uniqコマンドを用いて重複した行の数をカウントする。
医療系の仕事をしています。生命の尊さ、美しさがどのようなメカニズムで生じるのかに興味があります。科学の方法論を用いて、このような問いに応えたい、私はこう思って医学生物学の基礎研究のトレーニングを受けてきました。生命を科学的手法を用いて理解を試みる上で、genomeを始めとした種々の大量データの処理が必要不可欠であることを痛感しました。また、生命科学が物理学、数学、統計学、有機化学などの種々の学問と深い関わりを持つことを実感しました。そのため、このブログは広範囲の学問領域に関しての記事を載せています。日々の学習内容を文書に書き残し、それを読み返すことによって、体系化された知識を身に付けることを目標としています。どうぞよろしくお願いします。 たとえば以下のようなファイルがあったとします（マイクロアレイなどのデータを想定しています） $ cat example.txt aaa bbb aaa c
テキストファイルを処理するときのUnixコマンドまとめ - nokunoの日記
個人的にテキストファイルを処理することが多いのですが，簡単な処理ならUnixのコマンドをパイプとリダイレクトで組み合わせてできることが多くあります．今回はそんななかでもちょっとマニアックなTIPSをまとめてみました． sortコマンドでタブ区切りのファイルを指定する最近知って驚愕したのがこれ．sortコマンドでタブ区切りのファイルを指定したいときは，Ctrl+v Tabでタブ文字を入力していたのですが，$ sort -t $'\t' -k 2,2 のようにしてタブ区切りで2番目のキーでソートすることができます． 1000行おきにデータをサンプリングする1000行おきにファイルからデータをサンプリングしたいときとかは，perlでワンライナーを書くのが速いようです．$ perl -ne '$i++; print unless ($i % 1000)' 某所のコードゴルフによるとこれだけ短くでき
1
リリース、障害情報などのサービスのお知らせ
最新の人気エントリーの配信
処理を実行中です
j次のブックマーク
k前のブックマーク
lあとで読む
eコメント一覧を開く
oページを開く
