PDBからSTLへ: タンパク質を3Dプリンタで出力するまで - 中田真秀(なかたまほ)のブログ
このブログエントリには3d-print-your-favorite-protein を参考に、タンパク質のモデルを、OSXで3Dプリンタへ出力するのに必要なSTL形式に直す手順を記してある。 1. pymolでタンパク質を表示し、VRML2 形式でエクスポート * show surfaceとすると見やすい * File -> Save Image as -> VRML 2... 2. MeshLabで加工 できた形式は頂点と面数が大抵ものすごく多い。さらに分子模型も中に埋められている場合がある。プリントにも時間がかかるか、プリンタに送れないかしれない。そのためには、不必要な面および頂点を減らすとよい。 2.1 wrlファイルをimport File -> import meshで VRML2形式をインポート 2.2 頂点や面を減らす Filters -> Resampling, simpl
PyMOL 基本操作
タンパク質を表示する ファイルを開く File → Open からpdbファイルを開く リボン図を表示する 最初の状態では水分子を含めたすべての分子が表示されており、タンパク質はlines表示となっています。そこで、一度すべて非表示にしたうえでリボン図を表示します。 オブジェクトパネルより 1.Hide → all 2.Show → cartoon 非タンパク質分子を表示する cartoon表示ではタンパク質分子しか表示されないので、非タンパク質分子を選択して別途表示します。 External GUIより 1.Display → Sequence 2.目的の分子をクリックして反転 3.(sele)の Show → sticks セッションの保存、画像の保存 セッションの保存 External GUIより 1.File → Save session as 2.ファイルの種類PyMOL Ses
TechCrunch
This will mark Starliner’s second flight to the ISS: The first, an uncrewed mission called Orbital Flight Test-2, took place in May 2022. As part of its Q1 2024 earning release, Snap revealed that total watch time on its TikTok competitor, Spotlight, increased more than 125% year-over-year. Snapchat launched the TikTok-like feed in late
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