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分子に関するhamukichi_nbrのブックマーク (1)

  • MOPAC で分子のアニメーションを作成して JSmol で観察する - Acetaminophen’s diary

    こちらのメインブログが最近淋しいことになっていたので、サブブログで少しだけ触れた話題をもう少し深めて書いておこうと思い立った*1。 インタラクティブな分子模型をシェアする - アセトアミノフェンの気ままな日常 久々に JavaScript と化学の話題。今回は真面目にコンピュータ化学を駆使して量子化学計算を行い、振動アニメーションを作成するところから SNS で JSmol によるインタラクティブな 3D モデルをシェアする(というかシェアできる状態にする)ところまで持っていく。 使うもの Winmostar:ユーザ登録して無償版を入手。最近のバージョンの MOPAC は有償化されているが、無償だったころの古い MOPAC6 が付属しているのでこれを使う*2。 Jmol:JSmol もあるが、ローカル環境でスクリプトを動かすにはこちらのほうが個人的には好み。以前もこのブログで登場したことが

    MOPAC で分子のアニメーションを作成して JSmol で観察する - Acetaminophen’s diary
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