Pythonコードのプロファイリング - shkh's blog
普段、Pythonのコードは何となく速かろうという、言ってみれば勘で書いているのだけど、その勘とやらは往々にしてウンコードを生むものである。そこで、プロファイラを使っていきたいと思う。 使えそうなツール そういうわけで、いくつか使えそうなツールをリストアップした。 経過時間のプロファイラ ツール名 メモ profile ビルトイン, ピュアPythonの決定論的プロファイラ cProfile ビルトイン, C拡張の決定論的プロファイラ line_profiler 行単位の決定論的プロファイラ Plop 統計的プロファイラ, Dropboxの人が作ってる statprof 統計的プロファイラ, 開発停止？ yep 拡張モジュール用の統計的プロファイラ, バックエンドにgoogle-perftools メモリのプロファイラ ツール名 メモ memory_profiler 行単位でメモリ消費量の
GraphvizをRubyから使う | Jottin, Jotting!
photo credit: kentbye 以前グラフ構造を描画するでGraphvizを紹介したが，今回はRubyからGraphvizを使う方法を紹介する． まずGraphviz本体とRubyからGraphvizを使うためにruby-graphvizをインストールする．（Macでの例） # sudo port install graphviz # sudo gem install ruby-graphviz –remote http://github.com/glejeune/Ruby-Graphvizにサンプルがいくつか用意されているが，作ってみる． require "rubygems" require "graphviz" $node_num = nil $arc_num = nil $s_no = nil $t_no = nil $node = Array.new class Nod
Rubyでアニメーション・グラフを作ろう！ - hp12c
ベルマンフォードのアルゴリズムで実行される結果も逐次表示 - Seeking for my unique color. を見てGraphVizの出力からアニメーションgifを作りたくなった Rubyにはruby-graphvizというGraphVizのinterface libraryと RMagickというImageMagickのinterface libraryがあり これらを使えば目的は達成できるみたいだ ruby-graphvizのinterfaceは自分にはわかり辛かったので これをラップする形でGraphAz*1というクラスを書いて 上のアニメーションgifを出力してみた 用途が限定的で実装にも問題がありそうだけれど GraphVizのDOTデータの出力としても使えるので 無責任無保証で使ってくれる人がいればうれしい 使い方 コードを見るのが早いと思うので 簡単な例を示した ま
卜部昌平のあまりreblogしないtumblr
昔と違って今は{PostNotes}がテーマに入ってるから、wgetでページぶっこ抜いてきてawkかperlでちょろっと整形してgraphvizに突っ込むだけでこういう画像が簡単に。 zsh % export target="http://shyouhei.tumblr.com/post/339223403/tumblr-tumblr"; \ zsh -c 'wget -O - $target | tidy -i -w 0 -utf8 | ruby -n <(cat) | neato -Tpng -o tmp.png' <<'EOF' BEGIN { require 'open-uri' require 'thread' $h = Hash.new $q = Queue.new $th = Thread.start { loop { url = $q.deq $th.exit unless
Graphvizのレイアウトについて - だらろぐ
Graphvizの各種レイアウトの特徴を一言でまとめると、以下のようになります。 dot……階層状配置 neato……等間隔配置 twopi……放射状配置 circo…環状配置 以下にそれぞれで同じソースを処理して、結果を比較してみました。 今回使用したソースその１は次のようなものです。単純に各ノードから同じ数の子ノードを配置しています。 digraph layouttest { n00 -> {n01; n02; n03}; n01 -> {n04; n05; n06}; n02 -> {n07; n08; n09}; n03 -> {n10; n11; n12}; n04 -> {n13; n14; n15}; n05 -> {n16; n17; n18}; n06 -> {n19; n20; n21}; n07 -> {n22; n23; n24}; n08 -> {n25; n26
FPGAの部屋 Graphvizでステートマシンの図を書いてみた
ブログをFPGAキーワードで検索していたら、Graphvizで仕事用の図を書いているというブログを見つけた。（すみません。どなたのブログかわからなくてしまいました） Graphvizってもしかして、doxygenをインストールしたとき入れたソフトだなと思い、調べてみると、いろいろな図を書けるということが分かった。（バージョンは2.22です） そのブログに書いてあったGraphviz チュートリアルのページに詳しく書いてある。ダウンロードはGraphviz本家から。 Graphviz チュートリアルのページによると、テキストファイルで図を各コマンドを書いていけば自動的に図にしてくれるとのこと。 .dotファイルを作って、コマンドプロンプトの窓の中でサンプルを作り、dotコマンドを使って、やってみたがPATHが通っていない。。。 WindowsのスタートからGraphviz 2.22のフォルダ
Graphviz チュートリアル
Graphviz というツールは、 「DOT 言語」という言語で書かれたグラフ表現を GIF や PNG などのファイルフォーマットに変換してくれるシステムです。 本家のホームページは http://www.graphviz.org/ です。 ここでは、Graphviz のインストールと使い方についてまとめてみました。 なお、ここでインストール／使用する Graphviz は version 2.4（2005-08-01 現在）です。 また、インストール先の環境は Cygwin です。 ダウンロードとインストール 簡単なサンプル グラフ全体の属性 ノードの属性 エッジの属性 その他の事項 レコード サブグラフ 無向グラフ 形の一覧 トップへ ↑
Python から Graphviz を使う（ pydot を日本語で出力）(4) - 傀儡師の館.Python：楽天ブログ
2007.11.12 Python から Graphviz を使う（ pydot を日本語で出力）(4) (1) テーマ：プログラミング言語 Python を使う(336) カテゴリ：Python Python から Graphviz を使う（ pydot を日本語で出力）(3) からの続き。 pydot は 隣接行列 (adjacency matrix) (Wikipedia) からグラフを一発で描くことができるので、それを試してみる。例は Wikipedia にあるものをまず使ってみる。 まずは隣接行列を Python のリストとして用意する。 matrix = [[0, 1, 0, 0, 1, 0], [1, 0, 1, 0, 1, 0], [0, 1, 0, 1, 0, 0], [0, 0, 1, 0, 1, 1], [1, 1, 0, 1, 0, 0], [0, 0, 0, 1,
はてなブログ
なぜ日報を書くのか ※この文章は「日報を書くの良いですよ!」という事を進める文章ではないです。 あくまでも自分がScrapboxで外部向けの日記を書いたり、社内のドキュメントツールで日報を書いていく内に思いついた考えを一旦まとめたくて書いています。 元々は社内向けで書いていたので…
Graphviz - mynote
AT&Tのオープンソースでグラフ構造を描画するツール。 dot言語を用いて記述する。 Doxygenなんかで関数呼び出しやクラスの関連図の可視化にも使われているようだ。 簡単な使い方† A→B, B→C, C→Aの辺を持つ有向グラフの描画 test.dot digraph "g" { "A" -> "B" ; "B" -> "C" ; "C" -> "A" ; } で、test.dotをdottyかlneatoに食わせると新しいウィンドウで描画する。 ファイルに書き出すときは、 dot -Kneato -Tgif test.dot -o test.gif 引数の-Kはレイアウトエンジンでcirco, dot, fdp, neato, twopiの５つのどれか。-Tは出力ファイルのフォーマットでdot, gif, jpg, png, ps, svgとか色々ある。 dottyの使い方† dot
オープンバイオ - meeting3-log-network
Cytoscape <URL:http://www.cytoscape.org> タッチグラフ <URL:http://www.touchgraph.com/> bio verse viewer <URL:http://bioverse.compbio.washington.edu/viewer/> graphviz <URL:http://www.research.att.com/sw/tools/graphviz/> LGL <URL:http://apropos.icmb.utexas.edu/lgl/> estetic graph <URL:http://search.cpan.org/~thospel/Graph-Layout-Aesthetic-0.12/lib/Graph/Layout/Aesthetic.pm> pajek <URL:http://vlado.fmf.uni
debパッケージの依存関係を図示 - sshi.Continual
ubuntuがGにバージョンアップしたので、どかっとアップデートした。ついでにインストールしてあるパッケージの依存関係を把握したくなってdpkg-ruby経由でdotファイル作ってgraphvizで図示してみた。 この画像は真ん中へんを抽出してPNGにしたもの。オリジナルはSVGファイルにしたのでズームできます。こちら(http://sshi.s57.xrea.com/archive/deb_graph_spline.xml)。あたらしーバージョンのoperaかfirefoxならそのまま見れると思います。ローカルに落として見る場合は拡張子をsvgにしないといけないかも。 graphvizでもレイアウトエンジンがdotだとひどいグラフがでてくるが、fdpにしたら計算時間の増加とひきかえに見れるグラフがでてきた。neatoやfdpは無向グラフじゃないと駄目かと思ってたけど有向グラフでもいけるん
ホワット・ア・ワンダフル・ワールド 俺のバカバカバカバカバカ
本物のプログラマは使い捨てプログラムに Perl を使わない ！ Ruby や Python なんてのは，平成生まれの女子供が使うもんだ．ましてや Java や ML なんてのは，オーバーキルも良いところだ． 本物のプログラマは AWK を使う．みんなもっと近代計算機科学を作り上げた三巨人 Aho，Weinberger，Kerninghan に敬意を払いたまえ ！ ・・・ という小ネタを，Rogue Engineer's Diary / やさぐれ日記 [Modern Compiler Implementation in ML] フローグラフを描いて遊ぶ を見ていたら思いついてしまい，今まで一度も使ったことが無い AWK プログラミングをやってみた． 本当ならば，15 分くらいでプログラムを書き上げて，冒頭の煽り文句の後にネタ文をぐだぐだと書くつもりだったのに・・・ 想像以上に，(純) AW
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Rubyのランダムをグラフ化しよう！ - hp12c
GraphvizでER図を書く方法 - AbYlog
Blog/2006-7-4 - Rocco の日記