スペクトラルクラスタリングを試してみた - Qiita
スペクトラルクラスタリング いい機会だし先日投稿したスペクトラルクラスタリングとやらを実際にやってみたいと思います。ソースコードは再生産しても仕方がないのですぐる様のブログからパクってお借りします。 すぐる様のブログにあったコードはそのままではうまく動作しなかったのと、Jupyter notebook のお作法に従って少しコードを手直ししています。（そのまま実行するとGraph is not fully connected, spectral embedding may not work as expected.というwarningが表示されました。このwarningに関してもGitHubのissueに素晴らしい回答があるのですが読むのが面倒臭かったので@taki__taki__様のブログよりスペクトラルクラスタリングの実行部分のコードを1行だけお借りしました。また、%matplotlib
階層的クラスタリングと、任意の数のクラスタへの分割 - Qiita
2016年に作った資料を公開します。もう既にいろいろ古くなってる可能性が高いです。 （追記：新しい記事は 階層的クラスタリングとシルエット係数 をご覧ください。） 本実習では教師なし学習の一種である階層的クラスタリングを行ないます。 * 階層的クラスタリング とは何か、知らない人は下記リンク参照↓ * 階層的クラスタリングとは * クラスタリング (クラスター分析) まずはサンプルデータの取得から # URL によるリソースへのアクセスを提供するライブラリをインポートする。 import urllib # ウェブ上のリソースを指定する url = 'https://raw.githubusercontent.com/maskot1977/ipython_notebook/master/toydata/iris.txt' # 指定したURLからリソースをダウンロードし、名前をつける。 url
scipyのlinkage関数の結果について | 分析ノート
前回の記事の続きです。 参考:scipyで階層的クラスタリング 前回の記事で階層的クラスタリングを実行し可視化するところまで紹介しましたが、 今回は一歩戻ってlinkage関数の戻り値の中身を見てみます。 とりあえず、 linkage matrix をprintして結果を見てみましょう。 from sklearn.datasets import load_iris from scipy.cluster.hierarchy import linkage X = load_iris().data[::10, 2:4] print(X.shape) # (15, 2) # ユークリッド距離とウォード法を使用してクラスタリング z = linkage(X, metric='euclidean', method='ward') print(z.shape) # (14, 4) print(z) #
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