TM値計算用スクリプト - Loud Minority
BioRubyの中に見つからなかったので，書きました． BioPHPのhttp://www.biophp.org/minitools/melting_temperature/を参照，というかコピーしています．(ライセンスはGPL) コマンドラインから引数に配列を与えます． % ruby tm.rb TTGCTTTCGAACAGTAGACAACATTTGAGCGTTTACATCATTTAGACACAGAAGAAACAT {:tm=>67.6759141696788, :enthalpy=>-479.6, :entropy=>-1375.14333912341}#!/usr/bin/ruby require 'pp' def nnmethod(seq, conc_primer, conc_salt, conc_mg) array_h = Hash.new array_s = Hash.new
BioRuby の使い方
BioRuby は国産の高機能オブジェクト指向スクリプト言語 Ruby のための オープンソースなバイオインフォマティクス用ライブラリです。 Ruby 言語は Perl 言語ゆずりの強力なテキスト処理と、 シンプルで分かりやすい文法、クリアなオブジェクト指向機能により、 広く使われるようになりました。Ruby について詳しくは、ウェブサイト http://www.ruby-lang.org/ や市販の書籍等を参照してください。 BioRuby を使用するには Ruby と BioRuby をインストールする必要があります。 Ruby のインストール Ruby は Mac OS X や最近の UNIX には通常インストールされています。 Windows の場合も１クリックインストーラや ActiveScriptRuby などが 用意されています。まだインストールされていない場合は http:
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