日当直です。残り12時間くらい。 Dry解析 最近Dry解析に取り組んでいます。 基本的なところは「次世代シークエンサーDRY解析教本 」で学んで天皇誕生日を利用してうちの部門の教員・院生と3人で三島詣をしてきました。 前日勤務のあと新幹線で向かったのですが火災で一時間半ほど足止めをくらいました。 @bonohuさんに6時間ほどみっちりとぼくらの疑問というか躓いた点について個別に解説してもらい解析のfine tuningのやり方など教えてもらうことができてとても有意義な訪問となりました。 今書いている論文に早速活かしたいと思っています。 「Dry解析教本」すごく丁寧です。 今回解ったのですがこれは隅から隅まで一度は通読するとかなり役に立つ本です。 Macの選びからから解説してくれているのですが実はここはすごく重要です。MacBook Airでも「できる」としても16GBのメモリをつんだMa

東京には池袋・高田馬場・新宿など、多くの「ラーメン激戦区」と呼ばれる地域があります。しかし、もちろんそれは東京に限ったことではありません。西の都・京都にも東京のに負けない超・ラーメン激戦区があったんです！と、言うことで今回は西のラーメン王国、京都・一乗寺周辺の本当に美味しいラーメン店を厳選してご紹介致します！

（わざわざ手描きにしたのに結局著作権が危うい絵を描いている） どうもこんにちは、博士論文（仮）を提出したばかりのぴちぴちのD3、@calicolicaliです。学生最後ということで、院生しか登録できないAdvent calendarに登録させていただきました！ ʕ◔ϖ◔ʔ 「統計について」という事前コメントをしましたが、 私の専門はアルゴリズム寄りのComputational Biologyで、これまではRNA二次構造予測ソフトウェアParasoRの開発や、配列アラインメントソフトウェアLASTの開発に関わらせていただいたりしてきました。（ご興味あればぜひ！）しかしこの分野では「網羅的な遺伝子データや配列情報を扱うためには統計や機械学習が必要！」ということで、日々これらの分野の勉強をしております。 そんな私が紹介する、今年読んだ一番好きな論文はこちら(｀・ω・´)つ "Estimating

こんにちは！はてなアプリケーションエンジニアの id:takuya-a です。 みなさんは、このような疑問をもったことはありませんか？ grep はどのように文字列を検索しているのか？ MeCab はどうやって辞書を高速にルックアップしているのか？ パーサやコンパイラを作りたいけど、何から始めればいいのか？ 本稿では、「文字列アルゴリズムとはどんなものなのか？」「なぜ重要なのか？」「何を知っておくべきか？」「どうやって勉強すればいいのか？」といった疑問にお答えしていこうと思います。 文字列アルゴリズムの意外な応用や、モチベーションを保ちやすい勉強のしかた、文字列アルゴリズムを勉強するために行った社内での取り組み、実装するときのコツといったトピックについても触れています。 このエントリは、はてなエンジニアアドベントカレンダー2016の22日目の記事です。昨日は id:syou6162 さんに

ふるさと納税で被災地に寄付ができる仕組みです。 寄付は被災した自治体に直接届き、災害対応や復興に活用されます。 支援先を選ぶ

Pythonクローリング&スクレイピングを頂きました。ありがとうございます。まだざっとしか読んでいませんが、Pythonのクローラー本で一番バランスが良いのではないでしょうか？ Pythonクローリング＆スクレイピング ―データ収集・解析のための実践開発ガイド― 作者: 加藤耕太出版社/メーカー: 技術評論社発売日: 2016/12/16メディア: Kindle版この商品を含むブログを見る 本書の内容 PythonでスクレイピングするのであればBeautiful Soup、クローラーフレームワークとしてはScrapyが定番です。この2つをしっかり抑えながら、ブラウザを操作するためのRoboBrowser、ブラウザ＋JavaScriptに対処もできるSelenium+PhantomJS、PDFからのテキストの抽出など多岐に渡るテーマを扱っています。またデータ収集術だけではなく、分析を助けるた