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ブックマーク / stats.biopapyrus.jp (2)

  • 生物統計学 | バイオスタティスティクス | 生物統計学

    生物統計学は生命科学に特化した統計学であり、生命科学における様々な現象の解決を試みる学問である。特に、バイオインフォマティクスの発展に伴い、生物統計学はこれまで以上に重要視されるようになった。 生物統計の分野では R や Python などのプログラミング言語がよく使われている。R には、様々な仮説検定手法やモデリング手法が標準実装され、さらにデータの視覚化機能なども多数用意されている。また、Python にも多様なデータ処理、データ分析およびデータの視覚化機能が実装されている。R は仮説検定・数理モデリングなどの統計に強いのに対して、Python は科学数値計算・機械学習などに強い。

  • R | R を利用した統計解析およびデータの視覚化

    2019.08.16 R は統計解析や視覚化などの機能を備えたプログラミング言語ないし統計解析環境である。統計解析の機能として、統計検定、線形回帰、時系列データ解析、クラスタリングなどがサポートされている。また、最新論文で発表されているような新しい手法も、R で実装されている場合が多い。特に、次世代シークエンサーに代表される分子生物学・バイオインフォマティクスの分野において R が使われる傾向がある。視覚化の機能として、ヒストグラム、棒グラフ、折れ線グラフ、散布図、樹形図やヒートマップなど基的なグラフが標準でサポートされている。その他に、ggplot2 などのパッケージを使用することで、さらに高レベルな図を簡単に作図できるようになる。

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