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  RでUMINの臨床試験データを取得する - 盆栽日記

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  • テクノロジー
  • 2019/11/22

  Rひとりアドベントカレンダー22日目です。終盤に差し掛かってまいりました。 さて、国内の臨床試験はUMIN-CTRに登録するようになっている（特定臨床研究はjRCTだったりするが）。 そしてUMIN-CTRはスナップショットとして登録情報をCSVで公開している。 https://www.umin.ac.jp/ctr/csvdata.html 列名が２段になっているのでとりあえず１行目はスキップして２行目を列名として読み込むようにする。 library(readr) ctr <- read_csv("https://upload.umin.ac.jp/ctr_csv/ctr_data_j.csv.gz", skip = 1) ただし、１行目とひもづけることでユニークになる列名も多数あるようで列名が重複してるぜというメッセージが出るので注意。 ちゃんと分析に使いたい場合は自分で列名を綺麗にした

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