Burrows-Wheeler変換の線形時間アルゴリズム - DO++
研究紹介です。今夏のSPIRE 2009という学会で "A Linear-Time Burrows-Wheeler Transform using Induced Sorting", D. Okanohara, K. Sadakane, SPIRE 2009 pdf(draft) というのを発表します。これは与えられた文字列に対し接尾辞配列を経ないでBurrows-Wheeler変換を直接行うというもので、アルファベットサイズによらず入力長に対して線形時間で行えます。基本的なアイディアは昨年のInduced Sortingによる接尾辞配列の線形時間構築アルゴリズム（いわゆるSAIS）を接尾辞配列を使わないでシミュレートするものです。pushとpop操作だけからなり、そのまま外部記憶上での構築とかにも対応できるようになっています。 Burrows-Wheeler変換（BWT, Block S
Canonical Huffman Codes - naoyaのはてなダイアリー
1999年出版と少し古い書籍ですが Managing Gigabytes を読んでいます。理解のために 2.3 で出て来る Canonical Huffman Codes の習作を作りました。 ハフマン符号は情報圧縮で利用される古典的なアルゴリズムで、圧縮対象データに出現するシンボルの出現確率が分かっているときに、その各シンボルに最適な符号長の接頭語符号を求めるものです。 通常のハフマン符号はポインタで結ばれたハフマン木を構築して、ツリーを辿りながら各シンボルに対する接頭語符号を計算します。このハフマン木には曖昧な箇所が残されています。ハフマン木は木の辺を右に辿るか左に辿るかで符号のビットが決まりますが、右が 0 で左が 1 などというのはどちらでも良いという点です。(曖昧だから駄目、という話ではありません。) 従って、ハフマン木から生成される符号は一意には決まりません。 ここで各シンボル
DO++ : 透過的データ圧縮
可逆データ圧縮分野で、現在研究が盛んな分野の一つが、データを圧縮した状態のまま定数時間でランダムアクセスをサポートするデータ圧縮方式です（word RAMモデルでO(log n)サイズの復元が定数時間)。 これは、データをあたかも圧縮していないかのように扱えるため、透過的データ圧縮/構造と呼ばれています（英語だとまだ決まってない？)。 例えば1GBのデータを圧縮した状態で、途中300MB目から4Byteだけ復元しようというのが定数時間で実現できるわけです。これは理論的にもかなり強いことをいっていて，例えば今あるデータ構造やアルゴリズムが、O(T)時間である問題を解けるというのがあったら、それを全く同じO(T)時間のままデータ構造を圧縮し作業領域量を減らすことができます (一応データ構造に対し読み込み操作しか無い場合。書き込みもある場合はまたちょっと面倒になる） このデータを圧縮したまま扱う
Data Compression Pointers
This page is partly written in Japanese. 日本語と英語のちゃんぽんです。 News [2005-03] Some Recent News: Mark Nelson's DataCompression.info sold to Visicron According to this page, Jean-loup Gailly seemingly abandoned the project. info-zip.org, gzip.org, and zlib.org are not maintained. Mark Adler maintains the new official site, http://www.zlib.net/. Rainer Nausedat passed away. [2003-07] LZW Patent and Softwar
TXTCache Index uniquely : ホーム
圧縮インデックスライブラリ「TXTCache」,圧縮Suffix ArrayなどのJava実装パッケージ,オンメモリで全文検索を行うことができる,高速な検索エンジンやユニークなデータモデルの開発が可能となる圧縮インデックス(Compressed Index)のJavaのライブラリ。 接尾辞配列(Suffix Array)、圧縮接尾辞配列(Compressed Suffix Array)、LZ-Indexなどを含んだパッケージ。 オープンソース。 ライセンスは、GPLまたはLGPLのユーザー選択式。 無償。 GPL版ダウンロード LGPL版ダウンロード Operaの場合、お手数ですが、ダウンロード後、ファイル名に.zipを付ける必要があります。
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データ圧縮の基礎
