バイオインフォマティクス, 森下研究室Morishita Laboratory
2021年度以降すべてITCLMS へ移行 https://mlab.cb.k.u-tokyo.ac.jp/courseware 2020年度 生物情報ソフトウエア論 I & II 2020/4/23 – 7/16 毎週木曜日2限(10:25-12:10 105分) zoom によるオンライン配信 meeting ID とパスワードは UTAS の講義シラバスに記載してあります。 講義ノートは、ITC-LMS に順次毎週置いてゆきます。パスワード付きです。 試験は実施せず、プログラミング演習により成績を評価します。 生物情報ソフトウエア論 I (S1ターム) (4/23) 講義資料1 (4/23,30) 講義資料2 プログラム例 (5/7) 課題1の提出〆切り 休講日(月曜日の講義振替日のため) (5/14) 大規模配列の超高速処理 / suffix array とは？ 講義資料3
バイオインフォマティクス, 森下研究室Morishita Laboratory
生命科学は、情報学・数学・１分子計測技術の魅力的な実験場です。私たちは、これらの学問を生命科学に取り入れ、DNAとオーミクス周辺の生命科学の研究課題に取り組んでいます。 情報学・数学からのアプローチ 数学的思考等の知的活動を計算機で自動化することには限界があることは、たとえばゲーデルの不完全性定理等で知られています。この限界を意識しつつ、自動化できる範囲が機械学習、データマイニング等の情報学分野で徐々に広がっています。一方、私たちが取り組んでいるのは、生物における自動化メカニズムの理解です。たとえば、ゲノムがどのように情報をコードして細胞や組織を構築し、また進化してきたか？ 核内でDNAはどのように畳み込まれ遺伝子の発現を制御しているか？ などを深く知りたいと考えています。このような歩みから、生命科学は情報学と数学の魅力的な実験場であると感じています。特に最適化アルゴリズム、並列計算、機械
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