第一回 Galaxy 開発者会議 http://bitbucket.org/galaxy/galaxy-central/wiki/DevConf2010 Lire moins
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Galaxyは主に生物系のデータ(ゲノムなど)を解析するための環境です。・ウェブ上のインターフェースで簡単に操作できる。・解析方法をワークフローとして保存できる。・ワークフローや解析履歴を他の人と共有できる。といった特徴があります。 今回は、DBCLSがGalaxyに独自の機能を組み込んだDBCLS Galaxyを使用して、マイクロアレイの実験データに別のプローブIDを付加する方法を紹介します。また、IDを付加するためのワークフローを作成し、以後に別のIDを容易に付加できるようにする方法を紹介します。そして、解析の結果・方法やワークフローを他人と共有する方法を紹介します。Galaxyを紹介した他の統合TV(DBCLS Galaxyの利用法とGalaxyを使い倒す 特定の転写因子予測結合領域と遺伝子上流領域の「交差点」をリストアップする)も御覧ください。
はてなグループの終了日を2020年1月31日(金)に決定しました 以下のエントリの通り、今年末を目処にはてなグループを終了予定である旨をお知らせしておりました。 2019年末を目処に、はてなグループの提供を終了する予定です - はてなグループ日記 このたび、正式に終了日を決定いたしましたので、以下の通りご確認ください。 終了日: 2020年1月31日(金) エクスポート希望申請期限:2020年1月31日(金) 終了日以降は、はてなグループの閲覧および投稿は行えません。日記のエクスポートが必要な方は以下の記事にしたがって手続きをしてください。 はてなグループに投稿された日記データのエクスポートについて - はてなグループ日記 ご利用のみなさまにはご迷惑をおかけいたしますが、どうぞよろしくお願いいたします。 2020-06-25 追記 はてなグループ日記のエクスポートデータは2020年2月28
はてなグループの終了日を2020年1月31日(金)に決定しました 以下のエントリの通り、今年末を目処にはてなグループを終了予定である旨をお知らせしておりました。 2019年末を目処に、はてなグループの提供を終了する予定です - はてなグループ日記 このたび、正式に終了日を決定いたしましたので、以下の通りご確認ください。 終了日: 2020年1月31日(金) エクスポート希望申請期限:2020年1月31日(金) 終了日以降は、はてなグループの閲覧および投稿は行えません。日記のエクスポートが必要な方は以下の記事にしたがって手続きをしてください。 はてなグループに投稿された日記データのエクスポートについて - はてなグループ日記 ご利用のみなさまにはご迷惑をおかけいたしますが、どうぞよろしくお願いいたします。 2020-06-25 追記 はてなグループ日記のエクスポートデータは2020年2月28
Galaxyツールを作る Galaxyにツールを組み込むには大きく分けて以下の二通り方法がある。 UNIXコマンドやスクリプトをGalaxyツールとして組み込む方法 外部のサイトをGalaxyの内部にツールとして組み込む方法 コマンドを利用したGalaxyツールの作り方 Galaxy ツールを作る/コマンドを利用したGalaxyツール を参照 外部サイトと連携を行うGalaxyツールの作り方 Galaxy_ツールを作る/外部サイト連携Galaxyツール を参照 GalaxyツールTips ひとつのツールから複数データセットを出力 ツールの設定ファイル内のoutputs要素へ複数のdata要素を定義することで、ひとつのツールから複数のデータセットを出力させることができる。また、ワークフロー上ではそれぞれの出力を次のツールの入力へと接続することができる。 設定ファイルのサンプル(multi_o
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