2021年12月11日のブックマーク (2件)

  • ぼうのブログ

    sayamatcher
    sayamatcher 2021/12/11
    “Wise2で直接DNA-protein alignment / EBIのdirector Ewan Birneyによる、DNA-protein配列をpairwise alignmentするプログラムWise2はBiocondaにあってインストールは簡単だが、動かすのはちょっと大変かも”
  • TogoDX/human を使ってヒトのデータベースを統合的に探索、俯瞰、抽出する

    TogoDX (Togo Data eXplorer: トーゴーディーエックス)は、生命科学分野における様々なデータベースを統合的に探索し、俯瞰するためのフレームワークで、ライフサイエンス統合データベースセンター (DBCLS)/バイオサイエンスデータベースセンター (NBDC)が開発を進めています。膨大な情報を多様な属性 (attribute) によって柔軟に絞り込み、必要な情報を抽出できる新しい仕組みを目指しています。このような仕組みを実現するために技術基盤としてRDF (Resource Description Framework) 規格を採用し、異なるデータベースに由来する多数のデータセットを整理し直しています。 TogoDX/Human は、国内外のデータベースから収集・統合した、ヒトに関する遺伝子、タンパク質、化合物、疾患などの情報をワンストップで探索することができます。現在、

    TogoDX/human を使ってヒトのデータベースを統合的に探索、俯瞰、抽出する
    sayamatcher
    sayamatcher 2021/12/11
    “TogoDXは生命科学分野における様々なDBを統合的に探索し、俯瞰するためのフレームワーク/膨大な情報を多様な属性によって柔軟に絞り込み、必要な情報を抽出できる新しい仕組みを目指しています” #togotv #DBCLS #NBDC