インターネットで実名でレスバしてたらISPの社長から脅迫された話。そして17年後… - rna fragments
「インターネット老人会 Advent Calendar 2023」3日目の記事です。 「インターネット老人会」ということで、今日は日本の商用インターネット接続サービスが始まった前後の頃の話をしたいと思います。 今日は fj の話をしようと思うがその前に… インターネットで必要なことはすべて NetNews で学んだ fj というバトルフィールド fj で議論した相手から脅迫される そして17年後… 因縁の再戦 最後に 今日は fj の話をしようと思うがその前に… インターネットと言えば今は Web *1 のことですが、Web が普及する以前、1990年代初頭から世界規模のネットコミュニティが既にあったことをご存知でしょうか。その名を NetNews といいます。 NetNews は一言で言うなら公開メーリングリストのようなものです。あるいは分散型掲示板とも言えるでしょうか。メッセージの形式
Mrs. GREEN APPLE「コロンブス」MV 問題、マジわけわかんねぇ (追記あり) - rna fragments
6月13日に大炎上の後、削除、謝罪に追い込まれた Mrs. GREEN APPLE (以下 Mrs. と略す)の曲「コロンブス」の MV の騒動なんだが、マジでわけがわからなかった。 いや、今時コロンブスを無邪気に偉人扱いでテーマにするのはアカンでしょうとか、そういうのはわかる。しかしそこまで？って最初は思ったけど、どうも海外向けに英語字幕まで付けてたって話を後から聞いて、それはさすがに… と。まあ、そのことだけで削除や謝罪に値すると言われれば、それはそうだな、と思う。 しかしこの炎上騒動、その点もさることながら、MV の映像表現を問題視する声が大きかったという印象がある。つまり映像に出てくるコロンブスたち(Mrs. のメンバーが扮する)が「猿」(類人猿らしき登場人物たち)に文明を伝えたり使役したりしているというのだ。 報道でも、「「サル」にふんした人たちに、馬の乗り方を教えたり人力車を引
【読売新聞】 新しい系統に属する可能性が高いＲＮＡウイルスを発見したと、筑波大などの研究チームが発表した。見つけたのは九州地方の高温酸性の温泉で、チームはウイルスを「ＨｓＲＶ（温泉ＲＮＡウイルス）」と名付けた。論文が、科学誌「ネイチ
RNA-seqデータ解析では、健常者と疾患患者、コントロールと薬剤刺激など、様々な発現変動遺伝子（DEG）を取得するかと思います。しかし、多変量となる遺伝子から手作業でDEGを抽出するのは大変です。 ここでは、DEGの抽出方法としてDEseq2ライブラリを用いて行う方法を解説します。 これによりRNA−seqデータから簡単にDEGが抽出できるようになります。ぜひ挑戦してみましょう。
ローカル上でRNA-seq解析環境の整え方がわからない方はいませんか？また自分のPCが推奨環境のものではなく、環境依存のエラーに困っている方はいませんか？ そのような方に向けてブラウザ上でRNA-seq解析データの定量ができるRaNA-seqをご紹介いたします。 RaNA-seqを使える様になると自分のPC上でRNA-seq環境を整える必要がなく環境依存エラーの解決をしなくても良くなります。是非やってみましょう！ RaNA-seqとは？ RaNA-Seqは、RNA-Seqデータを迅速に解析するためのオープンなバイオインフォマティクスツールです。FASTQファイルの定量、品質管理メトリクスの計算、差次的発現解析の実行、機能解析による結果の解釈を可能にする完全な解析を数分で実行します。手持ちのFastqファイルをRNA-seq解析の複雑な環境構築なしでブラウザ上で実行できることで定評があります
【シングルセル】Single Cell RNA-seqデータを用いた疑似バルクRNA-seq解析を行う方法【pseudo bulk analysis】 - LabCode
擬似バルク RNA-seq 解析（pseudo bulk RNA-seq analysis）とは？ 疑似バルク解析（pseudo bulk analysis）とは、シングルセルRNA-seqデータを用いて、bulk RNA-seqの解析手法を適用できるようにすることです。以下でもう少し詳しく説明します。 バルクRNA-seqとは バルクRNA-seqは、多数の細胞から抽出されたRNAをまとめて解析します。比較的安価で、広く利用されています。scRNA-seqと違って全体のRNA発現プロファイルを提供しますが、個々の細胞の違いは反映されません。そのため大規模な発現変動の解析、遺伝子発現のパターンの特定、疾患関連遺伝子の発見などに適しています。 疑似バルク解析とは 疑似バルク解析（pseudo-bulk analysis）は、シングルセルRNA-seq（scRNA-seq）データを用いて、バル
Cytoscapeの魅力の一つは、その豊富なプラグイン（アプリとも呼ばれる）です。これらのプラグインは、ユーザーが特定の分析やビジュアライゼーションのニーズに合わせてCytoscapeの機能を拡張することを可能にします。 Cytoscapeのプラグインリストは、Cytoscape App Store（http://apps.cytoscape.org/）で確認でき、Cytoscape開発チームによって知られているすべての公開プラグインがリストアップされています。 今回は遺伝子発現データの可視化、ネットワーク解析、および生物学的経路の探索を助ける代表的なプラグインを解説したいと思います。 Cytoscapeをインストールする まずはCytoscapeをインストールしていきましょう。以下のサイトにアクセスしてダウンロードしてください。 https://cytoscape.org/ ダウンロード
きのうのアクセス数を見て、イベルメクチンやレプリコンワクチンのことに 関心がある方が多いのかな？と感じましたけど、どうなんでしょう。 イベルメクチンは、日本ではCovid19の治療薬としては病院で処方してもらえないので 自己責任で個人輸入で入手しているというわけです。 コロナ流行当初は治療目的で病院で処方出来ていたようですけど いつの間にか薬そのものが病院でさえ入手困難になったようです。 おかしな話です。 イベルメクチンは 北里大学の大村智教授が静岡県の川奈ゴルフ場の土壌の中から発見された細菌からつくられています。 それでノーベル賞を受賞されています。 駆虫剤ですけど、実はそれだけではなくいろんな効果があるらしいんです。 Covid19の治療効果、実績についての情報は表に出てき難いですが 長尾先生、佐々木みのり先生、中村篤史先生、北海道の鹿先生、が示してくださった情報を見ました。 でも、も
未知の微生物が発見されたかもしれない研究をみて2014年に同じテーマで「みなしごRNA」と題して応募したが「存在しなかったらどうする？」と落とされた話
GIGAZINE(ギガジン) @gigazine 科学者が「正気の沙汰じゃない」と口走る新発見、人体から発見されたウイルスでもバクテリアでもない謎の生物的存在「オベリスク」とは？ gigazine.net/news/20240207-… リンク GIGAZINE 科学者が「正気の沙汰じゃない」と口走る新発見、人体から発見されたウイルスでもバクテリアでもない謎の生物的存在「オベリスク」とは？ 腸内細菌などのバクテリアとは違って、ウイルスは独自に増殖することができず代謝もしないことから、長年にわたり生物か非生物か議論の的になっています。そんなウイルスよりもさらに小さく単純ながら、これまで発見されているものとは明らかに異なることから、新しく「オベリスク」との名称が与えられた存在の発見についての論文が発表され、科学界から大きな注目を集めています。 230 users 301 Yuki FURUSE
https://mstdn.jp/@Mitsuwo/110775297023243891 「へーmastodonのモデレーションも問題あるなあと思って読んでたら、 ( Д ) ﾟ ﾟってなった “児童虐待資料のかなりの部分は日本のネットワークからのもの” また日本のエロ表現の自由のせいかよ！！」 「児童虐待資料」(原文では child-abuse material) は、日本の法律では実在児童に限るので漫画やアニメは含まれないわけだけど、法規制の立て付けとしては妥当だと思う。 CGについても実在児童をモデルとしたもの(過去の児童ポルノ写真集をCGで再現したもの)は有罪判決が出ている。 問題はAI生成のCGの場合、本物の写真と区別がつかない精度で描写されるので、これを許してしまうと本物の児童ポルノ犯の「これはAI生成です」って言い逃れを反証するのが極めて困難になることや、児童ポルノ発見を端
『Mrs. GREEN APPLE「コロンブス」MV 問題、マジわけわかんねぇ (追記あり) - rna fragments』へのコメント
エンタメ Mrs. GREEN APPLE「コロンブス」MV 問題、マジわけわかんねぇ (追記あり) - rna fragments
〈表現〉と〈表象〉(Mrs. GREEN APPLE「コロンブス」MV 問題 その2) - rna fragments
先日 Mrs. GREEN APPLE「コロンブス」MV 問題について結構長文のエントリを書いた。 最初は誰にも読んでもらえなかったと思っていたが、週明けにどこかのニュースアプリに掲載されたらしく、いつもはアクセス数100件/日以下の当ブログが、17日には3万件/日というアクセスがあった。 おかげで結構酷いことも言われたが、ごく一部の人には真面目に、あるいは好意的に読んでもらえたようだ。いいがかりや悪口の類については個別の応答はしないが、「擁護」ではないこと、MV を解釈するだけならあのレベルの「分析」は必要ないというのは言っておきたい。 エントリに書いたように、コロンブスを偉人として扱うテーマの取り方だけでも削除・謝罪に値すると思うし、僕から見ても表象の選択・組み合わせ・噛み合わせと言った点で誤解される余地は少なからずあり、不適切な表現だったと思う。あの MV 自体を「擁護」する気はさら
j次のブックマーク
k前のブックマーク
lあとで読む
eコメント一覧を開く
oページを開く
「温泉ＲＮＡウイルス」雲仙や霧島で見つかる…７０度以上で存在し「段違いに新しい発見」
【R】DEseq2を用いた RNA-seq解析データの発現変動遺伝子抽出【RNA-seq】 - LabCode
【RNA-seq】RaNA-seqを用いたRNA-seq発現量の定量【バイオインフォマティクス】 - LabCode
【RNA-seq】Cytoscapeの使い方【ネットワーク解析】 - LabCode
今までもこれからも m-RNAワクチンには反対です - IRO☆IRO
なんばりょうすけ (@rna@mstdn.jp)
谷口研究室（北海道大学医学部 統合病理学教室） on X: "ミトコンドリアDNAは母親由来であり、父親からは受け継がれません。しかし、父親の食事やミトコンドリアの質を感知するミトコンドリアRNAが精子から卵子に送られ、子孫の代謝に影響を与えるという驚くべき論文が今週のNature誌に報告されました。 https://t.co/MtiVkRXx7a"