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  • 🦮 雑に使う Nextflowワークフロー言語    (´・ω・`) - Qiita

    この記事は 自分でNextflowスクリプトを書きたい人の記事です。例えばRNA-Seqをやりたい場合、自分でスクリプトを書くよりもnf-core/rnaseq の使い方を調べましょう。 Nextflowとは ワークフロー言語の一つ。AWS, GCP, Azureなどの計算資源をシェルスクリプトのように使う。 その中身はGroovyのDSL。Groovyは、Javaプラットフォーム上で動く言語。Rubyの影響が強い。 Groovyは、Githubトレンドでは、GradleとNextflowに使われている。Gradleはビルド自動化ツールで、Nextflowと似ている。Groovy言語はこういうのが得意みたい。 スペインのPaolo Di Tommasoさんら、バルセロナのSeqera Labs社が中心に開発。 EU圏の人が多く利用している印象でヨーロッパ色が強い(≠アメリカ)。 なぜ雑であ

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