うつ病性障害と不安障害における再発の診断的不安定性と再発率への影響 - 井出草平の研究ノート
pubmed.ncbi.nlm.nih.gov Scholten, W. D., Batelaan, N. M., Penninx, B. W. J. H., Balkom, A. J. L. M. V., Smit, J. H., Schoevers, R. A., & Oppen, P. V. (2016). Diagnostic instability of recurrence and the impact on recurrence rates in depressive and anxiety disorders. Journal of Affective Disorders, 195, 185–190. https://doi.org/10.1016/j.jad.2016.02.025 要約 背景 うつ病と不安障害は高い有病率を持ち、個人や社会に大きな負担をかける。これらの障
地球内核の自転が本当に遅くなっていると判明！【Nature誌】 - ナゾロジー
かなり確かな情報です。 アメリカの南カルフォルニア大学（USC）で行われた研究によって、地球の内核の回転速度が減速しており、2008年を境に地球表面からみて逆転しているような動きになったことが示されました。 地球内核の回転速度についてはこれまでさまざまな研究が行われてきましたが、新たな研究では内核を貫通する地震波を分析に使用しており、説得力のある結論となっています。 研究者たちは内核の減速を示す地震データが複数もみつかっており「内核が減速している」という結果はほぼ確実であると述べています。 いったいどんな仕組みが地球の内核を減速させていたのでしょうか？ 研究内容の詳細は2024年6月12日に「Nature」にて発表されました。
ロジスティックLasso回帰の安定性選択(Stability Selection)[R] - 井出草平の研究ノート
安定性選択(Stability Selection)について。 ides.hatenablog.com データは説明はこちら。 ides.hatenablog.com データの作成と前処理 library(dplyr) url <- "https://archive.ics.uci.edu/ml/machine-learning-databases/heart-disease/processed.cleveland.data" column_names <- c("age", "sex", "cp", "trestbps", "chol", "fbs", "restecg", "thalach", "exang", "oldpeak", "slope", "ca", "thal", "num") heart_data <- read.csv(url, header = FALSE, col
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短歌ブームの差異と反復 – 砂子屋書房 月のコラム
みなさまごきげんよう。新年度、2024年度がはじまりました。年末と年度末に挟まれた1月から3月までの期間はその年の準備運動のようで、毎年不思議な気持ちになります。 ところで1月のコラム冒頭では、私たちの暮らす時間を意味づけている「紀元」について触れましたが、その際は話の都合上、「紀年法」と「暦法」をきちんと区別しませんでした。「紀年法」というのは、西暦紀元や元号、干支えとのように、年を数えるための方法を提供するものです。対して「暦法」というのは、時間の流れのうち、いつからいつまでをひとまとまりの年として定めるのか教えてくれます。この時期にちょっとだけ意識される不思議さというのは、後者つまり暦法のズレに由来しています。私たちは二重の暦の中で生きています。地域によっては旧暦も意識するので、三重の暦法で生活することもあるでしょう。 教会通いをしていると、1月1日起算の伝統的な暦と、4月1日起算の
ルームエアコンの普及率へのモデルフィッティング[R] - 井出草平の研究ノート
「主要耐久消費財の普及率」の推移のデータを用いて、ルームエアコンの普及率へのモデルフィッティングを行う。 https://www.e-stat.go.jp/stat-search/files?page=1&layout=datalist&toukei=00100405&tstat=000001014549&cycle=0&tclass1=000001200820&tclass2=000001203960&tclass3val=0 データの読み込み data <- read.csv("air_conditioner.csv") 多項式回帰モデルのフィッティング library(ggplot2) poly_model <- lm(air_conditioner ~ poly(year, 3), data = data) data$poly_pred <- predict(poly_model,
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ランダム化された安定性選択（Randomized Stability Selection）[R] - 井出草平の研究ノート
安定性選択の方法の一つ。 ides.hatenablog.com ランダム化された安定性選択は、変数選択プロセスにランダム性を導入する方法であり、変数選択の安定性を向上させることを目的としている。この方法では、データを繰り返しサブサンプリングし、Lasso回帰を適用する。特徴として、各予測子に適用されるペナルティをランダムに変動させることがある。 予測子間の相関とは、ある変数が他の変数とどれだけ関係しているかを示す。例えば、体重と身長は一般的に相関がある。予測モデルを作成する際、複数の変数が互いに相関している場合、それらの変数の影響を正確に測定するのが難しくなる。ランダム化しない安定性選択では、相関のある予測子が一緒に選ばれないことがある。これは、相関のある予測子同士が互いに競合し、一方が他方を押しのけて選ばれないためである。 一方、ランダム化された安定性選択では、変数選択にさらなるランダ
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入れ子交差検証/Nested Cross-Validation[R] - 井出草平の研究ノート
入れ子交差検証（Nested Cross-Validation）は、モデルの性能評価とλの選定におけるバイアスを排除するための検証手法である。この方法は、外側と内側という比喩を用いて説明される。外側のクロスバリデーションと内側のクロスバリデーションの二重構造から成り立っている。具体的には、データセットを複数のサブセットに分割し、外側の反復でモデルの性能を評価し、内側の反復ループでλの選定を行う。 この手順を踏む理由は、一般的なk-foldクロスバリデーションの問題を克服するためである。k-foldクロスバリデーションでは、データセットをk個のフォールドに分割し、それぞれのフォールドを一度ずつテストデータとして使用し、残りのフォールドを訓練データとして使用する。この方法では、λの選定とモデルの性能評価が同じデータセットで行われるため、バイアスが生じる可能性がある。 λはモデルの性能評価によっ
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Lasso ホールドアウト法と変数選択と推定の安定性のシミュレーション[R] - 井出草平の研究ノート
クロスバリデーションの基本的な方法ホールドアウト法やり方と変数選択と推定の安定性のシミュレーションを行った。 n-fold クロスバリデーションがよくつかわれているため、ホールドアウト法はあまり使われないので実践向きではない。 今回は訓練データを70%、テストデータを30%と一番よく選ばれる比率で行った。 # 必要なライブラリの読み込み library(haven) library(dplyr) library(glmnet) library(caret) # データの読み込みと前処理 auto <- haven::read_dta("http://www.stata-press.com/data/r9/auto.dta") auto <- auto %>% drop_na() # 全カラムに対してNAがない行を抽出 auto$foreign <- as.factor(auto$forei
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高次元スパース線形モデルにおけるパラメータの信頼区間を構築するためのブートストラップLasso+部分リッジ法[R] - 井出草平の研究ノート
stat.paperswithcode.com HDCI（High-Dimensional Confidence Intervals）はは、Lasso回帰とRidge回帰の欠点を補うという点にある。 Lasso回帰は、変数選択を行う際に多くの変数の係数をゼロにするため、少ししか関連性のない変数が推計から排除される可能性がある。 Ridge回帰は、すべての変数を選択するため、多くの無関係な変数がモデルに含まれることになる。 HDCIは、まずLasso回帰で重要な変数を選択し、その後Partial Ridge回帰を用いてこれらの変数の係数を再推定することで、Lassoの変数選択の強みとRidgeのバイアス補正の強みを組み合わせてこの欠点を補正する方法といえる。 特に高次元スパース線形モデルの係数に対する信頼区間を構築するためという点が大きいようだ。高次元スパース線形モデルとは、説明変数の数が観
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Lassoで必ず独立変数に入れる変数を指定する[R] - 井出草平の研究ノート
こちらで利用したデータとコードを用いる。 ides.hatenablog.com データの準備 library(haven) library(tidyr) # データの読み込みと前処理 auto <- haven::read_dta("http://www.stata-press.com/data/r9/auto.dta") auto <- auto %>% drop_na() # 全カラムに対してNAがない行を抽出 # 目的変数と説明変数の準備 n <- nrow(auto) price <- auto$price X <- auto[, c("mpg", "rep78", "headroom", "trunk", "weight", "length", "turn", "displacement", "gear_ratio", "foreign")] X$foreign <- as.i
![Lassoで必ず独立変数に入れる変数を指定する[R] - 井出草平の研究ノート](https://cdn-ak-scissors.b.st-hatena.com/image/square/8cf854cfb44fd8b87b65d253ab7a4279b8880ce8/height=288;version=1;width=512/https%3A%2F%2Fogimage.blog.st-hatena.com%2F10328749687261244581%2F6801883189112604806%2F1717784335)
OpenAIがGPT-4の思考を1600万個の解釈可能なパターンに分解できたと発表
GPT-4などの大規模言語モデルは非常に高い性能を有していますが、各モデルがどのような思考を経て応答を出力しているのかは開発者ですら把握できていません。新たに、OpenAIが大規模言語モデルの思考を読み取る手法を開発し、GPT-4の思考を1600万個の解釈可能なパターンに分解できたことを発表しました。 Extracting Concepts from GPT-4 | OpenAI https://openai.com/index/extracting-concepts-from-gpt-4/ Scaling and evaluating sparse autoencoders https://cdn.openai.com/papers/sparse-autoencoders.pdf 一般的なソフトウェアは人間の設計に基づいて開発されているため、各機能の仕組みを理解した上で機能を修正したり安
医学と美術・デザイン領域が融合し、新たな文化の創造をめざす 昭和大学×多摩美術大学「メディカルデザイン研究所」スタート
本学と包括連携協定を結んでいる昭和大学に、本学の安次富隆教授が所長を務めるメディカルデザイン研究所が設置され、2024年5月27日（月）に同大横浜キャンパスにおいて開所式が行われました。 同研究所は「医術と美術の連携による医療現場のQOL※1の向上」をテーマに掲げて、医療現場における新しいサービスや器具の具現化などを目指します。 また、安次富隆教授はクロスアポイントメント制度※2を利用して両大学の教授として教育・研究活動に携わります。両大学の教員・スタッフで構成される所員はそれぞれの大学施設を相互利用して研究を行い、お互いの持っているものを出し合いながら、新しい大学のあり方を試行していきます。
喫煙は認知症の発症リスクを高める？ タバコとの関係性について解説 - lala a live(ララアライブ)│フォーネスライフ
喫煙は、脳卒中や心臓病、慢性的な肺疾患、糖尿病、慢性腎臓病といった生活習慣病のほか、多くのがんの発症原因になります。さらに、認知症の発症リスクとの関連も。タバコと認知症にはどんな関係があるのか、現在分かっている範囲で解説します。 目次 喫煙がもたらす認知症発症リスクとは 認知症の対策のためにぜひ禁煙を 喫煙を含めた生活習慣の見直しが認知症対策の第一歩 （監修者）矢島隆二 先生 総合リハビリテーションセンター みどり病院 副院長 兼 認知症疾患医療センター 副センター長 脳神経内科・認知症・総合内科等専門医。新潟大学医学部卒業後、高度急性期医療から地域の総合病院まで幅広く臨床経験を積み重ね、新潟大学附属脳研究所で認知症の研究を行い、医学博士号を取得。現在は認知症や神経難病を中心に、リハビリテーションにも重点を置いた神経内科の臨床現場で活動中。認知症や神経難病などの治験も行うかたわら、講演や執
二項ロジスティック回帰のLasso、Adaptive Lasso、Plugin Lassoを実行し比較する[Stata] - 井出草平の研究ノート
Rからデータをエクスポート まずはデータをつくるところから。 library(AER) data(CPS1985) library(dplyr) CPS1985 <- CPS1985 %>% mutate(married = case_when( married == "yes" ~ 1, married == "no" ~ 0)) library(rio) export(CPS1985, "CPS1985.dta") 今回は従属変数を結婚の有無にする。Stataでは従属変数はFactor型はダメなようなので、marriedは数値に置き換えてある。 Sataのdoファイル // データの読み込み use "CPS1985.dta", clear // OLSの推定値を計算し、その結果をols_modelとしてメモリに格納する logit married gender age wage ed
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パリ在住フランス人研究者が「日本語の起源」を追究する理由。文字なき時代の古（いにしえ）の姿はここまでわかった！ - 社会 - ニュース
週プレNEWS TOPニュース社会パリ在住フランス人研究者が「日本語の起源」を追究する理由。文字なき時代の古（いにしえ）の姿はここまでわかった！ 「日本語の祖先は、朝鮮半島から海を渡ってもたらされた説が有力です」と語るペラール氏 日本語は、大昔はどのような姿だったのか？ 文献の記録がない時代はどんな発音で、どんな単語があったのか？ そんな疑問に答える本が出た。それが『日本語・琉球諸語による歴史比較言語学』だ。 われわれが話す日本語の祖先の姿に迫る画期的な方法をまとめたこの本の著者のひとりは、なんとパリ在住のフランス人、トマ・ペラール氏。異国の言語学者が明らかにした、日本語の古の姿とは？ ■日本列島にはいろいろな言語があった ――なんだか難しそうな本ですが、タイトルの「歴史比較言語学」ってなんですか？ トマ・ペラール（以下、ペラール） 異なる言語どうしを比較したりすることで、言語がたどった歴
月の裏側の資源開発に不可欠な電力をわずか3機の人工衛星がワイヤレスで供給するアイディア
月の裏側での宇宙開発がまた一歩進展する契機になるかもしれません。 モントリオール理工科大学の研究グループは、月の裏側で活動するのに必要な電力を確保する方法として、地球と月とのラグランジュ点（※）のひとつ「L2」に3機の太陽発電衛星（Solar Powered Satellite: SPS）を配備し、月面に設置した受信設備へワイヤレス給電する方法が最適解だとする論文を発表しました。 【▲ 月と地球とのラグランジュ点「L2」に配備した3機の太陽発電衛星（SPS）から月の裏側にワイヤレス給電する仕組みを示した模式図（Credit: Donmez & Kurt（2024））】※…ある天体が別の2つの天体から受ける重力や遠心力と釣り合って、安定できる点のこと。この場合、別の2つの天体は月および地球となり、人工衛星はラグランジュ点近傍の閉じた軌道（ハロー軌道）を周回する。 関連記事 ・まもなく画像公開
MASSパッケージでロバスト推定のM推定、MM推定、P値を計算する[R] - 井出草平の研究ノート
以前に書いたロバスト推定の方法。こちらにP値の出し方を書いていなかったので、補足。 ides.hatenablog.com 通常の重回帰分析 mod <- lm(wage ~ gender + age + education, data = CPS1985) summary(mod) 結果： Coefficients: Estimate Std. Error t value Pr(>|t|) (Intercept) -4.84275 1.24425 -3.892 0.000112 *** genderfemale -2.33542 0.38807 -6.018 3.30e-09 *** age 0.11310 0.01669 6.775 3.32e-11 *** education 0.82744 0.07462 11.089 < 2e-16 *** --- Signif. codes:
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重回帰分析[ベイズ] - 井出草平の研究ノート
CPS1985データを使い、wageを従属変数、genderとageと独立変数とした重回帰分析を行う。 RStudioでの実行。R.4.3.3+Stools4.3を使用。 data { int<lower=0> N; // サンプルサイズ int<lower=0, upper=1> X_1[N]; // 独立変数（性別、0: 男性、1: 女性） vector[N] X_2; // 独立変数: 年齢 vector[N] Y; // 従属変数（賃金） } parameters { real alpha; // 切片 real beta_gender; // 性別の影響 real beta_age; // 年齢の影響 real<lower=0> sigma; // 誤差項の標準偏差 } model { vector[N] gender_effect = to_vector(X_1); // 性別
![重回帰分析[ベイズ] - 井出草平の研究ノート](https://cdn-ak-scissors.b.st-hatena.com/image/square/10c046cfa549ca6cd967799bfc945f4cc10ad43f/height=288;version=1;width=512/https%3A%2F%2Fcdn-ak.f.st-hatena.com%2Fimages%2Ffotolife%2Fi%2FiDES%2F20240418%2F20240418163753.png)
光（る）キミへ。リアリズムの系譜 – 砂子屋書房 月のコラム
若い世代に読まれている短歌の本といえば、書肆侃侃房の短歌ムック『ねむらない樹』があります。最新号のvol.11は2月28日に発売されました。2018年の夏に刊行されたvol.1以来、2023年の夏を除き、毎年夏と冬の2回刊行されています。2000年代前半に発行されていた『短歌WAVE』と『短歌ヴァーサス』は比較的短期間で終刊となりましたが、本誌はしばらく続いていて安心しています。 さて、『ねむらない樹』vol.11には吉田雅史よしだまさしによる「ヒップホップ短歌試論」が掲載されています。この評論にはすごく興味をひかれました。本論の要旨は二つあります。一つはラップの押韻による詩的飛躍と、短歌の上句下句における飛躍が重ねられること。もう一つは、リアルとリアリティの違いに関連してヒップホップにおける「ボースティング」の概念を導入し、短歌におけるその手法を分析することです。「ボースティング」は自画
「コーヒーをいれる時は豆をひく前に水でぬらす方がいい」と研究で裏付けられる
コーヒー好きの人は自宅でおいしいコーヒーを入れるためにさまざまな創意工夫を編み出しており、中には「コーヒー豆をひく前にほんの少しぬらす」というテクニックもあります。アメリカ・オレゴン大学の研究チームが行った研究では、実際にコーヒー豆をぬらすとひいた時に発生する静電気が抑えられ、より効率的にコーヒーを抽出できることが示されました。 Moisture-controlled triboelectrification during coffee grinding: Matter https://www.cell.com/matter/fulltext/S2590-2385(23)00568-4 Grinding coffee with a splash of water reduces static electricity and makes more consistent and intense
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