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toolとネットワーク理論に関するkei-sのブックマーク (2)

  • 2日目:ネットワークの特徴量、Pajekの使い方 - 反言子

    NAISTサマーブートキャンプ ソフトウェア工学講座「社会ネットワーク分析」の実習(2009年8月10-12日)に参加しました。 一日目午前:NAISTソフトウェア設計学講座をちょっと見学してきた 一日目午後:社会ネットワーク分析の基礎 二日目はネットワークの特徴を表す指標のうち代表的なものを理解し、Pajek(ぱやっく)という分析ツールの使い方に慣れました。実習では指標の説明を受けたのちPajekの練習をしたのですが、解説ページもいくつかあるのでここではPajekの使い方を省略します。 平均経路長はネットワークの大きさを表す 平均経路長は「すべてのノード間の最短パス長を平均した値」によって定義されます。ノードがたくさんある(ネットワークが大きい)ほど大きくなりますが、ノード同士のつながりかたにも左右されます。 上のネットワークですと、1-2間が2ステップ、1-3間が1ステップ……という感

    2日目:ネットワークの特徴量、Pajekの使い方 - 反言子
  • オープンバイオ - meeting3-log-network

    Cytoscape <URL:http://www.cytoscape.org> タッチグラフ <URL:http://www.touchgraph.com/> bio verse viewer <URL:http://bioverse.compbio.washington.edu/viewer/> graphviz <URL:http://www.research.att.com/sw/tools/graphviz/> LGL <URL:http://apropos.icmb.utexas.edu/lgl/> estetic graph <URL:http://search.cpan.org/~thospel/Graph-Layout-Aesthetic-0.12/lib/Graph/Layout/Aesthetic.pm> pajek <URL:http://vlado.fmf.uni

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