Excel上でRを動かすRExcel - もうカツ丼でいいよな
最近Office Professionalを買ったので，近頃はもっぱらOfficeで遊んでいる．Officeはちょっとバグとか多くて難しいから，よく勉強をして早く初心者を脱出したい． で，ここ2〜3日はExcelからRを呼ぶ方法をいろいろ調べていた．やっぱVBAちょっとくらい勉強しないと駄目かなとか思い始めた頃，RExcelというExcelのアドインを見つけた(statconn)．これを使うと結構実用的なレベルでExcelとRを連携させられそう*1． RExcelのインストール まず，rscproxyとrcomの2つのパッケージをRから入れておく．下の二行はRExcelのインストール時にやれっていわれたからやった*2． install.packages("rscproxy") install.packages("rcom") library(rcom) comRegisterRegistr
Rで半透明の散布図を描く - kmgs100の日記
大量のデータに対して散布図を描く場合、半透明な点をプロットすると、なんとなくカッコよく見えます。それだけと言えば、それだけですが。 ↑普通の散布図 ↑半透明化(アルファブレンド) ↑半透明化(アルファブレンド、縁なし) コードはこんな感じ。適当な乱数データをk-means法で3群にクラスタリングして、赤・青・緑の3色に色づけします。 # 300データ、3変数からなる標準正規乱数 x <- matrix(rnorm(900), 300, 3) # z変換して主成分分析 (3変数を2成分に要約するのに利用) pr <- prcomp(scale(x)) # k-means法で3クラスタに分離 cl <- kmeans(x, 3)$cl # プロット用データ x11 <- pr$x[cl==1,1] x12 <- pr$x[cl==1,2] x21 <- pr$x[cl==2,1] x22 <-
plyr is a set of tools that solves a common set of problems: you need to break a big problem down into manageable pieces, operate on each pieces and then put all the pieces back together. It's already possible to do this with split and the apply functions
積読・読書途中の本に関する雑感や、オンライン上の面白コンテンツ、そして世の中の不合理に対する暴言を脊髄反射的に記す。 yutakashino (柏野 雄太) another weblog: kashino.exblog.jp Archive plyr is a set of tools that solves a common set of problems: you need to break a big problem down into manageable pieces, operate on each pieces and then put all the pieces back together. It’s already possible to do this with split and the apply functions, but plyr just makes it
R GPGPU
Enabling GPU Computing in the R Statistical Environment R is the most popular open source statistical environment in the biomedical research community. However, most of the popular R function implementations involve no parallelism and they can only be executed as separate instances on multicore or cluster hardware for large data-parallel analysis tasks. The arrival of modern graphics processing un
Data Analysts Captivated by R’s Power (Published 2009)
R first appeared in 1996, when the statistics professors Robert Gentleman, left, and Ross Ihaka released the code as a free software package.Credit...Left, Stuart Isett for The New York Times; right, Kieran Scott for The New York Times To some people R is just the 18th letter of the alphabet. To others, it’s the rating on racy movies, a measure of an attic’s insulation or what pirates in movies sa
Rでグラフをアニメーションさせてみたよ - Hacking is believing@itoshi.tv(2008-11-06)
二階堂愛 (Itoshi NIKAIDO) が綴る Hacking is beliveing な日常_ [R]Rでグラフをアニメーションさせてみたよ R News 2008年2号 (PDF) や useR!2008での面白そうな発表をいくつか上げてみたで紹介されていたR の animation library を使ってみたよ。 まずは、非線形モデル y = mesor + a * cos(2*pi*(t-acrophase)/P) にN(0,0.5)のガウシアンノイズを加えたデータを用意し、これを測定されたデータと考える。そのデータに対して非線形回帰するために、Nelder-Mead法で目的関数sum( (y-yhat)^2 )を最大化する。いわゆる cosinor analysis ですね。その計算過程を各ステップごとにプロットし、animation libraryを使ってアニメ化する
Tsukuba.Rの概要について - yasuhisa's blog
前に書いたTsukuba.Rについてもうちょい詳細に書きたいと思います。 どんなことやるの?みんながRについて知りたい、話したいというようなことを集まって発表なり、勉強会なり、相談会なりやれる場にしたいと思っています。現在、僕が思いついているようなこととして Rの歴史 Rを使う意義、メリット Rの基礎事項 インストール プリミティブなデータ型について データハンドリング 関数の書き方 グラフィックス関係特集 Rの開発環境 Rのマニアックな使い方 第一回くらいは自重しようと思います> でも、考えられるものとして applyファミリー大特集*1 Rの高速化 やるおで学ぶ*2、俺俺ライブラリの作り方 などがとりあえずあります。筑波で僕以外にRのことを発表してくれそうな人が、今のところあんまりいない気がするので Rで分析まで持っていくためのRuby or Perlで行なうテキストマンジング勉強会
最短経路の本 レナのふしぎな数学の旅
シュプリンガーネイチャーは、発見の進展に貢献するために、信頼性が高く洞察に富む研究の出版を通して新領域の知識の成長を支えるとともに、アイデアや情報への世界からのアクセスを可能にします。
S-PLUS: はじめてのS-PLUS/R言語プログラミング
コマンド（S言語）よる利用を中心にした、初心者向けのS-PLUSおよびR言語の入門書です。身近なテーマの問題集形式になっており、自習に最適です。また、目的をプログラミング技術の習得に限定しているので、統計学の専門知識を必要としません。添付のCDROMには、試用版のS-PLUSが付属しているので、本書を購入してすぐに実際のプログラミングが可能です。 特に下記のような方に最適です。 S言語（R言語）に興味を持っているが、プログラミング経験がほとんどない。 S-PLUSを導入してみたいが、正式導入前に試験的にどんなことが出来るのか試してみたい。 毎日Excelで似たような作業をしているが、もっと自動化、効率化を行いたい。 調査票データなど、解析前のデータ加工が非常に手間がかかっている。効率化したい。 独自のグラフィックス、データ解析手法などを考案してみたい。 全国の主要書店、ネット書店のほか、N
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Bioconductor - RTools4TB
株式会社Yostar
Ohmsha オープンソースで始めるゲノム・プロテオーム・メタボローム解析
http://hosho.ees.hokudai.ac.jp/~kubo/log/2008/1201.html
Graphs in molecular biology - BMC Bioinformatics
認証がかかっています
http://gaou.net/hitokoto/2007-07.html
セブンアンドワイ ヤフー店 ＲとＢｉｏｃｏｎｄｕｃｔｏｒを用いたバイオインフォマティクス - Yahoo!ショッピング
mogr本 - bak_a_monoの日記
翻訳本 | Impronta di gatto
『RとBioconductorを用いたバイオインフォマティクス』 - leeswijzer: een nieuwe leeszaal van dagboek
