『Rによる自動データ収集』を読んだ - 僕らはRを愛しすぎてる
訳者の方からご恵贈いただきました。 本文だけで500ページを超える重厚な書籍で、HTMLやXMLの基礎、正規表現やXpathの仕組み、データ分析のプロジェクトの管理までちゃんと押さえつつ、ネットワーク分析、ツイートマイニング、地理的データの可視化、ECサイトからのマイニング・センチメント分析などなど事例も豊富。 それら事例のそれぞれに紙幅をふんだんに割いて記述されてあり、 入門者がいざ実際の課題に取り組む際に重宝しそうな、単にデータ収集するコードだけでなく分析の進め方や考え方がきっと役に立つ、と思わされる一冊でした。 確かに値段は高めだけど、分量を考えたらむしろお得なので、Rを使うならデータ分析の部署にひとつ買って置いといて損はないはず。 出版社のページはこちら。 Rによる自動データ収集 ―Webスクレイピングとテキストマイニングの実践ガイド― / Simon Munzert 他著 石田
How to make a great R reproducible example
Basically, a minimal reproducible example (MRE) should enable others to exactly reproduce your issue on their machines. Please do not post images of your data, code, or console output! Brief summary A MRE consists of the following items: a minimal dataset, necessary to demonstrate the problem the minimal runnable code necessary to reproduce the issue, which can be run on the given dataset all nece
R6パッケージの紹介―機能と実装
7. 6 既存のOOシステム • S3 – クラスはclass属性として個別のオブジェクトに対して設定 • フォーマルなクラス定義はない • 継承もclass属性で行う – メソッドはジェネリック関数 john <- list(name = "John", age = 40) class(john) <- c("Employee", "Person") # printはジェネリック関数 print #> function (x, ...) #> UseMethod("print") # メソッド定義 print.Person <- function(x) { paste0("こんにちは，", x$name, "です．") } # printで実際に呼ばれるのはprint.Person print(john) #> [1] "こんにちは，Johnです．" 8. 7 既存のOOシステム • S
Welcome · Advanced R.
This is the companion website for “Advanced R”, a book in Chapman & Hall’s R Series. The book is designed primarily for R users who want to improve their programming skills and understanding of the language. It should also be useful for programmers coming to R from other languages, as it explains some of R’s quirks and shows how some parts that seem horrible do have a positive side. Introduction F
MongoDBの集計機能が便利過ぎて泣けてくるお話し - Y's note
MongoDBイン・アクション 作者: Kyle Banker,Sky株式会社玉川竜司出版社/メーカー: オライリージャパン発売日: 2012/12/14メディア: 大型本購入: 5人 クリック: 55回この商品を含むブログ (4件) を見る MongoDB集計機能 CentOSでNginxのログをFluentdを使ってMongodbにリアルタイムで格納する - Yuta.Kikuchiの日記 時給3000円のCEOと揶揄されている@yutakikucです。今日は簡単にMongodbのログ集計機能を紹介します。機能が豊富過ぎて泣けてくるんで、ログ解析する人は是非使ってみて下さい。FluentdでMongodbにNginxのLogを流し込む設定は上のエントリーを参照して下さい。次回はAggregationFramework/MapReduce周りについて触れたいと思います。 泣ける話 : 集
Rパッケージが Bioconductor に採択されるまでの顛末
R には CRAN というパッケージ集がありますが、ライフサエンス分野専門のパッケージ集に Bioconductor というものがあります。Core developer team のメンバーは、Rの core developer team と一部メンバーが被っています。 Bioconductor は CRAN と比較すると、詳細なコードレビュー/ドキュメンテーション(もちろん英語の)が必要など、わりと厳しめの採択基準があります。これまで、日本人でBioCに採択された人がいなく情報があまりませんでした。このたび、BrainStars for R というパッケージが Bioconductor 2.10 に採択され公開されました。その顛末を公開して、日本のすぐれたプログラムが Bioconductor に採択されることをエンカレッジできればと思います。 開発 このあたりは、BioCのパッケージガ
R5 reference class 編: R でいまどきなパッケージ開発 (devtools, testthat, roxygen2)
一週間ほど熱でうなされながら、とある研究に使うために、とあるプログラムのドキュメントをひたすら読んでいました。残念ながら R からアクセスするパッケージがないので自分で書いてみようかと思うのですが、どうせなら R5 reference class を使って実装してみようと、朦朧とする意識のなか考えていました。 その前に、R5のおさらいということで、以前のS4で実装した「R でいまどきなパッケージ開発 (devtools, testthat, roxygen2)」をR5にしてみました。解説を書くほど元気がないので、github にコードは置いてあげたので、興味のあるおにいちゃんは各自コード読んだらいいんだからねっ! https://github.com/dritoshi/idol 無駄にツンデレいもうと風になったのはおそらく熱のせいですが、雑感を書いておくと、R5のほうが非常に簡潔に書けるの
R でいまどきなパッケージ開発 (devtools, testthat, roxygen2)
追記 (2012/04/21): 以下のコードは S4 classes で書いていますが、R5 reference classes で書き直してみました。こちらもどうぞ。http://blog.hackingisbelieving.org/2012/04/r5-reference-class-r-devtools-testthat.html R のパッケージ開発の情報があまりないので、自分はこんな感じでやってます、というのを書いてみます。パッケージ開発支援の devtools と単体テスト支援の testthat, そしてドキュメント生成支援の roxygen を使うのがいまどきっぽいです。 そもそもパッケージを作製しているひとをあまりみたことがないので、もっとこうすべき、というのがあれば教えてほしいです。 今回はデモケースとして S4 OOP で、Idol クラスを定義し、とある身体的特
R GPGPU
Enabling GPU Computing in the R Statistical Environment R is the most popular open source statistical environment in the biomedical research community. However, most of the popular R function implementations involve no parallelism and they can only be executed as separate instances on multicore or cluster hardware for large data-parallel analysis tasks. The arrival of modern graphics processing un
A highly efficient multi-core algorithm for clustering extremely large datasets - BMC Bioinformatics
RでGPU使ってみた
自分の顔でやる気アップ？ 〜 アイデンティティへの意識集中がモチベーションに及ぼす影響を探る RCTsKeisukeHattori1
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CRAN - Package linkcomm
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