新型コロナウイルスの治療戦略を提案 : crisp_bio
crisp_bio RIKEN (NISLO, WDCM ...) - NIG (DDBJ/CIB, WDCM, OECD BRC, GBIF, JST BIRD, TPRP ...) - FREE [出典] OPINION ARTICLE "Therapeutic strategies in an outbreak scenario to treat the novel coronavirus originating in Wuhan, China [version 2; peer review: 2 approved]" Kruse RL (JHU). F1000Research. First published: 31 Jan 2020, 9:72; Latest published: 07 Feb 2020, 9:72 著者は「SARS-CoV-2の生物学的知見が限られているが、
新型コロナウイルス：ELISAによるSARS-CoV-2に対する抗体検出を実現 : crisp_bio
crisp_bio RIKEN (NISLO, WDCM ...) - NIG (DDBJ/CIB, WDCM, OECD BRC, GBIF, JST BIRD, TPRP ...) - FREE [出典] "A serological assay to detect SARS-CoV-2 seroconversion in human" Amanat F [..] Krammer F. medRxiv 2020-03-18. [査読なし投稿: medRxivとbiRxivへの投稿件数 616件/2020-03-20] COVID-19を引き起こすSARS-CoV-2の感染は、これまでPCR検査で判定されてきた。米国Icahn School of Medicine at Mount Sinaiを始めとする国際共同研究は今回、武漢で分離されたSARS-CoV-2のスパイク糖タンパク質由来の
[20200412更新] 新型コロナウイルス: 抗ウイルス剤の標的RNA依存性RNAポリメラーゼの構造詳らかに : crisp_bio
crisp_bio RIKEN (NISLO, WDCM ...) - NIG (DDBJ/CIB, WDCM, OECD BRC, GBIF, JST BIRD, TPRP ...) - FREE 2020-04-12 出典としてbioRxiv投稿にScience論文を追加 2020-04-08 EMDB/PDBからの構造データリリース (2020-04-01/04-08)につき構造情報を追加 [出典] "Structure of the RNA-dependent RNA polymerase from COVID-19 virus" Gao Y, Yan L, Huang Y, Liu F [..] Wang Q, Lou Z, Rao Z. Science 2020-04-10. (bioRxiv 2020-03-17 "Structure of RNA-dependent RN
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[20200331更新] 新型コロナウイルスのスパイク (S)は、ヒト細胞への侵入に、CD147も利用する : crisp_bio
crisp_bio RIKEN (NISLO, WDCM ...) - NIG (DDBJ/CIB, WDCM, OECD BRC, GBIF, JST BIRD, TPRP ...) - FREE #2020-03-31 Meplazumabを17名に投与し11名をコントロールとしたオープンラベル・非同期的非無作為臨床試験で、ヒト化抗CD147抗体が顕著に症状を改善: Meplazumab treats COVID-19 pneumonia: an open-labelled, concurrent controlled add-on clinical trial. Bian H. medRxiv 2020-03-24 [これ以前の更新履歴は文末参照] Fourth Military Medical University(西安)と北京理工大学の研究グループが、SARS-CoV-2のスパイ
[20200504更新] 新型コロナウイルス：血漿療法で凌ぎつつ、抗体とワクチンを待つ : crisp_bio
crisp_bio RIKEN (NISLO, WDCM ...) - NIG (DDBJ/CIB, WDCM, OECD BRC, GBIF, JST BIRD, TPRP ...) - FREE 2020-05-15 米国からの報告: 血漿療法の安全性評価 - 重度・重篤な患者5,000名からのデータ 2020-05-04 新型コロナウイルス感染症の第一選択薬の列に、回復者の血清が加わった: "Convalescent serum lines up as first-choice treatment for coronavirus" Sheridan C. Nat Biotechnol 2020-05-01. 2020-04-10 新型コロナに「安価ですぐ始められる」古典的な治療法を評価へ - カナダが回復期血漿を投与する世界最大規模の臨床試験を開始. 日経バイオテク 2020.04.
[20200528更新] 新型コロナウイルスのPDB公開構造一覧 - その１ : crisp_bio
crisp_bio RIKEN (NISLO, WDCM ...) - NIG (DDBJ/CIB, WDCM, OECD BRC, GBIF, JST BIRD, TPRP ...) - FREE
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[20210607更新] 新型コロナウイルスの感染は、ヒト細胞のACE2とTMPRSS2に依存し、慢性膵炎治療薬で阻害される : crisp_bio
crisp_bio RIKEN (NISLO, WDCM ...) - NIG (DDBJ/CIB, WDCM, OECD BRC, GBIF, JST BIRD, TPRP ...) - FREE 2021-06-07 小野薬品, Webで開催した2020年度決算会見 (5月11日)でカモスタットメシル酸塩 (慢性膵炎治療薬フオイパン錠)の新型コロナウイルス感染症の適応追加について、5月末までに投薬と観察が完了する予定の第３相試験の結果次第で、21年度上期に承認申請するとの見通しを示した [ミクスonline 202105-12 04:50 https://www.mixonline.jp/tabid55.html?artid=71080]。 2020-03-30 Aarhus U (デンマーク)、カモスタットメシル酸塩の第1/2相試験開始へ: ClinicalTrial.gov ID
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[20200501更新] 新型コロナウイルスのメインプロテアーゼの構造を解析し、治験薬からその阻害剤を発見 : crisp_bio
crisp_bio RIKEN (NISLO, WDCM ...) - NIG (DDBJ/CIB, WDCM, OECD BRC, GBIF, JST BIRD, TPRP ...) - FREE # 2020-05-01 Nature論文に掲載されていた高精度版構造7BQYを追記 # 2020-04-09 本稿の旧タイトル「新型コロナウイルスのメインプロテアーゼに対してIC50 0.48μMの阻害活性を示す低分子を治験薬から発見」を、2020-04-09に迅速出版されたNature論文のタイトルに準拠して改訂; bioRxivのv.1から各種数値も若干改訂された。 (これより以前の更新履歴は文末に移動) [出典] "Structure of Mpro from COVID-19 virus and discovery of its inhibitors" Jin Z, Du X, Xu
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[解説] 新型コロナウイルスのプロテアーゼとは? : crisp_bio
crisp_bio RIKEN (NISLO, WDCM ...) - NIG (DDBJ/CIB, WDCM, OECD BRC, GBIF, JST BIRD, TPRP ...) - FREE 2020-06-04 PDBj 今月の分子「246: SARSコロナウイルス2 スパイク (SARS-CoV-2 Spike)」へのリンクを追加 2020-02-19 初回投稿 [2020-02-19 crisp_bio注] 本記事は、PDBjのWebサイト上の利用規約に基づいて、今月の分子」の242: コロナウイルスプロテーアーゼ (Coronavirus Protease)の項の画像を含む全文を転載したものです。本稿のテキストと画像の再利用につきましては、「今月の分子」は、X線結晶構造解析で解かれた阻害剤に結合した状態のPDBエントリー6lu7に基づいている。別のグループによるbioRxi
![[解説] 新型コロナウイルスのプロテアーゼとは? : crisp_bio](https://cdn-ak-scissors.b.st-hatena.com/image/square/2500a9e1031d2ead31e5f12f1df0b9540e7edb80/height=288;version=1;width=512/https%3A%2F%2Flivedoor.blogimg.jp%2Fcrisp_bio%2Fimgs%2Ff%2F7%2Ff708c5e0-s.png)
固形腫瘍に抗するCAR-T細胞の効能増強を、TGFβ受容体のCRISPR/Cas9 KOにより実現 - モデルマウスにて : crisp_bio
crisp_bio RIKEN (NISLO, WDCM ...) - NIG (DDBJ/CIB, WDCM, OECD BRC, GBIF, JST BIRD, TPRP ...) - FREE [出典] TGFβ inhibition via CRISPR promotes the long-term efficacy of CAR-T cells against solid tumors. Tang N, Cheng C [..] Wang H. JCI Insight 2020-01-30. CAR-T細胞療法は血液腫瘍に著効を示す。一方で、免疫抑制性腫瘍微小環境が一因であるが、固形腫瘍には奏効しない。中国科学院動物研究所を主とする研究グループは、CAR-T細胞の内在TGFβ受容体II (TGFBR2)をCRISPR/Cas9によりノックアウトし、CAR-T細胞の誘導性制御性T細
[20200613更新] 多重なGPCRsのプロファイリングとリガンド同定をハイスループットで実現する出芽酵母プラットフォームを開発 : crisp_bio
crisp_bio RIKEN (NISLO, WDCM ...) - NIG (DDBJ/CIB, WDCM, OECD BRC, GBIF, JST BIRD, TPRP ...) - FREE 2020-06-13 [更新] PNAS誌採択・刊行につき、書誌情報を追加: Proc Natl Acad Sci U S A. 2020-06-09. Online 2020-05-20. (crisp_bio記事テキストはbioRxiv準拠のまま; アブストラクトのテキストに手が入っているが内容には変更が無く、本文をななめ読みした限りでは研究結果に大きな変更は無いように見える; 但し、PNASでは、Fig. 7 Validation of DCyFIR discoveries in mammalian cells.が追加され、Supplementary figuregにも追加あり) 202
ヒトMHCクラスⅠb 分子のMR1は、癌免疫療法の新たな標的 (1/2) : crisp_bio
crisp_bio RIKEN (NISLO, WDCM ...) - NIG (DDBJ/CIB, WDCM, OECD BRC, GBIF, JST BIRD, TPRP ...) - FREE [出典] MAIT Cells Promote Tumor Initiation, Growth, and Metastases via Tumor MR1. Yan J [..] Teng MWL. Cancer Discovery. 2019-12-11. [関連crisp_bio記事] 2020-01-23 進化的に保存されている (invariant)T細胞抗原受容体(TCR)α鎖 (Vα7.2-Jα33)を発現している細胞として同定されたMAIT (Mucosal associated invariant T)細胞は、ヒトMHCクラスⅠb 分子であるMR1 (major histoc
KRAS(G12C)癌細胞集団は阻害剤による抑制からのレジリエンスを秘めている : crisp_bio
[出典] 論文 Rapid non-uniform adaptation to conformation-specific KRAS(G12C) inhibition. Xue JY, Zhao Y [..] Lito P. Nature. 2020-01-08：crisp_bio記事 2019-11-15 KRAS (G12C)を標的とするアムジェン社のAMG 510、第２相試験へと進む 米国National Library of Medicineが維持している臨床試験データベースClinicalTrial.govには、KRAS(G12C)変異癌を対象とする阻害剤 (以下、G12Ci)の治験が8件登録されている (2020-01-21 JST検索)。この中には、第２相試験へと進んだアムジェン社のAMG510 [crisp_bio記事参照]も含まれている。 MSKCCを主とする研究グループ
分子標的薬が誘導する変異が癌細胞を利する : crisp_bio
crisp_bio RIKEN (NISLO, WDCM ...) - NIG (DDBJ/CIB, WDCM, OECD BRC, GBIF, JST BIRD, TPRP ...) - FREE 出典 [論文] Adaptive mutability of colorectal cancers in response to targeted therapies. Russo M [..] Bardelli A. Science. 2019-12-20；[PERSPECTIVE] Targeted drugs ramp up cancer mutability. Gerlinger M. Science. 2019-12-20. RussoらCandiolo Cancer Instituteを主とする研究グループは今回、標的療法に対する耐性は、治療の間にゲノムの不安定性が一時的に亢進し新
CRISPRaにて腫瘍特異的な変異遺伝子群と抗原を免疫システムに晒すことで、抗腫瘍免疫応答を劇的に強化 : crisp_bio
crisp_bio RIKEN (NISLO, WDCM ...) - NIG (DDBJ/CIB, WDCM, OECD BRC, GBIF, JST BIRD, TPRP ...) - FREE [出典] Multiplexed activation of endogenous genes by CRISPRa elicits potent antitumor immunity. Wang G, Chow RD [..] Chen S. Nat Immunol. 2019-10-14. Yale University School of Medicineの研究グループは、「AAVによる腫瘍内CRISPRa送達により、腫瘍遺伝子群の発現と腫瘍抗原提示を亢進することで、抗腫瘍免疫応答を劇的に亢進する」MAEGI (Multiplexed Activation of Endogenous G
ゲノム編集技術により、牛の除角を畜産業から除去する : crisp_bio
crisp_bio RIKEN (NISLO, WDCM ...) - NIG (DDBJ/CIB, WDCM, OECD BRC, GBIF, JST BIRD, TPRP ...) - FREE # crisp_bio注：2019-10-09に体細胞角移植の誤字を体細胞核移植に修正。 [出典] Genomic and phenotypic analyses of six offspring of a genome-edited hornless bull. Young AE [..] Van Eenennaam AL. Nat Biotechnol. 2019-10-07. 乳牛と肉牛の飼育にあたって、牛同士の保護と飼育者の安全のために、除角が行われるが、動物愛護の観点から除角に変えて、無角の牛を育種によって増やす努力がされている。米国では肉牛のアンガス種で無角化が進んでいるが、乳牛
抗-CRISPRタンパク質AcrIIA6は、Cas9をアロステリックに阻害する : crisp_bio
crisp_bio RIKEN (NISLO, WDCM ...) - NIG (DDBJ/CIB, WDCM, OECD BRC, GBIF, JST BIRD, TPRP ...) - FREE [出典] Cas9 Allosteric Inhibition by the Anti-CRISPR Protein AcrIIA6. Fuchsbauer O, Swuec P [..] Goulet A. Mol Cell. 2019-10-08. [2019-12-19 crisp_bio追記: Mol Cell. 2019 Dec 19;76(6):922-937.e7] バクテリオファージはバクテリアとの共進化 ("軍拡競争")の中で、CRISPR-Cas免疫を阻害するタンパク質 (anti-CRISPR proteins: Acrs)を展開してきた。このAcrsは、CRISPR-C
抗腫瘍治験薬の97%が臨床試験で脱落する訳 : crisp_bio
crisp_bio RIKEN (NISLO, WDCM ...) - NIG (DDBJ/CIB, WDCM, OECD BRC, GBIF, JST BIRD, TPRP ...) - FREE [出典] Off-target toxicity is a common mechanism of action of cancer drugs undergoing clinical trials. Lin A, Giuliano CJ [..] Sheltzer JM. Sci Transl Med. 2019-09-11. 治験まで進んだ抗癌剤候補のほとんどが奏功性や毒性の評価基準を満たすことなく脱落してきたが、その原因の一端が明らかにされた。CSHLのJason M. Sheltzerが率いる研究グループは今回、抗癌剤の標的として想定されていたタンパク質をノックアウトしても、抗癌剤が適
P53欠損がWNT依存性の全身炎症を誘導し乳癌の転移をドライブする : crisp_bio
crisp_bio RIKEN (NISLO, WDCM ...) - NIG (DDBJ/CIB, WDCM, OECD BRC, GBIF, JST BIRD, TPRP ...) - FREE [出典] "Loss of p53 triggers WNT-dependent systemic inflammation to drive breast cancer metastasis" Wellenstein MD, Coffelt SB [..] Jonkers S, de Visser KE. Nature. 2019 Jul 31. 背景 癌に伴う全身性炎症が癌患者の予後不良と密接に結びついている。ヒト上皮性腫瘍のほとんどにおいて、好中球/リンパ球比 (neutrophil-to-lymphocyte ratio: NLR)が高いことが全生存率の低下と相関し、好中球と癌転移の間
アルツハイマー病(AD)リスク因子ApoE4キャリアのADリスクを抑制する遺伝子変異と、ApoE4ノンキャリアのADリスクを高める遺伝子変異を同定 : crisp_bio
crisp_bio RIKEN (NISLO, WDCM ...) - NIG (DDBJ/CIB, WDCM, OECD BRC, GBIF, JST BIRD, TPRP ...) - FREE [出典] "Analysis of Whole-Exome Sequencing Data for Alzheimer Disease Stratified by APOE Genotype" Ma Y [..] Farrer L. JAMA Neurol 2019-06-10；"Sliced by ApoE Genotype, Whole Exome Data Yield New AD Variants" ALZFORUM 2019-06-14. 背景 ApoEは299のアミノ酸で構成され、ApoE2、ApoE3、およびApoE4の3種類のアイソフォームがよく知られている。これらアイソフォー
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