rpy2とsoaplibでつくるRのウェブサービス
soaplibにはCherryPyが組み込まれているので簡単にウェブサービスがつくれる。さらにrpy2を使えばRのウェブサービスがお手軽に構築できて便利。 インストールの手順はwikiを参照 以下のコードをsoapr.pyというファイル名で保存する。これは与えた数字の数だけRがrnormして返すという簡単なサービス。 from soaplib.wsgi_soap import SimpleWSGISoapApp from soaplib.service import soapmethod from soaplib.serializers.primitive import String, Integer, Array, Float import rpy2.robjects as robjects class RService(SimpleWSGISoapApp): @soapmethod(I
機械学習序曲(仮) > 数値計算の実行速度 - Python, C, Rの比較
上記の結果より明らかなように，最適化したCに比べても Python の 実行速度のほうがまだ速いという結構驚きな結果が得られました． しかしながら，その Python よりもRのほうがまだ速いという ことも分かりました．特に逆行列の演算に関してはRの圧勝です． 以上の結果のまとめです： 実行速度の速さは R > Python > C の順 CよりPythonの方が15%程度速い しかしながら，特に逆行列の演算に関してはPythonよりRの方が40%程度速い おわりに 以上のベンチマークにより，少なくとも行列演算に関しては CよりもPythonの方が速いということが分かりました． 今回の実験は個人的なプログラム環境の乗り換えのための 判断材料として行なったのですが， 乗り換えに関しては Python の速度性が最大の懸念材料だったので， これで心おきなくCからPythonに乗り換えられます(
RPyで遊んでみる - yasuhisa's blog
一学期の授業にてデータ解析という授業を取っています。統計ソフトRを用いて*1、車市場の線形価格予想モデルのようなものを構築します…というのはとりあえずおいておいてw。 Rを使っていろいろやるわけですが、RをPythonから使えるRPyというライブラリがあるのでつかってみました。 まず、RPyを使うのに必要なNumericというライブラリをインストールします。しなくてもいいのかもしれないけど、Strongly Recommendされているので入れておきます。ここからどうぞ。次に、RPyのインストール。ここからどうぞ。 これで使えるようになってると思うので、使ってみましょう。デモがよくできているので、この付近でいろいろ試してみましょう。 普通はこれでうまく行くと思うんですが、R側にあるデータや、functionを使う時にちょっとつまった点があったので、自己メモ。 R側にあるデータは「r.loa
RとWebサービス - RjpWiki
RjpWiki はオープンソースの統計解析システム R に関する情報交換を目的とした Wiki です利用方法 † RSOAPは、「サーバマネージャ」サービスと「サーバプロセス」サービスの2種類からなり、まず「サーバマネージャ」サービスに接続し、そのnewServerメソッドを呼んで「サーバプロセス」サービスのURLを得る。その後「サーバプロセス」サービスに接続し、主にcall, evalメソッドを用いて解析を実行する。 ↑ MacOS X のAppleScript?から呼んだ例 † -- サーバマネージャサービスのURLがlocalhost:9081のとき tell application "http://localhost:9081/" set returnValue to call soap {method name:"newServer", ¬ method namespace ur
西尾泰和のブログ: RPyでplotするとハングアップする問題を回避する方法
RPyを使うとR言語が持つ豊富な統計関数やプロット方法を利用できて便利なのですが、なぜか私の環境ではplotをすると表示されたウィンドウがハングアップします。ファイルに出力するのはハングアップしないようなので、ファイルに出力した後でそれに関連づけられているビューワーで開けば使い勝手はさほど変わらないかと思い実装してみました。 from rpy import r import os, time class RPlotWrapper: def __init__(self, func, filename = "tmpplot.bmp"): self.func = func self.filename = filename def __call__(self, *args, **kw): try: os.remove(self.filename) except: pass r.bitmap(sel
omegahat.org - omegahat リソースおよび情報
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http://rpy.sourceforge.net/rpy/doc/rpy_html/Caveat-and-bugs.html
http://www.okada.jp.org/WOWiki/index.php?plugin=attach&openfile=RandWO.pdf&refer=WOMeeting200406