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ブックマーク / www.ikushimo.com (1)

  • 幾霜::残日録::2008/09/08 (月)

    移籍先を探しています。系統樹推定法やメタバーコーディング法などに詳しい研究者を探している方がおられましたらご一報下さい。 やっと分かってきた。何とかなるかもしれません。 以下のコマンドで、データファイルを読み込み、無作為配列付加による初期系統樹を生成し、TBR樹形改変による樹形探索を行います。反復数は10回で、得られた系統樹をtree.treに保存します。 procedure data.nex mult = tbr replic 10; export - tree.tre; ところがこの系統樹、OTU名が数字に置き換えられているんですよねぇ。変なことすんなよなぁ。 追記 - 23:35:37 データ配列を含むNEXUSファイルの末尾に、以下のような記述を加えた上で、「procedure ファイル名」コマンドによって読み込むことでバッチ処理を行うことも可能。 Begin TNT; mult

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