PyMolで3D PSAを計算しようとする話 - magattacaのブログ
先日の記事で、下記文献を例に3次元構造の指標であるRadius of gyrationについて取り上げました。 論文1) Solution Conformations Shed Light on PROTAC Cell Permeability Yoseph Atilaw, Vasanthanathan Poongavanam, Caroline Svensson Nilsson, Duy Nguyen, Anja Giese, Daniel Meibom, Mate Erdelyi, and Jan Kihlberg ACS Medicinal Chemistry Letters Article ASAP DOI: 10.1021/acsmedchemlett.0c00556 https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acsmedchemlett.0c00556
Macで独習！量子化学計算入門！！ 〜インストールでつまずいた話〜 - magattacaのブログ
電子書籍「独習 量子化学計算」を購入し、一通りポチポチ遊んでみました。 ゼロからわかる!! 独習 量子化学計算: 理論からはじめない新しい量子化学計算の本 作者:久我 涼子発売日: 2020/03/18メディア: Kindle版 「ゼロからわかる！！」の謳い文句の通り、ど素人でもソフトウェアを動かすことができ、とてもオススメです！ WindowsでもMacでも実践できるように解説してくださっているのですが、 私のMacではソフトウェアのインストールなど、環境構築でいくつかつまずきました。 備忘録としてメモを残します。 尚、本記事は以下の環境での事例です。 MacBook Pro 2017 macOS High Sierra version 10.13.6 プロセッサ名: Intel Core i5 コア数 ２ 書籍の紹介とオススメポイント Macで環境構築する際につまずいた点 Avogad
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