BlenderにはVideo Sequence Editor(以下VSE)という動画編集機能が備わっています。 エフェクトや字幕などの機能は貧弱ですが、動画素材の重ね合わせについては十分な機能がありますし、動作もそこそこ軽快、なおかつ連番画像を動画として読み込む機能があり、非常に使いやすいです。 Editor TypeをVideo Sequence Editorにし、ストリップを追加するとだいたい下の画像のような画面になります。 シーケンサービューアの種類というのはシーケンサやプレビューの表示を選択するボタンです。画像ではシーケンサとプレビューの両方を表示するようにしています。 Timelineの方にありますが、再生時の同期方法のメニューでアニメーションとサウンドの同期方法を選択できます。デフォルトではNo Syncになっていますが、特に理由が無ければAV-syncにしておくのが無難かと思