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ブックマーク / ryamada22.hatenablog.jp (1)

  • ベイズ統計学 - ryamadaの遺伝学・遺伝統計学メモ

    最近の論文では、こんなものが。 ベイズは以下に示すRのパッケージのインストールで山のように依存関係のあるパッケージのインストールが必要となることからもわかるとおり、面倒くさい(計算量もすくないわけではない・・・)。ので、漸近近似でベイズ因子を出してみましょう、という論文。 これの前の論文については、こちらにも。 GWAS(Genome wide association studies)においては、ジェノタイプ・フェノタイプ関連検定の目的は大きく2つある (1)数あるマーカーに順位をつけること (2)検定に「有意」か否かの判断を下すこと この2目的のためであれば、「P値と、パワー考慮の値の2つの指標でマーカーに順序を入れる」、というのでも、達成できるかもしれないけれども・・・ 「関連がない」という帰無仮説に対して、「関連があってもよい」という対立仮説を与える。「関連があるとしたら、どんな関連

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