式が書ければ「京」が使える | 理化学研究所
要旨 理化学研究所（理研）計算科学研究機構コデザイン推進チームの村主崇行特別研究員らと、千葉大学の堀田英之特任助教、神戸大学の牧野淳一郎教授、京都大学の細野七月特任助教、富士通株式会社の井上晃マネージャーらの共同研究グループ※は、スーパーコンピュータ「京（けい）」[1]を用いて、数式のような簡潔な指示を書くだけでスーパーコンピュータでの計算に必要となる高度なプログラムを自動生成できるプログラミング言語「Formura」を開発しました。 スーパーコンピュータでの計算に必要となるプログラムはときに数十万行にも及び、作成やチューニングは大変困難です。一方で、原理的にはシミュレーションしたい自然現象とその離散化法[2]を指定すれば、プログラムは機械的に生成できます。しかし、プログラミングはシミュレーションとコンピュータ双方に深い知識が必要となる非常に高度な作業であり、多数の計算機を協調して動作させ
WWW.HPCC.JP
Welcome to the www.hpcc.jp conference and paper services web page related to high-performance and advanced computing systems. Journal paper IPSJ Transactions on Advanced Computing Systems Conference and workshop SACSIS - Symposium on Advanced Computing Systems and Infrastructures HPCS - High Performance Computing Symposium HPC Asia 2004 - 7th International Conference on High Performance Computing
SACSIS.TCP - HPCユーザが知っておきたいTCP/IPの話
HPC TCP/IP 2009 5 29 SACSIS2009 HPC TCP/IP 2 • • 1 Gbps RTT 100 • 240 Mbps ☹ • 940 Mbps ☺ (2) HPC TCP/IP • Ethernet PC • TCP/IP 2 10MB 3 0 200 400 600 800 1000 0 100 200 300 400 500 600 Bandwidth (Mbps) Time (msec) 160 0 200 400 600 800 1000 0 100 200 300 400 500 600 Bandwidth (Mbps) Time (msec) x3.5 (2) • TCP/IP • • MPI • TCP/IP TCP • TCP Reno [RFC2851] • TCP CUBIC Compound TCP 4 (3) • TCP/IP • T
大規模プライベートクラウドを作成するときの注意事項
■ 1000台を超えるプライベートクラウドの作成方法 まず、1ホストで、1000台を超える規模のプライベートクラウドを設置する場合、HPCと呼ばれる（Hi Performance Computer）と呼ばれる、通常お目にかかることの出来ないシステムを用意する必要がある。通常のサーバーでも出来なくは無いが、かなり注意して構築しなければ、すぐにシステムが破綻してしまうだろう。 ■ 構成の要 ストレージについて まず、ディスクにはそれぞれDisk I/Oキャッシュと呼ばれる、書き込み時に情報を蓄えておくメモリが存在する。しかしながら、このメモリは、単一のコンピューターが使用するのであれば問題ないが、1000台ものVMが一斉にアクセスした場合、一瞬で枯渇してしまう。通常のディスクの場合、多くても、128Mバイト程度しかこれを有していない。また、ディスクRaidを構成している場合に於いても、搭載して
NVIDIAの「Tegra」プロセッサ、初めてスーパーコンピュータに採用へ
NVIDIA製のARMプロセッサ「Tegra」が初めてスーパーコンピュータに採用されることになった。これは、ARMプロセッサがIntelの領分にまで入り込みつつある新たな証拠と言える動きだ。 NVIDIAは米国時間11月14日、Barcelona Supercomputing Center（BSC）が、ARMアーキテクチャベースのエネルギー効率に優れたTegraプロセッサをNVIDIA製GPUと組み合わせた初のハイブリッドスーパーコンピュータを開発すると発表した。 BSCでは、現時点で効率とパフォーマンスが高いとされるコンピューティングシステムより2～5倍エネルギー効率に優れたシステムの開発を計画しているという。既存のスーパーコンピュータのほとんどは、Intel製プロセッサを使用している。 BSCで「Mont-Blanc」プロジェクトの責任者を務めるAlex Ramirez氏は、声明の中で
グスタフソンの法則 - Wikipedia
グスタフソンの法則（英: Gustafson's law、Gustafson-Barsis' law としても知られる）は、計算機工学における法則で、「十分に大きな規模の問題は、効率的に並列化して解くことができる」事を示すものである。グスタフソンの法則は、並列化によってプログラムが高速化できる限界を示したアムダールの法則と密接に関係している。本法則は、ジョン・グスタフソンによって1988年に初めて示された。 P がプロセッサの数であり、S がSpeedup、α がプロセスの並列化できない部分であるとすると、下記が成立する。 グスタフソンの法則は、計算機の規模が大きくなると利用可能な計算能力を使い切るほど性能がスケールしないというアムダールの法則に欠けていた部分に対応するものである。グスタフソンの法則では、問題の規模が固定である、また並列プロセッサ上の計算の負荷が一定であるという仮定を取り除
アムダールの法則 - Wikipedia
複数のプロセッサを使って並列計算してプログラムの高速化を図る場合、そのプログラムの逐次的部分は、制限を受ける。例えば、仮にプログラムの95%を並列化できたとしても、残りの部分である5%は並列処理ができないため、どれだけプロセッサ数を増やしたとしても、図で示したように20倍以上には高速化しない。 アムダールの法則（アムダールのほうそく、英語: Amdahl's law）は、ある計算機システムとその対象とする計算についてのモデルにおいて、その計算機の並列度を上げた場合に、並列化できない部分の存在、特にその割合が「ボトルネック」となることを示した法則である。コンピュータ・アーキテクトのジーン・アムダールが主張したものであり、アムダールの主張（アムダールのしゅちょう、英語: Amdahl's argument）という呼称もある[1]。 複数のプロセッサを使い並列計算によってプログラムの高速化を図る
【レポート】Blue Watersがこけても問題なし - 次世代機の開発が進む米国のスパコン事情 | エンタープライズ | マイコミジャーナル
先般のIBMがBlue Watersプロジェクトから撤退というレポートを見て、これで日本の「京」のトップはしばらく安泰と思った人が多くいるようであるが、米国のスーパーコンピュータ(スパコン)開発はBlue Watersがこけても次の矢がある。 その1つは、オークリッジ国立研究所(ORNL)の「Jaguar」の「Titan」へのアップグレード、もう1つは、ローレンスリバモア国立研究所(LLNL)がIBMと開発を行っている「Sequoia」である。Titanはギリシャ神話に出てくる巨人族の名前であり、Sequoiaは米国を代表する巨木の名前である。 CPU+GPU構成で20PFlopsを狙うTitan オークリッジ国立研究所のJaguarシステムは、CrayのXT5ベースのシステムで2010年6月のランキングまではTop500の1位であり、「京」が1位になった2011年6月のランキングでも3位
【レポート】ポスト「京」コンピュータはどうなるのか (1) 次世代スパコンの開発開始で米国に遅れをとっている日本 | エンタープライズ | マイコミジャーナル
先日、「京」コンピュータが8.162PFlopsを達成し、中国の天河1Aに3倍以上の差をつけてTOP500の1位になったばかりで、ポスト「京」コンピュータは気が早すぎると思われるかもしれないが、そんなことはない。 もちろん、先日の某紙の指摘のようなTOP500の1位にそれほどの意味は無く、いかに役立つ成果を上げるかが重要ということは関係者は十分承知しており、各アプリケーションの開発グループは「京」の使用にむけてアプリケーションの準備に余念がない状況である。 しかし、次のスパコンについても並行して考えていかなければならない。図1にTOP500の1位と500位のスパコンの性能とTOP500全部(500システム)のスパコンの性能の合計の年次推移のグラフを示す。 図1 TOP500 合計および1位と500位の性能推移(出典:TOP500 Webサイト) 一番上のTOP500合計のラインと一番下の5
Japan Reclaims Top Ranking on Latest TOP500 List of World’s Supercomputers | TOP500 Supercomputing Sites
Anyone can build a fast CPU. The trick is to build a fast system. Seymour Cray Contact: Erich Strohmaier, EStrohmaier@lbl.gov, 510-495-2517 HAMBURG, Germany—A Japanese supercomputer capable of performing more than 8 quadrillion calculations per second (petaflop/s) is the new number one system in the world, putting Japan back in the top spot for the first time since the Earth Simulator was dethrone
ベクトル型スパコンの存在意義――地球シミュレータのいま
2002年、当時スーパーコンピュータの主流であったベクトル型計算機において世界最高の処理速度を実現したのが、海洋科学技術センター（現・海洋研究開発機構）が運営する「地球シミュレータ」であった。その後スーパーコンピュータの世界では、価格対性能の高さを特徴とするスカラー型計算機が台頭し、さらにはGPGPU型計算機も注目されるようになった。 実力は今なお健在 ベクトル型計算機は、その存在感が年々薄まりつつあるような印象があるが、現在でも本来の利用目的である大規模シミュレーションなどの分野では数多くの成果を生み出し、決して無用な存在とはなっていない。海洋研究開発機構 地球シミュレータセンターの渡邉國彦センター長（理学博士）に、地球シミュレータでの取り組みとベクトル型計算機の活路について聞いた。 海洋研究開発機構が運用する現在の地球シミュレータは、2009年3月に更新した2代目（ES2）となる。NE
｢スカラー･チューニング講習会｣と｢並列プログラミング(MPI)講習会｣で配布したテキスト｜HPC High Performance Computing｜ACCC. RIKEN
（2009年7月21日更新） 注意 原稿をイメージデータとして読み込んでPDFファイル化したため ､ サイズが大きくなっています。 全ページを含むファイルと ､ 章(またはいくつかの節)ごとに分割したファイルの2種類があります（内容は同じです）。 テキストの内容は今後不定期に加筆修正します ｡ ファイル名の末尾についている ｢20xx-xx-xx ｣ は、そのファイル内のページが最後に更新された日付を示します ｡ 簡易製本する際は ､i, iii, vページ(vは(2)のみ) ､ および本文の奇数ページ(例えば1-1,1-3, ･ ･ ･,2-1,2-3, ･ ･ ･)が ､ 見開きした右側のページになるようにして下さい ｡ 下記資料に関するお問い合わせは までご連絡下さい ｡ (1) 「チューニング技法入門」(旧「チューニング技法虎の巻」) 「スカラー・チューニング講習会」 で配
【レポート】次世代スパコンのあり方をどう考えるべきか (1) スパコンの何が重要なのか | エンタープライズ | マイコミジャーナル
なぜ、スパコンが必要なのか? 2009年11月に開催されたSC09という学会で、米国のゴア元副大統領はその基調講演のなかで、CO2の増加が環境に与える影響は人々が直感的に感じられる危機ではなく、スーパーコンピュータ(スパコン)によるシミュレーションと可視化によって始めて重大な危機であることが認識され、政治が動くようになった。これはスパコンの大きな意義であると述べた。早くに危機に気付き、手を打つことにより、より良い地球を子孫に残せるという。このような温暖化の解析には、日本の地球シミュレータが大きな役割を果たしたことは記憶に新しい。 現在では、このようなシミュレーションの力は、理論と実験に加えて、科学を支える第3の柱と認識されている。スパコンによるシミュレーションは、天気予報のような身近なものから、自動車の衝突解析や、航空機などのまわりの気流の解析、騒音の発生の解析など直接産業的開発に利用でき
Open MPI: Open Source High Performance Computing
A High Performance Message Passing Library The Open MPI Project is an open source Message Passing Interface implementation that is developed and maintained by a consortium of academic, research, and industry partners. Open MPI is therefore able to combine the expertise, technologies, and resources from all across the High Performance Computing community in order to build the best MPI library avail
MPI Forum
This website contains information about the activities of the MPI Forum, which is the standardization forum for the Message Passing Interface (MPI). You may find standard documents, information about the activities of the MPI forum, and links to comment on the MPI Document using the navigation at the top of the page. Link to the central MPI-Forum GitHub Presence Current Efforts The MPI Forum is cu
Message Passing Interface
Quick Access MPI Forum MPI Standard 1.1 MPI Standard 2.0 in HTML MPICH Home Page ANL/MSU MPI implementation Download MPICH Free implementation of MPI MPICH2 Home Page ANL MPI implementation Download MPICH2 Free implementation of MPI MPI Home Page Remove Frames What is MPI? MPI is a library specification for message-passing, proposed as a standard by a broadly based committee of vendors, implemento
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【.biz 】 AMD、12GB VRAM搭載のスパコン向けビデオカード
http://jun-makino.sakura.ne.jp/talks/nagoya20120126.pdf
TOP500 List - June 2011 | TOP500 Supercomputer Sites
http://japan.internet.com/webtech/20110317/12.html