タイトルは気にしないで下さい。 call vundle#rc() や call neobundle#rc() や call pathogen#runtime_append_all_bundles() は filetype plugin indent on よりも後でやってはいけない。上記の様な関数は何をしているかというと、本来読み込まないパスにある vim plugin ディレクトリをランタイムパスに追加します。これらプラグイン管理系の仕事は主にランタイムパスへの追加です。vim は vimrc を読み込んだ後に(GUIであればこのあとgvimrc)、runtimepath (省略名 rtp) に列挙されるディレクトリをランタイムパスとして認識していきます。この一括読み込みはこのタイミングしかありません。つまり上記の命令よりも前に filetype plugin indent on を実行
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