Unity5.5b6で確認しています。 Unity5.5では、Build Settingsに Build System という項目が増え、 Gradleによるビルドが選択できるようになっています。 つまり、build.gradle が使えるようになるということです。 とは言え、当面はbuild.gradleを手軽に編集することはできないようで、 一旦AndroidプロジェクトをExportするか、裏技的に PlaybackEngines/AndroidPlayer/Tools/GradleTemplates/ にあるテンプレートを書き換えれば一応変更できる、という状況のようです。 That is not supported in the first version. But... The templates used for creating the build.gradle files
![Unity5.5からgradleでAndroidのビルドができるよ - Qiita](https://cdn-ak-scissors.b.st-hatena.com/image/square/30afb0e2b63ebfd3cc6bbba8b72561b6016f92a2/height=288;version=1;width=512/https%3A%2F%2Fqiita-user-contents.imgix.net%2Fhttps%253A%252F%252Fcdn.qiita.com%252Fassets%252Fpublic%252Farticle-ogp-background-9f5428127621718a910c8b63951390ad.png%3Fixlib%3Drb-4.0.0%26w%3D1200%26mark64%3DaHR0cHM6Ly9xaWl0YS11c2VyLWNvbnRlbnRzLmltZ2l4Lm5ldC9-dGV4dD9peGxpYj1yYi00LjAuMCZ3PTkxNiZoPTMzNiZ0eHQ9VW5pdHk1LjUlRTMlODElOEIlRTMlODIlODlncmFkbGUlRTMlODElQTdBbmRyb2lkJUUzJTgxJUFFJUUzJTgzJTkzJUUzJTgzJUFCJUUzJTgzJTg5JUUzJTgxJThDJUUzJTgxJUE3JUUzJTgxJThEJUUzJTgyJThCJUUzJTgyJTg4JnR4dC1jb2xvcj0lMjMyMTIxMjEmdHh0LWZvbnQ9SGlyYWdpbm8lMjBTYW5zJTIwVzYmdHh0LXNpemU9NTYmdHh0LWNsaXA9ZWxsaXBzaXMmdHh0LWFsaWduPWxlZnQlMkN0b3Amcz1iMjQ0Y2RlMmI4M2NmOTk2ZjQ3NzM4ZDQ1YzYzY2Y5OA%26mark-x%3D142%26mark-y%3D112%26blend64%3DaHR0cHM6Ly9xaWl0YS11c2VyLWNvbnRlbnRzLmltZ2l4Lm5ldC9-dGV4dD9peGxpYj1yYi00LjAuMCZ3PTYxNiZ0eHQ9JTQwdGt5YWppJnR4dC1jb2xvcj0lMjMyMTIxMjEmdHh0LWZvbnQ9SGlyYWdpbm8lMjBTYW5zJTIwVzYmdHh0LXNpemU9MzYmdHh0LWFsaWduPWxlZnQlMkN0b3Amcz1mMjdlMTQwZDk1NTkzOTU5N2NmY2Y2NzRlMjI0Yzk5Ng%26blend-x%3D142%26blend-y%3D491%26blend-mode%3Dnormal%26s%3D03d5b3f5890e915d583b2c7f480d1d38)