Galaxyツールを作る Galaxyにツールを組み込むには大きく分けて以下の二通り方法がある。 UNIXコマンドやスクリプトをGalaxyツールとして組み込む方法 外部のサイトをGalaxyの内部にツールとして組み込む方法 コマンドを利用したGalaxyツールの作り方 Galaxy ツールを作る/コマンドを利用したGalaxyツール を参照 外部サイトと連携を行うGalaxyツールの作り方 Galaxy_ツールを作る/外部サイト連携Galaxyツール を参照 GalaxyツールTips ひとつのツールから複数データセットを出力 ツールの設定ファイル内のoutputs要素へ複数のdata要素を定義することで、ひとつのツールから複数のデータセットを出力させることができる。また、ワークフロー上ではそれぞれの出力を次のツールの入力へと接続することができる。 設定ファイルのサンプル(multi_o
An image myself and Lee Byron created in 2008 for The Visual Miscellaneum using Facebook status updates. (The follow-up book Knowledge is Beautiful is out now.) Christmas too cruel. Hahah! Still makes me chuckle. The infographic mega-tome, Knowledge is Beautiful, is out now Find out more.
歯車というと、多くの人は三角のとんがりを円周に沿って刻み付けた、いわゆるギザギザの円を思い浮かべるでしょう。しかし実を言うと、私たちの身の回りによく使われている歯車のほとんどはそうなっていない。歯車を三角の歯で作ると、ちょっとした不都合があるのです。 二つの歯車のお互いの歯が三角だとしましょう。まっすぐ向き合っている時は斜面と斜面がぴったり合っているので問題ありません。しかし、歯車が動いて離れて行くときに、その尖った先端が他方の歯の斜面をこすります。歯と歯が出会うときも同じです。少し引っ掻くだけなのですが、時計の歯車のように毎日何百回も出会い続けたり、エンジンのように一分間に何千回も出会う歯車では、お互いに少しずつ削り合って、徐々に大きな損傷になります。 そしていつの間にか隙間ができて、ごつごつと衝突するようになり、ますますお互いを傷つけ合って壊れてしまいます。毎日の小さな衝突が、積もりに
FASTAファイルをアノテーションや配列でgrepする事は度々あるのですが,シェルのgrepだと合致した行だけが出てきて,そのアノテーションを含む配列が何であったか,あるいは,その配列を含む配列の注釈は何かを調べるには一手間必要です.以下のスクリプトは,FASTAを検索して,該当の(行ではなく)エントリを返すスクリプトになります. 最後のエントリが表示されないバグ,修正しました.@hinaichigoさん,ありがとうございます!!! 使い方 引数: FASTAフォーマットファイル オプション(特に指定しなければ,すべての電車がおくれます): -a: 検索範囲をannotationだけに絞ります -s: 検索範囲を配列だけに絞ります.例: % ruby grep_fasta.rb -a ATNEK5 TAIR9_cds_20090619 >AT3G20860.1 | Symbols: ATN
公 募 期 間 : 2010年11月1日 14時 〜 12月24日 12時 面 接 選 考 : 2011年1月中旬(予定) 採択課題決定 : 2011年1月下旬(予定) 研究開発開始 : 2011年4月
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