Chemviz2を使い始めたのでメモ インストール Cytoscapeのサイトから3.xの最新バージョンをダウンロードしてインストール Apps -> App ManagerからChemviz2を探してインストール 使ってみる pychembldbを使ってノード用の属性ファイルとnetworkファイルを作った。ネットワークはとりあえずランダムにつないでみた。 Cytoscapeを起動して"network.sif"をインポート。続いてテーブルファイルとして"node.csv"をimport プライマリキーはsmilesにする。 構造描画の設定はApps -> Chemoinformatics Tools -> SettingsでSmiles Attributesをnode.shared.nameを選んでおく。 構造描画するときには右クリックしてオプションダイアログのApps -> Chemi
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