講義資料を全世界に向けて無償で公開し、最高水準の理工系教育を全世界の共有財産とすべく提供するプラットフォームです

2010年冬学期「文献情報抽出・オントロジー概論」 一回３名ずつ，２５分の論文紹介プレゼンテーション（スライド２５枚程度）を行う輪講形式． 10/15, 22, 29（柏一般公開ですがやろうと思っています）, 11/5, 12, 19の計６回を予定． 本郷理学部３号館412号室・お台場CBRC10階会議室に配信．ただし発表者は柏情報生命科学実験棟２階講義室にくること． 発表スライドはPDF形式に変換したものを，当日0:00までにメーリングリスト（作成予定）に送付すること． 発表の当番でない学生は一日一回は質問すること（発表および質疑への貢献度によって成績の評価を行う）． 何かあったら高木（tt@k.u-tokyo.ac.jp）・岩崎（iwasaki@k.u-tokyo.ac.jp）にメールしてください． 【１０月８日】以下のアンケートにご協力ください https://sprea

Here you'll find a short description and examples of how to use the FASTX-toolkit from the command line. Command Line Arguments FASTQ-to-FASTA FASTQ/A Quality Statistics FASTQ Quality chart FASTQ/A Nucleotide Distribution chart FASTQ/A Clipper FASTQ/A Renamer FASTQ/A Trimmer FASTQ/A Collapser FASTQ/A Artifacts Filter FASTQ Quality Filter FASTQ/A Reverse Complement FASTA Formatter FASTA nucleotides

A limited number of travel fellowships will be made available to younger researchers from abroad. We especially encourage young researchers from institutions located within the Asian region to appy for the travel fellowships.

FASTQ Format Specification Introduction FASTQ format stores sequences and Phred qualities in a single file. It is concise and compact. FASTQ is first widely used in the Sanger Institute and therefore we usually take the Sanger specification and the standard FASTQ format, or simply FASTQ format. Although Solexa/Illumina read file looks pretty much like FASTQ, they are different in that the qualitie

INFORMATION 2024年5月25日（土）・26日（日） 第24回 マリンバイオテクノロジー学会 に出展します ※終了いたしました。ありがとうございました。 2024年3月24日（日）～ 27日（水） 日本農芸化学会 2024年度 東京大会に出展します（展示は25, 26, 27日の3日間） ※終了いたしました。ありがとうございました。 2023年9月7日（木）・8日（金） 2023年度（第37回）日本放線菌学会大会 広島 に出展します ※終了いたしました。ありがとうございました。 2023年9月3日（日）～ 9月5日（火） 第75回日本生物工学会大会（名古屋大学 東山キャンパス）に出展します ※終了いたしました。ありがとうございました。 2023年2月23日（木・祝）～24日（金） 第56回日本痛風・尿酸核酸学会総会（新宿区市谷）に出展します ※終了いたしました。ありがとうござい

HomePage TikiWikiのバージョンアップ 【2012.2.29】 NGS Sufer's Wikiで使用しているTikiWikiのバージョンをv5.4からv8.3にアップしました。このバージョンアップにより、セキュリティがより強化されスパム等の不正書き込みをできる限り遮断する設定にしています。 サイト内検索 by googleカスタム検索 メインコンテンツ 初めての方へ シーケンサーの一般論 次世代シーケンサーの概要 DNAマイクロアレイと次世代シーケンサーの比較 シーケンサープラットフォーム(機種)の違い アプリケーションリスト アセンブル (de novoアセンブリ, トランスクリプトームアセンブリ, メタゲノム) トランスクリプトーム解析 (発現解析、スプライシングバリアント解析、ncRNA・smallRNA解析) リシーケンシング解析 (WGS, exome, CNV,

MapSplice: Accurate mapping of RNA-seq reads for splice junction discovery Kai Wang; Darshan Singh; Zheng Zeng; Stephen J. Coleman; Yan Huang; Gleb L. Savich; Xiaping He; Piotr Mieczkowski; Sara A. Grimm; Charles M. Perou; James N. MacLeod; Derek Y. Chiang; Jan F. Prins; Jinze Liu Nucleic Acids Research 2010; doi: 10.1093/nar/gkq622 Recent News 2011.9.15  MapSplice is reviewed in Gregory Grant, et

MeSH files now available via the NLM Data Distribution Program Beginning October 31, 2018, MeSH files are now available to download via the NLM Data Distribution Program. Information and download links may be found via the Download MeSH Data page. Please update any links and bookmarks that currently point to this page. Changes to MeSH Terminology for 2019 The reports below highlight changes that a

[ PDF：6.3MB ] ※PDFファイルをご覧頂くためには、Acrobat Readerが必要です。 Acrobat Readerをお持ちでない方はダウンロードしてご覧下さい。