Sep 8 2011 1 トランスクリプトーム解析の今昔 なぜマイクロアレイ? なぜRNA-Seq? 東京大学大学院農学生命科学研究科 アグリバイオインフォマティクス教育研究ユニット 門田 幸二(かどた こうじ) http://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp/~kadota/ kadota@iu.a.u-tokyo.ac.jp Contents トランスクリプトーム解析の概要 各手法の長所・短所 マイクロアレイ、RNA-Seq、RT-PCRやSAGE 実データの比較(RNA-Seq vs. マイクロアレイ) RNA-Seqデータの正規化(の基礎) マイクロアレイと異なる点(遺伝子の配列長による結果の偏り) 基本的な考え(RPKM) 2Sep 8 2011 ねらい 各種トランスクリプトーム解析手法の長所、短所を理解し、 その上でなぜ次世代シーケンサ