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ブックマーク / bi.biopapyrus.jp (1)

  • BLAST | NCBI blast+ のインストールと設定 (Linux, Mac, Win)

    2020.04.15 blast は、入力配列と相同性(ホモロジー)のある配列を検索するツールの一つである。もう少し具体的に言えば、塩基配列あるいはアミノ酸配列が入力されると、blast はデータベースの中から、入力配列に似た配列を検索して出力してくれるツールである。データベースは、冗長性のない RefSeq 配列や特定の種(ヒトやマウス)の cDNA 配列から作る。また、独自に集めた配列もデータベース化することができる。blast に似た相同性検索ツールとして、FASTA や LAST などがある。 blast にはウェブ版とスタンドアローン版がある。ウェブ版は、NCBI Blast ウェブサイトで使用できる。入力配列を NCBI Blast ウェブサイトのフォームに貼り付けて、データベースを選べば、blast による検索が行われる。一方で、スタンドアローン版は、NCBI FTP レポジ

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