Create Elegant Data Visualisations Using the Grammar of Graphics • ggplot2
Usage It’s hard to succinctly describe how ggplot2 works because it embodies a deep philosophy of visualisation. However, in most cases you start with ggplot(), supply a dataset and aesthetic mapping (with aes()). You then add on layers (like geom_point() or geom_histogram()), scales (like scale_colour_brewer()), faceting specifications (like facet_wrap()) and coordinate systems (like coord_flip()
アピタル（医療・健康・介護）：朝日新聞デジタル
写真 もっと医療面あなたのたん、色や粘り気は？ 気道の異常知る「鏡」(2019/7/10) ねばねばしてのどに絡みつくたんは、口から肺への空気の通り道「気道」の異常を知らせるサインだ。４月には、世界初となるたんの診療指針ができた…[続きを読む] 唾液腺に石ができる「唾石症」 切除のリスクは？[どうしました](2019/7/10) 食に「罪の意識」オリンピック選手が語る６年間の無月経[ニュース・フォーカス](2019/7/8) ハンセン病家族訴訟、控訴せず 首相、人権侵害を考慮[ニュース・フォーカス](2019/7/9) 調理実習でジャガイモ食べた児童８人が入院 兵庫・宝塚[ニュース・フォーカス](2019/7/10) 夜勤眠れず、「限界の中で……」 人手不足の介護現場[ニュース・フォーカス](2019/7/10) ベッド転落で負傷、事故を隠した特養を松江市が処分[ニュース・フォーカス
ワイリー・サイエンスカフェ
日本で8月に最もよく売れたWiley（Wiley-Blackwell, Wiley-VCHを含む）の理工書トップ５をご紹介します。タイトルまたは表紙画像をクリックすると、目次やサンプル章(Read an Excerpt)など、詳しい内容をご覧いただけます。 １位 Sequence Stratigraphy Edited by Dominic Emery, Keith Myers ISBN: 978-0-632-03706-3 Paperback / 304 pages / August 1996 地層学の有力な手法として近年急速に重要性を増した「シーケンス層序学」に関する古典的教科書です。British Petroleum (BP) で使われた研修用教材を基に編纂されたもので、シーケンス層序学の基本的な概念とテクニック、応用法を解説します。 ２位 Advanced Analysis of
医学研究初心者のための やっぱりわかりにくい統計道場
Since 2010/3/16 この資料はこんな本達を参考に作成しました 医学研究初心者のための やっぱりわかりにくい統計道場 Shingo Hatakeyama 1 統計 統計の難しさ なぜ、難しいのか？それは言葉が難しいからです。 正規分布 正規分布、分散、標準偏差、対応のある・・・、パラメトリック・・・など など、まったく意味不明ですよね。 しかし今の医学には統計はなくてはならない手段であり、深入りし なければ、統計はそんなに難しいものではありません。理解しよう と深入りすると戦意喪失します。 まずは見た目からやる気を失う「統計用語」を受け入れ、便利な道 具である統計を味方にしましょう。 深入りせず簡単に覚えるには、このデータにはこの解析、と１：１対 応で暗記することです。 そして最も重要なのは「必要に迫られること」ですね。 これを書いている私も、数年前までは統計音痴でした
『薬の効き目 数字のトリック NNTって知ってますか？』
ある脳外科医のぼやき脳や脳外科にまつわる話や、内側から見た日本の医療の現状をぼやきます。独断と偏見に満ちているかもしれませんが、病院に通っている人、これから医療の世界に入る人、ここに書いてある知識が多少なりと参考になればと思います。 ＊旧題「ある脳外科医のダークなぼやき」 今日は医学の世界の数字のトリックについて書きます。 何の数字のトリックかというと、 薬などの効果を表す時の数字のトリックです。 世の中にはさまざまな薬があふれていますよね。 たとえば、 「2倍の効き目！」 だとか、 ぱっと分かるような売り文句があふれていますが、 でもそれって何の2倍なの？？ということを深く考える人はあまりいません。 かくいう医者にあっても、 特に考えずに数字のインパクトだけにごまかされてしまって、 数字の深い意味まで考える人はそう多くないのかもしれません。 また、何も医学の世界にかぎったことではなく、
水うがいで風邪発症が４割減少（2005.12.6） - 京都大学保健管理センターflu
水うがいで風邪発症が４割減少（2005.12.6） 世界初の無作為化試験で実証 保健管理センター・川村 孝 風邪の予防策としてうがいは当たり前のように行われているが、日本独自の衛生習慣であり、またその有効性は十分に検証されていない。そこで2002年から2003年の冬季に北海道から九州まで全国18地域で、うがいの風邪予防効果を世界初の無作為割付の研究で検証した。 ボランティア387名を募り、くじ引きで「水うがい群」「ヨード液うがい群」「特にうがいをしない群」の3群に割り付け、2ヶ月間にわたって割り付けられたうがい行動をとってもらって風邪の発症を追跡した。その結果、発症率はうがいをしない群の1ヶ月あたり100人中26.4人に対して水うがい群は17.0人、ヨード液うがい群は23.6人であった。多変量解析で群間のばらつきをそろえると、水うがいをした場合の発症確率はうがいをしない場合に比べて4
がんの原因ランキングUK2010 - 蝉コロン
医療英国の2010年のデータから、がんの約40%が生活習慣や環境因子を原因としているという論文、というか雑誌の増刊なのかなこれは。 The Fraction of Cancer Attributable to Lifestyle and Environmental Factors in the UK in 2010 オープンアクセスでクリエイティブコモンズ準拠です。 14の生活習慣、環境因子、食事に着目して、それぞれのがんの原因となる割合を概算した疫学的研究（systematic reviews and meta-analyses）。がん患者さんを並べて「この人はタバコが原因！こっちはウイルス！」って判定していったわけじゃあないです。そういうんはできませんから。 16. The fraction of cancer attributable to lifestyle and environ
性感染症報告数（2004年～2021年）｜厚生労働省
〒100-8916 東京都千代田区霞が関1-2-2 電話：03-5253-1111（代表） Copyright © Ministry of Health, Labour and Welfare, All Right reserved.
図録▽平均寿命の歴史的推移（日本と主要国）
アンガス・マディソンAngus Maddisonの「世界経済」（＊）から日本と世界主要国の平均寿命の歴史的推移を見た図を掲げる。 ＊The World Economy: A Millennial Perspective/ Historical Statistics (Development Centre Studies) 結論的には、近代以前の世界の平均寿命は20歳代。産業革命時代の欧米や江戸時代の日本は30歳代。遅れていた日本は1950年以降に一気に欧米を抜き去る。 最も古い時代の推計としてはローマ時代のエジプト33-258年の推計値が24歳とされる。1000年頃の世界の平均寿命も多分24歳ぐらいだったとされる（マディソン同資料）。14～15世紀のイングランドが24歳、18世紀のフランスが25歳とヨーロッパ中世もこれとほとんど変わらない水準である。 1820年になってもインドでは古代エジ
アピタル＿内科医・酒井健司の医心電信＿【第１９回】 ウソと真っ赤なウソと、そして統計
「嘘には３種類ある。 ウソと真っ赤なウソ、そして統計だ」という言葉があるくらいで、統計はあまり信用されていないふしがあります。 確かに、インチキな結論に誘導するよう誤用される統計もあります。前回紹介した、ＪＴのサイトにある「日本における喫煙者率と肺がん死亡率の推移」がそうですね。「肺がん死亡率の動向は喫煙者率の推移とは多くの点で一致しません」などと、あたかも喫煙の肺がんへの影響がまだ確定されていないかのように誤解させるような統計でした。また、ＪＴの同じページには、「各国の喫煙者率と肺がん死亡率の関係」を示す図もあります。 「各国の喫煙者率と肺がん死亡率の関係」 この図だけ見ると、なるほど、喫煙者率が高いからといって、必ずしも肺がん死亡率が高いようには見えません。他に何も情報がないのであれば、喫煙と肺がんの関係を疑ってみてもよいかもしれません。しかし、私たちは既に、喫煙と肺がんの関係を示すも
アピタル＿内科医・酒井健司の医心電信＿【第１８回】 喫煙率が下がっているのに肺がんが増えている？
小宮山洋子厚生労働相が、たばこの増税を示唆する発言をしました。たばこ増税については議論があってよいと思いますが、それとは別に、喫煙の害について過小評価する人もいることが気になります。 喫煙が肺がんの原因の一つ、しかもかなり大きな要因であることは疑いようのない事実ですが、どうしてもこの事実を認められない人もいるようです。タバコ有害説を否定するためにいろいろな理屈が持ち出されますが、その中の一つである、「日本人の喫煙率は下がり続けているが、肺がんは増えている。喫煙が肺がんの原因だとしたら、この事実は説明できない」という主張について検討してみましょう。 ＪＴのウェブサイトの「喫煙と健康」というページでは以下のような主張がなされていました。 わが国における男女別の肺がん死亡率と喫煙者率の推移をみると、最近４０年間で男性喫煙者率は明らかに低下し、女性喫煙者率はほぼ横ばいであるのに対し、死亡率は男女と
武田邦彦 （中部大学）: 日本人が大人になるチャンス・・・タバコの危険性
さて、タバコは「本人の体にお酒程度のダメージを与えるぐらいのもの」なのか、それとも「社会的に影響を及ぼすほどの害があるのか」についても慎重に考える必要があるのかということを取り上げたいと思います。 このシリーズは大震災と原発事故を経験した日本人が「政府やマスコミに言われたとおり」ではなく、自らデータと論理を駆使して考えることを目的にしていますので、「聞くまでもなくタバコは禁止すべきだ」というご意見の方は、この後は血圧が上がるかも知れないので、お読みにならないでいただきたいと希望します（また副流煙や汚れなどの問題は後に取り上げます）。 ・・・・・・ タバコが健康に悪いということは臨床的には明らかで、肺がん、気管支障害、血液障害などを誘発することがよく知られています。特にお医者さんは「体の故障を直す」ということを本業にしている場合が多いので、どうしてもタバコのように体に害のあるものを忌避する傾
9・11で救助活動の消防士、がん罹患率が19％高く＝米調査
９月１日、２００１年の同時多発攻撃で倒壊した世界貿易センタービルで救助にあたった男性消防士は、がんにかかるリスクが他の消防士よりも１９％高いことが、明らかになった。２００１年９月撮影。資料写真（２０１１年 ロイター） ［シカゴ １日 ロイター］ ２００１年９月１１日の同時多発攻撃で倒壊した米ニューヨーク市の世界貿易センター（ＷＴＣ）ビルで救助にあたった男性消防士は、がんにかかるリスクが他の消防士よりも１９％高いことが、医学誌ランセットに発表された研究で１日、明らかになった。 これは、約１０年前に起きた同時多発攻撃で救助活動を行った消防士全員のがん罹患（りかん）率を調べた初めての研究で、この中には約１万人の男性消防士が含まれている。調査では、９・１１後の最初の７年間にがんを発症した例を調べた。 消防士らは当時、崩壊したＷＴＣのがれきに囲まれ粉じんが舞う中、救助作業を行い、多環式芳香族炭化水素
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