の作成##### set.seed(1234) n <- 10 TestData <- data.frame(row.names = paste0("ID", 1:n), Group = as.factor(sample(paste0("Group", 1:3), n, replace = TRUE
ggplot2で試行錯誤する時は+ NULLで終わろう - Qiita
ggplot2はレイヤの順番変更や、削除がやや手間 ggplot2は、便利な作図ツールですが、データや書式をレイヤに分けている関係上、レイヤを足す順番が大事になります。 例えば下記の図は、散布図と回帰曲線を足す順番を前後させたもの。 点を目立たせたいか、回帰曲線を目立たせたいか、考えてレイヤを足さなければなりません。 library(ggplot2) library(GGally) gp <- ggplot(iris, aes(x = Sepal.Length, y = Sepal.Width, color = Species)) layers <- list( geom_point(), geom_smooth(alpha = 0.6) ) ggmatrix( list( gp + layers, gp + rev(layers) ), nrow = 1, ncol = 2, xAxis
Change colours of particular bars in a bar chart
I've been creating some bar-charts and I was wondering is it possible to colour bars on a chart depending on whether they lie above or below the x-axis? For clarification, this is the type of bar-chart I mean: Ideally I would like to be able to colour the bars above a separate colour to those below so the graph looks more appealing, I've been searching but I can't find any method of doing this, ca
Fundamentals of Data Visualization
Welcome This is the website for the book “Fundamentals of Data Visualization,” published by O’Reilly Media, Inc. The website contains the complete author manuscript before final copy-editing and other quality control. If you would like to order an official hardcopy or ebook, you can do so at various resellers, including Amazon, Barnes and Noble, Google Play, or Powells. The book is meant as a guid
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How do I change the number of decimal places on axis labels in ggplot2?
Joining a dendrogram and a heatmap
Funnel Plot Variations [The metafor Package]
Introduction to forest plots
UpSet Charts Comparison | R-bloggers
ggplot2 Based Plots with Statistical Details
http://www.exegetic.biz/blog/2015/05/r-recipe-making-a-chord-diagram/
half_violin_with_raw_data.R
2つのmosaic plotと日本語表示