DNAが絡まないためのループ | Chem-Station (ケムステ)
DNA はなぜ絡まずに収納されるのか。これはゲノム高次構造に関する最も悩ましい問題の1つだが、「ループ状ドメイン」の形成がその１つの答えとなりそうだ。ただし、ループ形成を推し進めているものの正体については見解が分かれている。 タイトルおよび説明はシュプリンガー・ネイチャーの出版している日本語の科学まとめ雑誌である「Natureダイジェスト」7月号から。最新サイエンスを日本語で読める本雑誌から個人的に興味を持った記事をピックアップして紹介しています。過去の記事は「Nature ダイジェストまとめ」を御覧ください。 ループ形成の謎に挑む研究者たち 二重らせんを組み遺伝子情報を伝えるDNA。ヒトゲノムDNAは長さ2mにも及ぶにも関わらず、これらは絡まることなくそれぞれの細胞にうまく詰め込まれています。それらはなぜ絡まないか？ その答えは「ループ押し出し（loop extrusion）」と呼ばれる
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センス (分子生物学) - Wikipedia
分子生物学や遺伝学において、核酸分子、特にDNAやRNAの鎖のセンス（sense、意味）とは、アミノ酸の配列を特定する際のその鎖とその相補体の役割の性質を指す。センスの意味は文脈によって微妙に異なることがある。たとえば、DNAは、同じ配列のRNAバージョンがタンパク質に翻訳されるか翻訳可能であればポジティブセンスであり、そうでなければネガティブセンスである。 DNAセンス[編集] 核酸ポリマー間の塩基対合は相補的な性質を持つため、二本鎖DNA分子は互いに逆相補的な配列を持つ2本の鎖から構成される。分子生物学者が各鎖を明確に識別するために、2本の鎖は通常「センス鎖」と「アンチセンス鎖」として区別される。DNAの個々の鎖は、そのヌクレオチド配列が、アミノ酸の配列に翻訳された、または翻訳可能なRNA転写物の配列に直接対応する場合、ポジティブセンス（ポジティブ（＋）または単にセンスとも）と呼ばれる
研究内容 | 理化学研究所 生命機能科学研究センター 細胞動態計測研究チーム システム物理生物学グループ
これまでの成果・終了したプロジェクト 現在進行中のプロジェクト 共同研究 これまでの成果・終了したプロジェクト 生体分子モーターの動作原理について モータータンパク質は10 nmオーダーの分子であり、ナノの世界では避けられない熱雑音にさらされながら力発生や１方向性の運動を行います。力学的な仕事を行うために必要な入力エネルギーはATP（アデノシン三リン酸）を加水分解することによって得られる化学エネルギーです。この入力エネルギーの大きさは20kBT程 度なので、半導体素子などの人工機械のように莫大なエネルギー（108 kBT /bit）を注いで熱ノイズを遮断することは出来ないために、人工機械とは異なる方法で 熱ノイズに対処して細胞内での生理的機能を果たす必要があります。 生命システムの各階層（分子レベル、分子集合体レベル、細胞レベルなど）で熱ノイズや確率的な機能発現プロセスへの対処法（もしくは
アトラクター - Wikipedia
離散時間力学系のグモウスキー・ミラの写像で現れるストレンジアトラクター。赤い軌道が複雑な黒点の連なりの領域へ引き込まれる。 連続時間力学系のファン・デル・ポール方程式で現れる周期アトラクター。軌道は各矢印に沿って赤い閉曲線へ引き込まれる。 力学系におけるアトラクター（英語: attractor）とは、時間発展する軌道を引き付ける性質を持った相空間上の領域である。力学系において重要なトピックの一つ。引き込まれた後の軌道は、アトラクター内に留まり続ける。アトラクターへ引き込まれる初期値の集合はベイスンや吸引領域と呼ばれる。 アトラクターは、その構造・性質にもとづき点アトラクター、周期アトラクター、準周期アトラクター、ストレンジアトラクターの4種類に分類される。点アトラクターはもっとも単純で、周りの軌道を引き寄せる1つの点である。周期アトラクターと準周期アトラクターは、連続力学系でいえばそれぞれ
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https://research-er.jp/articles/view/104044
Old cogs, new tricks: the evolution of gene expression in a chromatin context - Nature Reviews Genetics