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ラボラトリーひとくちメモは、秀潤社・細胞工学編集部長（当時）の須摩春樹氏から"内容については任せるからTIP形式で毎月何かを書いてほしい"と言われ、1995年７月から2000年12月まで月刊誌細胞工学に連載したものです。最初の原稿に手をつけていたのががちょうど地下鉄サリン事件の直後であったことを覚えています。この原稿については編集部内でもいろいろと論議があったらしく、実際に誌面に載ったのは１２月号です。以前に実験プロトコールを作ったこともあって、当初は実験法を中心にする予定でした。この方針は連載を通じて基本的に踏襲しました。連載物における最大の欠点はマンネリ化とネタ切れですが、時々趣向を変えて退屈しないように工夫したつもりです。このファイルは、私のPCに長らく埋没していたもので、リンク切れなど未完成なところもありますが、ご容赦願います。21回目以降で内容をご覧になりたい方は大海までメールく
二次元電気泳動-原理
二段階の電気泳動によりタンパク質を二次元に分離する手法です。一般的に、一次元目は等電点電気泳動によりタンパク質を分離し、二次元目はSDS-PAGEにより分子量で分離します。いずれの手法も分離能が非常に高いので、細胞全タンパク質を数千以上にもおよぶスポットに分離することができます。プロテオーム解析において、二次元電気泳動手法は中心的な役割を担っており、再現性と解像度に優れた固定化pH勾配（Immobilized pH Gradient, IPG）法を一次元目泳動に用いることが一般的になっています。また、より多くのスポットを得るために、幅広いpHレンジの分離結果を基にしてNarrow pH IPGゲルで目的pH部分のみを分離したり、20 cm以上の大型ゲルを用いて二次元目電気泳動を行うこともあります。プロテオーム解析では、データの再現性と共にスループット（処理能力）も重要な課題です。多サンプル
ラボマニュアル
東京大学医学部生化学教室（細胞情報研究部門） ラボマニュアル 目次 蛋白・酵素編 分子生物学編 細胞機能編 細胞調整編 動物飼育編 RI・有機溶媒等取り扱い編 コンピュータ・インターネット編 これは我々で作成した実験用のラボマニュアルです。毎年改訂を進めてこの様な形になりました。ご自由に見ていただいて結構ですが、著作権は当研究室にあることをご了承下さい。これに従って実験を行われた方はもちろん、読まれただけの方も、ご意見、ご感想をぜひお聞かせ下さい。当然の事ですが、このマニュアルに従って行った実験の結果についての責任は負いかねますので、ご了承下さい。 教室員の方へお願い 実験した結果、改良点やコメントがあれば、ぜひ追加をお願いいたします。 TOP PAGE 蛋白・酵素編 蛋白精製法（清水） 蛋白定量法（横溝） SDS-PAGE（横溝） Beckman分光光度計（横溝） FPLC、HPLCの取
TITLE
１．［はじめに］ 現在、ＪＣＲＢ/ＨＳＲＲＢ細胞バンクから供給されている動物由来培養細胞は、単細胞として扱う事のできる細胞集団です。しかし、それらの細胞集団の起源となっている多細胞生物は、多種類の細胞が集まって機能を持つ臓器を作り、臓器は連携して有機的な生体を形成しています。従って培養細胞系は、クロン集団に近い物として実験に供される有利さがある一方、生体を構成している時と同等の機能発現や細胞同士の相互作用を必要とする実験には充分な実験材料とはいえない場合も多々あるでしょう。こうした点を理解した上で、利用者は細胞系の起源・培養の歴史・特徴を調べ、各々の研究目的に適した細胞系を選んで下さい。 本ホームページには、細胞の選択に役立つ参考書なども紹介しておりますので、そちらも参考にしてください．また、培地の発展の歴史や、現在使われている培地の一覧表なども掲載しておりますので合わせて参考にしてく
理科の時間に作った簡単な蒸留水ではなく，もの凄く高純度の純水が飲んでみたいです． そこで質問なのですが， ○水の純度はどこまで高める事が可能なのか？…
理科の時間に作った簡単な蒸留水ではなく，もの凄く高純度の純水が飲んでみたいです． そこで質問なのですが， ○水の純度はどこまで高める事が可能なのか？ ○高純度の水を飲むことで身体に影響はないか？ ○どうすれば高純度の水を飲む事が出来るのか？ について教えてください．
塩基配列解析
1. 塩基配列解析 1-1. Open Reading Frame (ORF) の検索 (ORF Finder) ゲノムの塩基配列が決定されただけでは、その機能についての情報は得られない。そこでまずタンパク質がどこにコードされているかを探索する必要がある。ORFは開始コドンから終止コドンまでの間がある程度の長さを持ち、タンパク質がコードされている可能性のある読み枠である。ここでは、ORF Finderを用いてORFの検索を行う。 例題塩基配列：大腸菌由来 RNase HI 遺伝子 4501 taaaaacaag ccacgaattc gccaggcggt tggagccacc cggcaatgtc gtaaaccaca 4561 ggcttaaact tcaacttggt agcctgtatc ttccagtgtg ggattcatcg ccgcggcacg 4621 agccagttca
DNAの相同性を調べたりする時に、 Geneticsとかを買えない貧乏な人達は http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/bl2seq/wblast2.cgi のblast 2 sequenceを使ったりす…
DNAの相同性を調べたりする時に、 Geneticsとかを買えない貧乏な人達は http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/bl2seq/wblast2.cgi のblast 2 sequenceを使ったりすると思いますが、 これでデフォルト値だと低い相同性は計算できません。 例えば、50アミノ酸あって、1-40だけが相同性を有していて、40-50はばらばらな場合、 このblast 2 sequenceのデフォルト値では、 1-40を比較した結果だけが出ます。 このプログラムを使って、とにかく相同性の低い領域も含めて、 指定した領域に関して、全体的な相同性を出すことはできないのでしょうか？
Matsubarase.com - 制限酵素ナビ
制限酵素ナビでは、以下のことができます。 制限酵素名から、切断パターン、バッファーの切断効率、各社製品の値段等を検索することができます。 認識配列の一部分や頭文字でも検索できます。 同じ制限酵素が複数の会社から売り出されている場合は、各社製品を比較することができます。 1μｇのDNAを切断するのに最低必要なunit数が自動で計算されます。 いちいち分厚いカタログをペラペラめくって調べるのって面倒じゃないですか？ 制限酵素ナビを使えば一瞬で検索できて便利。 どの会社の製品が一番安いかも簡単に分かります。
コドン - Wikipedia
mRNA分子に沿って一連のコドンを示している。各コドンは3ヌクレオチドからなり、一つのアミノ酸を指定している。 コドン（英: codon）とは、核酸の塩基配列が、タンパク質を構成するアミノ酸配列へと生体内で翻訳されるときの、各アミノ酸に対応する3つの塩基配列のことで、特に、mRNAの塩基配列を指す。DNAの配列において、ヌクレオチド3個の塩基の組み合わせであるトリプレットが、1個のアミノ酸を指定する対応関係が存在する。この関係は、遺伝暗号、遺伝コード（英: genetic code）等と呼ばれる。 ほぼ全ての遺伝子は厳密に同じコードを用いるから（#RNAコドン表を参照）、このコードは、しばしば基準遺伝コード（英: canonical genetic code）とか、標準遺伝コード（英: standard genetic code）、あるいは単に遺伝コードと呼ばれる。ただし、実際は変形コード
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164391 プラスミド描画 制限酵素ナビ 小物プログラム 作成中のソフト 備忘録 ★ New ★ 連絡先 Matsubarase.com へようこそ！ 自分が欲しいと思ったツールを作って公開しているサイトです。 主に分子生物学をやっているヒトに役立つと思います。 Menu プラスミド描画 ベクトル（SVG）形式でプラスミドを簡単に描画 制限酵素ナビ 制限酵素検索、ユニット数計算、製品番号・値段検索など 小物プログラム 機能を絞った軽量小物ソフト 作成中のソフト 現在作成中のソフトウェア 備忘録 暗記するほどでもないけれど、ときどき必要になる情報のまとめ 連絡先 管理人への連絡先 About this site 管理人は某大学院の博士課程で勉強中の学生です。 分野は分子生物学、基礎医学、生命科学といったところでしょうか。 ライブド
ポリメラーゼ連鎖反応 - Wikipedia
「PCR検査」はこの項目へ転送されています。新型コロナウイルス感染症および新型コロナウイルスに関する臨床検査については「COVID-19の検査」をご覧ください。 100μLの反応混合物が入っている8連PCRチューブ 卓上型PCR装置 ポリメラーゼ連鎖反応（ポリメラーゼれんさはんのう、英語: polymerase chain reaction）とは、DNAサンプルの特定領域を増幅させる反応。 一般的には数百万〜数十億倍に増幅する。英語読みもされるが、その頭文字を取ってPCR法、あるいは単純にPCRと呼ばれることが多い[1][2]。 解説[編集] DNAポリメラーゼと呼ばれる酵素の働きを利用して、一連の温度変化のサイクルを経て任意の遺伝子領域やゲノム領域のコピーを指数関数的に増幅することで、少量のDNAサンプルからその詳細を解析するに十分な量にまで増幅することが目的である[3][4][5]。医
相補的DNA - Wikipedia
相補的DNA（そうほてきDNA、complementary DNA）は、mRNA から逆転写酵素を用いた逆転写反応によって合成された二本鎖 DNA。一般には「相補的」を意味する英語、complementary の頭文字をとって、cDNA と省略される。遺伝子の上でタンパク質に翻訳される領域の配列が開始コドンから終止コドンまで一続きに含まれているため、タンパク質の一次構造（アミノ酸配列）を解明する出発点として、また人工的にタンパク質を発現させる目的でも単離される。 ヒトを始めとする真核生物では、遺伝子はゲノム上にコードされているものの、多くはそこから転写された mRNA前駆体がスプライシングを受けてイントロンが除去されるまでは蛋白質に翻訳されない情報も含んでいる。 そこで、スプライシング済みの成熟mRNA から cDNA を合成すればイントロンを含まない状態の遺伝子（塩基配列）を知ることがで
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http://cellbank.nibio.go.jp/information/history/takaoka/documents/medkoten6.htm
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