Tutorialsに関するwakutekaのブックマーク (32)

  • Redirecting…

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  • Web API for Biology

    ヒトの遺伝子の頻度解析ワークフロー ワークフローの目的 アルコールから生成される有毒なアセトアルデヒドを無毒な酢酸に変える酵素の遺伝子 ALDH2 は、1塩基違うだけでその酵素の働きが弱くなってしまうことが知られています。そして、この遺伝子は、日人を含むアジアでは働きが弱いタイプの遺伝子の人が多いが、欧米人は酵素の働きが弱いタイプの遺伝子の人はほとんどいないと言われています。そこで、DDBJやdbSNPのデータを取得し、アジア人や欧米人でどのように分布が異なるか検証します。 ワークフローの構成 ワークフローは以下のアクティビティ図で示した手順で構成されます。アクティビティ図はUMLの図の1つであり、世界中で業務分析などに使われています。詳細はこちらをご覧ください。 ワークフローの対象 ヒトの遺伝子名 (ALDH2, LCT, OCA2 など) ワークフローの結果(更新日 2009

  • Debugging with GDB - Table of Contents

    The GNU Source-Level Debugger Eighth Edition, for GDB version 5.0 March 2000 Richard Stallman, Roland Pesch, Stan Shebs, et.al. GDBの要約 フリー・ソフトウェア GDBに貢献した人々 GDBセッションのサンプル GDBの起動と終了 GDBの起動 ファイルの選択 モードの選択 GDBの終了 シェル・コマンド GDBコマンド コマンドの構文 コマンド名の補完 ヘルプの表示 GDB配下でのプログラムの実行 デバッグのためのコンパイル ユーザ・プログラムの起動 ユーザ・プログラムの引数 ユーザ・プログラムの環境 ユーザ・プログラムの作業ディレクトリ ユーザ・プログラムの入出力 既に実行中のプロセスのデバッグ 子プロセスの終了 マルチスレッド・プログラムのデバッグ マルチ

    wakuteka
    wakuteka 2011/05/03
    ver5.0とちょっと古いけど。
  • ロバスト推測、M推定、そしてrobustbase | wrong, rogue and log

    統計数理研究所が昨年10月に立川の新立川航空機立川工場の向い方面に引越してきたので、自宅からドアツードアで45分程度で行くことができるという気軽さから、時間を見つけてはちょくちょくと統数研の公開講座やセミナーに参加している。 今日はM推定について講義してくれる以下の公開講座に参加してきた。 ロバスト推測 ~外れ値への対処方法~ http://www.ism.ac.jp/lectures/22b.html 統数研の職員の方が懇切丁寧に教えてくれて、いままで"Modern Applied Statistics with S (MASS)"のM estimatorやresistant regressionの項目を読んでもさっぱりわからなかったM推定の初歩の原理がわかった。講義時間は4時間50分くらいとたっぷりあり、資料も用意してくれて、お値段なんと2500円という破格である。ある意味、あり得ない

    ロバスト推測、M推定、そしてrobustbase | wrong, rogue and log
  • tutorials [Auton Lab]

    By: Jeff Schneider, Mary Soon Lee, Andrew Moore Description: A tutorial on using the Windows Vizier software, which provides a GUI for doing fast and autonomous locally weighted learning and nearest neighbor style learning. The Vizier software itself is available for free download at http://www.cs.cmu.edu/~awm/vizier, where you will find more details. Description: This is a link to the Auton Codin

  • C++入門

    C++入門 基礎知識は仮定しません あなたは 人目のお客さんです。 ゆっくりしていってください。 C++入門1   プログラミングの基礎知識 C++入門2   coutを使った出力 C++入門3   cinを使った入力 C++入門4   オブジェクト指向について C++入門5   クラスを作ろう C++入門6   クラスを作ろう(補足) C++入門7   クラスの練習 C++入門8   コンストラクタの引数 C++入門9   クラス間の関係 C++入門10  乱数 C++入門11  while文とfor文 C++入門12  値を戻す関数 C++入門13  値を戻す関数の例 C++入門14  パブリックとプライベート C++入門15  継承 C++入門16  継承の練習 C++入門17  さらに継承 C++入門18  デストラクタ C++入門19  配列 C++入門20  ポインタ C++

  • RStudioがすごそうなので使ってみた - As a Futurist...

    最近出たプロダクトで「RStudio」というのがあるんですが、試しに使ってみてあまりにも洗練されてて感動したのでエントリにしました。 RStudio って何? そもそもなにするものかというと、統計分析・グラフ作成プログラミング言語である R の IDE みたいなもので、PC 上でスタンドアローンで動かすこともできますし、サーバ上のリソースをブラウザ越しに扱うこともできます。スタンドアローンの方はすでに WindowsMac などひと通りバイナリありますし、サーバの方も Ubuntu/CentOS はバイナリあって楽々使えるようです。 ちなみに最初 Amazon Linux で動かしてみようと思ってたんですが、Amazon Linux は微妙にパッケージを新しくした CentOS みたいな感じなので各所でライブラリのバージョンがずれてて依存関係で破滅的になりました。だったら make

    RStudioがすごそうなので使ってみた - As a Futurist...
  • T1強調画像とT2強調画像の使い道 - MRIのすべて(all about MRI)

    ここで気分を変えて,実際にT1強調画像や,T2強調画像が,どのような目的に使われるかを紹介しましょう. 上に示す画像は,私の研究室で開発したコンパクトMRI(手専用MRI)で,H君が,撮ってくれた私の左手の画像です.左の画像が,T1強調画像,右の画像がT2強調画像です. T1強調画像は,主に,解剖学的構造,すなわち,どのような組織がどのような形状をしているかを,比較的高い分解能で示す画像です.GRASSという方法で撮られたものですので,スピンエコーによるT1強調画像とは少し異なりますが,コントラストは,ほぼ同じと考えても結構です. T2強調画像は,主に,病変部を描出する画像で,病変が起こった部分が,高い輝度で現れます.このため,臨床診断にはきわめて有用な画像です.なお,この画像では,皮下脂肪や骨髄などの脂肪組織は,「脂肪抑制」という手法で抑制されています. 上の画像は,私の左中手骨に,bo

    T1強調画像とT2強調画像の使い道 - MRIのすべて(all about MRI)
  • 認証がかかっています

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  • 神経科学・心理学研究者のためのMATLAB講座

    「母性看護学は、女性の一生を通した性と生殖に関わる健康の促進に向け、看護が必要な状況や援助方法について理解する科目です。なかでも、妊娠、出産、育児は女性やその家族にとって大きな出来事です。 1年次には周産期(妊娠・出産・育児期)にある女性とその家族を身体的側面及び心理社会的側面から総合的に理解して、母性看護の役割を学ぶとともに、周産期に生じやすい倫理的問題について考えます。2年次には、周産期にある母子と家族のアセスメントと援助の具体的な方法について、講義や演習を通して学び、3年次にはそれまでの学びを総括し、実習を通して健康課題のある周産期の母子と家族への看護について学びます。4年次には総合実習として、それぞれの学生が一番関心の高い部門で、改めて高度な実習を展開します。そのうち母性看護学では、産科病棟のほか新生児集中治療部(NICU)でも実習しています。 *学部教員が臨地実習関連施設職員等

    wakuteka
    wakuteka 2011/04/20
    光トポグラフィ
  • AWK Users JP :: awk で複数ファイルをオープン

    wakuteka
    wakuteka 2011/04/19
    "どの awk でも動作するようにするのであれば、基本的には close() を行う必要があります"
  • ソフトウェア開発の備忘録 - tips/26

  • Learning Qt

  • オブジェクト指向プログラミング - 2009年度春学期 オブジェクト指向プログラミング(中澤クラス)

    2009-06-22 臨時ファイル置き場 2009-06-08 Qt Creator/SFCFrameworkの使い方 オブジェクト指向プログラミング Qt/マルチメディア環境の設定 2009-05-25 ミニプログループ Qt Creator/GUIの作成 Qt/QString文字化け対策 2009-05-19 変数のスコープとthis printf()/coutを使いたい人へ 課題/課題3解説(第4回) 課題/課題3解答(第4回) 課題/課題2解答(第3回) 2009-05-18 SFCFramework/SFCObject APIドキュメント virtualの意味とその挙動 2009-05-14 課題/課題2解説(第3回) 課題/課題1解答(第2回) 課題/課題1解説(第2回) 2009-05-13 課題/課題1解説(第2回)/Line.cppのリファクタリング 2009-05-12

  • Unix :: コマンド / sort [Tipsというかメモ]

    以下のような「hoge.txt」があるとして、いろいろなソートを試してみます。 % less hoge.txt 1 789 fff 120000 1,6 2 789 ccc 16 2,5 3 456 ddd 1100000 3,4 4 456 aaa 1400 4,3 5 123 eee 13000 5,2 6 123 bbb 150 6,1 % sort -r < hoge.txt 6 123 bbb 150 6,1 5 123 eee 13000 5,2 4 456 aaa 1400 4,3 3 456 ddd 1100000 3,4 2 789 ccc 16 2,5 1 789 fff 120000 1,6

  • http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/info/overview

  • Swingを使ってみよう

    Java を使ってグラフィカルなコンポーネントを使ったアプリケーションを開発する為に、 Java では Swing が用意されています。ここでは Swing の各コンポーネントの使い方を順にサンプルを作りながら試してみます。 Java を使ったプログラミング方法については「Java入門」を参照されてください。

    Swingを使ってみよう
  • Genome Browser FAQ

  • Genome Browser Custom Tracks

    Displaying Your Own Annotations in the Genome Browser The Genome Browser provides dozens of aligned annotation tracks that have been computed at UCSC or have been provided by outside collaborators. In addition to these standard tracks, it is also possible for users to upload their own annotation data for temporary display in the browser. These custom annotation tracks are viewable only on the mach

  • MacBookにpearをインストールしたメモ - maru.cc@はてな

    Ethnaのテストを動かそうとしてローカルの環境を整えていたら、simpletestが入っていなくて、さらにpearコマンドで入れようとしたら pearが入っていなかったので、インストールをしてみた。 ローカルの MacBookでは、phpもソースインストールではないので、元々入っているやつをそのまま使っている。 普段使っている CentOSならば、yumで、と行きたいところだが、Macなので、MacPortsかなーと思って探してみたが、それらしいのは無かった。 $ port search php $ port search pear そこでぐぐって出てきた、こちらのサイトを参考に入れてみた。ほぼそのままですが。 「Mac OS 10.5にpearをインストール│素晴らしき哉、人生!」 今回の環境はこちら。 Mac OS X 10.5.5 $ php -v PHP 5.2.6 (cli)

    MacBookにpearをインストールしたメモ - maru.cc@はてな