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Pajek入門 －巨大ネットワーク分析用フリーソフトウェア－: それゆけBioinformatics
Pajek official site Developed by Vladimir Batagelj and Andrej Mrvar at the University of Ljubljana, Slovenia. 1. Pajek概要 Pajekは、フリーのWindows (32 bit)用の巨大なネットワーク分析プログラムである。 Yeast two-hybrid (Y2H)法によるタンパク質－タンパク質相互作用ネットワークのような大量データ(多数のタンパク質がある)をネットワーク分析する際に、行列表示に基づく標準的なネットワーク分析ツールで効率的に扱うことは非常に困難である。大量なネットワークデータに対してPajekが出来ること・目指すゴールは以下の通りである。 (1) 巨大なネットワークを小さなネットワークへと分離・抽出する (2) ユーザにネットワークの強力な視覚化ツールを提
pajek: それゆけBioinformatics
去る1月16日にネットワーク分析プログラムpajekがバージョンアップしたようです。昨今ネットワーク分析が注目されておりますので、興味のある方は是非使用してみてくださいませ。ただしWindowsのみ。 関連記事 Networks / Pajek Program forLarge Network Analysis http://vlado.fmf.uni-lj.si/pub/networks/pajek/ それゆけBioinformatics: pajek http://bioinfo-goto.seesaa.net/category/67276.html (以前に、Pajekのごく初歩的な扱いを解説しました) それゆけBioinformatics: graphviz http://bioinfo-goto.seesaa.net/category/67259.html (Pajekのような分
Bioconductor - Wikipedia
Bioconductor is a free, open source and open development software project for the analysis and comprehension of genomic data generated by wet lab experiments in molecular biology. Bioconductor is based primarily on the statistical R programming language, but does contain contributions in other programming languages. It has two releases each year that follow the semiannual releases of R. At any one
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