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Rで解析：WHO公開のデータを取得！「WHO」パッケージ

WHO(世界保健機関)が公開しているデータをAPIを利用して取得するパッケージです。参考までに2008年のBMI30以上の男性データを取得し、世界地図にプロットする例を紹介します。なお、世界地図へのプロットは「rworldmap」パッケージを利用しています。パッケージバージョンは0.1。実行コマンドはR version 3.2.2で確認しています。パッケージのインストール下記、コマンドを実行してください。 #パッケージのインストール install.packages("WHO")実行コマンド詳細はコメント、パッケージのヘルプを確認してください。 #パッケージの読み込み library("WHO") #利用できるデータの情報を取得:get_codesコマンド SummaryCodes <- get_codes() #CSVでデータを作業フォルダに出力 write.csv(Summary

feellucky 2016/02/06

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Rで解析：PubMedでの情報収集がかなり簡単です「easyPubMed」パッケージ

NCBIデータベースをRから操作するパッケージはいくつか存在しますが、本パッケージはPubMedデータベースから情報を収集するのに特化したパッケージです。かなり簡単に情報を収集することが出来ます。実行コマンドでは検索クエリに”r statistical software”を指定し、取得したデータをGoogleスプレッドシートへアップロードと「xlsx」ファイルで保存する例を紹介します。パッケージバージョンは2.13。実行コマンドはR version 4.2.2で確認しています。パッケージのインストール下記、コマンドを実行してください。 #パッケージのインストール install.packages("easyPubMed")実行コマンド詳細はコメント、パッケージのヘルプを確認してください。 #パッケージの読み込み library("easyPubMed") #検索クエリを指定 #pub

feellucky 2016/01/16

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Rで解析：政府統計の総合窓口(e-Stat)のAPIを利用したデータの取得例

政府統計の総合窓口(e-Stat)で提供しているデータをRからAPIを利用して取得する例です。API利用にはホームページでの利用登録が必要です。利用登録は下記URLにアクセスしてください。簡単にAPI利用に必要なアプリケーションIDが取得できます。・利用登録のURL http://www.e-stat.go.jp/api/regist-login/ リクエストURLやパラメータなどのAPI仕様は下記URLを参考にしてください。実行コマンドのコメントと見比べれば応用的な利用ができると思います。なお、実行コマンドはAPIのバージョンを2.0、6つあるリクエストURLから「データカタログ情報取得」を利用しています。・政府統計の総合窓口（e-Stat）のAPI 仕様 http://www.e-stat.go.jp/api/e-stat-manual/ 実行コマンドはR version 3.2